Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Gm22980-201ENSMUST00000082608 70 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PtpreP49446 Traj13-201ENSMUST00000103728 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.22□□□□□ -2.21
PtpreP49446 Gm25522-201ENSMUST00000158394 105 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PtpreP49446 Gm24678-201ENSMUST00000158756 104 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PtpreP49446 Snord67-201ENSMUST00000104033 111 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PtpreP49446 Gm22469-201ENSMUST00000104118 133 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PtpreP49446 Gm44345-201ENSMUST00000199560 135 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PtpreP49446 Vmn1r75-202ENSMUST00000226622 6638 ntAPPRIS P2 BASIC1.21□□□□□ -2.22
PtpreP49446 Mir6381-201ENSMUST00000183426 87 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PtpreP49446 Mir27b-201ENSMUST00000083541 73 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PtpreP49446 Gm10974-201ENSMUST00000107486 126 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
PtpreP49446 Gm22302-201ENSMUST00000082657 106 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PtpreP49446 Mir695-201ENSMUST00000102261 109 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PtpreP49446 Mir1904-201ENSMUST00000122702 80 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PtpreP49446 Mir7091-201ENSMUST00000184075 79 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PtpreP49446 Gm26484-201ENSMUST00000158018 106 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PtpreP49446 Mir22-201ENSMUST00000083595 95 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PtpreP49446 Snord35a-201ENSMUST00000083884 90 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PtpreP49446 Gm23787-201ENSMUST00000122538 73 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PtpreP49446 Gm22431-201ENSMUST00000158545 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PtpreP49446 Mir363-201ENSMUST00000093598 75 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PtpreP49446 Gm8251-201ENSMUST00000168641 5985 ntAPPRIS P1 BASIC1.14□□□□□ -2.23
PtpreP49446 Gm25779-201ENSMUST00000116710 95 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PtpreP49446 Gm23173-201ENSMUST00000157161 160 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PtpreP49446 Gm24884-201ENSMUST00000158784 119 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PtpreP49446 Gm23008-201ENSMUST00000158946 80 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PtpreP49446 Gm27289-201ENSMUST00000183341 82 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PtpreP49446 Gm25787-201ENSMUST00000104709 92 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PtpreP49446 Gm24777-201ENSMUST00000157644 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PtpreP49446 Gm44457-201ENSMUST00000198109 76 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PtpreP49446 Snord33-201ENSMUST00000083694 84 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PtpreP49446 Gm24258-201ENSMUST00000083739 133 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PtpreP49446 Gm25408-201ENSMUST00000104104 133 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PtpreP49446 CT009723.2-201ENSMUST00000215702 124 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
PtpreP49446 Gm25378-201ENSMUST00000104333 129 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PtpreP49446 Gm24020-201ENSMUST00000180156 108 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PtpreP49446 Mir6389-201ENSMUST00000183661 102 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PtpreP49446 Gm44803-201ENSMUST00000204384 156 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PtpreP49446 Mir6380-201ENSMUST00000184334 81 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PtpreP49446 Gm22981-201ENSMUST00000082611 75 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PtpreP49446 n-R5s96-201ENSMUST00000082574 124 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PtpreP49446 Gm21961-201ENSMUST00000110100 114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
PtpreP49446 Mir362-201ENSMUST00000093592 65 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PtpreP49446 Mir670-201ENSMUST00000102380 100 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PtpreP49446 Gm25161-201ENSMUST00000158913 132 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PtpreP49446 AC161271.1-201ENSMUST00000226914 150 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PtpreP49446 Mir18-201ENSMUST00000083469 96 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PtpreP49446 Gm24579-201ENSMUST00000103964 144 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PtpreP49446 AC124196.2-201ENSMUST00000224835 145 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PtpreP49446 Gm25683-201ENSMUST00000083940 131 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PtpreP49446 Gm24431-201ENSMUST00000104073 66 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PtpreP49446 Mir7079-201ENSMUST00000184697 69 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PtpreP49446 Gm13577-201ENSMUST00000121365 205 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PtpreP49446 Mir1955-201ENSMUST00000158014 98 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PtpreP49446 Gm27798-201ENSMUST00000184989 71 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PtpreP49446 Mir7065-201ENSMUST00000185110 61 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PtpreP49446 Gm22879-201ENSMUST00000082895 74 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PtpreP49446 Gm23783-201ENSMUST00000157941 102 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PtpreP49446 Gm45617-201ENSMUST00000211132 209 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PtpreP49446 mt-Tm-201ENSMUST00000082395 69 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PtpreP49446 Gm23126-201ENSMUST00000104260 134 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PtpreP49446 9230110F11Rik-202ENSMUST00000212907 191 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
PtpreP49446 Gm24459-201ENSMUST00000082730 86 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PtpreP49446 Gm37750-201ENSMUST00000193563 129 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PtpreP49446 Mir219b-201ENSMUST00000198317 65 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PtpreP49446 Gm44301-201ENSMUST00000200362 143 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PtpreP49446 Mir142b-201ENSMUST00000083486 115 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PtpreP49446 Mir3109-201ENSMUST00000175301 88 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PtpreP49446 Gm24323-201ENSMUST00000175342 77 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PtpreP49446 Mir3065-201ENSMUST00000198674 87 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PtpreP49446 Gm23240-201ENSMUST00000083009 121 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PtpreP49446 Gm23321-201ENSMUST00000104465 126 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
PtpreP49446 Gm37832-201ENSMUST00000118935 189 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
PtpreP49446 Gm45741-201ENSMUST00000212661 152 ntTSL 1 (best) BASIC0.9□□□□□ -2.27
PtpreP49446 Gm22301-201ENSMUST00000082656 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
PtpreP49446 Gm23969-201ENSMUST00000083324 74 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
PtpreP49446 Gm22239-201ENSMUST00000175220 103 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PtpreP49446 Gm23483-201ENSMUST00000104179 108 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PtpreP49446 Gm22689-201ENSMUST00000102452 110 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PtpreP49446 Mir224-201ENSMUST00000083608 82 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PtpreP49446 Gm22335-201ENSMUST00000157724 99 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PtpreP49446 Gm22157-201ENSMUST00000158410 104 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PtpreP49446 Gm45541-201ENSMUST00000210443 54 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PtpreP49446 Gm22340-201ENSMUST00000157717 114 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PtpreP49446 Gm20386-201ENSMUST00000174010 132 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PtpreP49446 Gm24445-201ENSMUST00000083981 107 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PtpreP49446 Gm24651-201ENSMUST00000157107 107 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PtpreP49446 Gm25158-201ENSMUST00000177681 121 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PtpreP49446 Gm26229-201ENSMUST00000179699 121 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PtpreP49446 Gm22260-201ENSMUST00000178643 107 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
PtpreP49446 Gm38113-201ENSMUST00000193704 201 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
PtpreP49446 Gm23735-201ENSMUST00000082551 134 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
PtpreP49446 Mir125b-1-201ENSMUST00000175613 77 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PtpreP49446 Gm25132-201ENSMUST00000082652 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PtpreP49446 Gm27749-201ENSMUST00000183651 125 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PtpreP49446 Mir1948-201ENSMUST00000157325 85 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
PtpreP49446 Gm38208-201ENSMUST00000192476 114 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
PtpreP49446 Gm26285-201ENSMUST00000177923 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
PtpreP49446 Gm23622-201ENSMUST00000082460 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
PtpreP49446 Gm22838-201ENSMUST00000158437 99 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
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