Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 AC158537.2-201ENSMUST00000223575 150 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
Ccl20O89093 Gm26233-201ENSMUST00000175530 70 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
Ccl20O89093 Gm19248-201ENSMUST00000209404 110 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
Ccl20O89093 Gm23690-201ENSMUST00000083036 94 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
Ccl20O89093 Gm23468-201ENSMUST00000157125 108 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
Ccl20O89093 Gm26466-201ENSMUST00000179615 79 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
Ccl20O89093 Gm27554-201ENSMUST00000185074 98 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
Ccl20O89093 Gm26131-201ENSMUST00000082725 110 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
Ccl20O89093 Gm22595-201ENSMUST00000104250 130 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
Ccl20O89093 Gm24605-201ENSMUST00000104772 96 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
Ccl20O89093 Gm23349-201ENSMUST00000158432 98 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
Ccl20O89093 Gm27884-201ENSMUST00000183865 76 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
Ccl20O89093 Gm22305-201ENSMUST00000082690 108 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
Ccl20O89093 Gm23904-201ENSMUST00000157567 124 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
Ccl20O89093 Gm24701-201ENSMUST00000101946 105 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
Ccl20O89093 Gm23607-201ENSMUST00000104550 126 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
Ccl20O89093 Gm23831-201ENSMUST00000158895 85 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
Ccl20O89093 Mir3083-201ENSMUST00000175377 64 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
Ccl20O89093 Gm23369-201ENSMUST00000175406 105 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
Ccl20O89093 Gm26499-201ENSMUST00000178544 79 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
Ccl20O89093 Gm26096-201ENSMUST00000179084 79 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
Ccl20O89093 Mir136-201ENSMUST00000199494 62 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
Ccl20O89093 Gm23347-201ENSMUST00000083823 82 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
Ccl20O89093 Mir702-201ENSMUST00000102285 109 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
Ccl20O89093 Gm25289-201ENSMUST00000122799 119 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
Ccl20O89093 Gm24199-201ENSMUST00000157808 136 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
Ccl20O89093 Gm24108-201ENSMUST00000175495 77 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
Ccl20O89093 Gm27415-201ENSMUST00000183720 95 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
Ccl20O89093 AC160962.3-201ENSMUST00000225914 112 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
Ccl20O89093 Mir302c-201ENSMUST00000083548 68 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
Ccl20O89093 Gm24445-201ENSMUST00000083981 107 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
Ccl20O89093 Gm24234-201ENSMUST00000104316 107 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
Ccl20O89093 Gm23173-201ENSMUST00000157161 160 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
Ccl20O89093 Gm23306-201ENSMUST00000179058 105 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
Ccl20O89093 Gm27798-201ENSMUST00000184989 71 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
Ccl20O89093 Gm22458-201ENSMUST00000082576 107 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
Ccl20O89093 Gm22213-201ENSMUST00000157564 119 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
Ccl20O89093 Gm24400-201ENSMUST00000157865 107 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
Ccl20O89093 Mir669m-1-201ENSMUST00000158945 98 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
Ccl20O89093 Mir6961-201ENSMUST00000183874 67 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
Ccl20O89093 Gm25225-201ENSMUST00000158197 102 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
Ccl20O89093 Gm25798-201ENSMUST00000082641 107 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
Ccl20O89093 Gm23244-201ENSMUST00000083375 92 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
Ccl20O89093 Gm24704-201ENSMUST00000093715 107 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
Ccl20O89093 Gm22938-201ENSMUST00000103956 120 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
Ccl20O89093 Gm25712-201ENSMUST00000158634 93 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
Ccl20O89093 Mir6957-201ENSMUST00000183708 64 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
Ccl20O89093 Mir7057-201ENSMUST00000184685 58 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
Ccl20O89093 Gm25542-201ENSMUST00000116889 94 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
Ccl20O89093 Gm23644-201ENSMUST00000157856 77 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
Ccl20O89093 Gm22539-201ENSMUST00000158167 117 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
Ccl20O89093 Gm25497-201ENSMUST00000104425 132 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
Ccl20O89093 Mir1948-201ENSMUST00000157325 85 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
Ccl20O89093 Gm44589-201ENSMUST00000207025 115 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
Ccl20O89093 Gm24148-201ENSMUST00000082762 80 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
Ccl20O89093 Gm23240-201ENSMUST00000083009 121 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
Ccl20O89093 Gm11084-201ENSMUST00000112062 69 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-1.11□□□□□ -2.59
Ccl20O89093 Gm24946-201ENSMUST00000158332 106 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
Ccl20O89093 Mir1839-201ENSMUST00000175366 127 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
Ccl20O89093 Gm25380-201ENSMUST00000175463 107 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
Ccl20O89093 Gm24641-201ENSMUST00000178055 107 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
Ccl20O89093 Gm25484-201ENSMUST00000178217 107 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
Ccl20O89093 Gm26138-201ENSMUST00000179236 107 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
Ccl20O89093 Gm22821-201ENSMUST00000179288 107 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
Ccl20O89093 Gm23298-201ENSMUST00000083181 107 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
Ccl20O89093 Gm24614-201ENSMUST00000083269 107 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
Ccl20O89093 Gm22057-201ENSMUST00000083387 107 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
Ccl20O89093 Gm25516-201ENSMUST00000083857 107 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
Ccl20O89093 Snord16a-201ENSMUST00000083895 99 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
Ccl20O89093 Gm22354-201ENSMUST00000083919 70 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
Ccl20O89093 Gm25417-201ENSMUST00000104212 131 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
Ccl20O89093 Gm23308-201ENSMUST00000179475 107 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
Ccl20O89093 Gm25644-201ENSMUST00000083209 107 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
Ccl20O89093 Gm24650-201ENSMUST00000157105 103 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
Ccl20O89093 Gm23166-201ENSMUST00000157164 101 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
Ccl20O89093 Gm25428-201ENSMUST00000157608 114 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
Ccl20O89093 Gm23072-201ENSMUST00000158243 123 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
Ccl20O89093 Gm44490-201ENSMUST00000198566 127 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
Ccl20O89093 9230110F11Rik-202ENSMUST00000212907 191 ntTSL 5 BASIC-1.14□□□□□ -2.59
Ccl20O89093 Gm25854-201ENSMUST00000082792 72 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
Ccl20O89093 Gm25740-201ENSMUST00000180247 107 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
Ccl20O89093 n-R5s96-201ENSMUST00000082574 124 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
Ccl20O89093 Gm22381-201ENSMUST00000158186 107 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
Ccl20O89093 Gm21836-201ENSMUST00000178787 63 ntAPPRIS P1 BASIC-1.16□□□□□ -2.6
Ccl20O89093 Trgj1-201ENSMUST00000200495 60 ntAPPRIS P1 BASIC-1.16□□□□□ -2.6
Ccl20O89093 Gm25987-201ENSMUST00000083234 107 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
Ccl20O89093 Gm25061-201ENSMUST00000104665 107 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
Ccl20O89093 Gm11333-201ENSMUST00000119479 148 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
Ccl20O89093 Snord49b-201ENSMUST00000082503 72 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
Ccl20O89093 Gm23199-201ENSMUST00000158812 107 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
Ccl20O89093 Gm23630-201ENSMUST00000175292 104 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
Ccl20O89093 Gm25158-201ENSMUST00000177681 121 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
Ccl20O89093 Gm26229-201ENSMUST00000179699 121 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
Ccl20O89093 Gm24988-201ENSMUST00000104460 121 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
Ccl20O89093 Gm23909-201ENSMUST00000104598 131 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
Ccl20O89093 Gm22489-201ENSMUST00000116813 62 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
Ccl20O89093 Mir7231-201ENSMUST00000196252 61 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
Ccl20O89093 Gm25815-201ENSMUST00000082755 107 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
Ccl20O89093 Gm22729-201ENSMUST00000158088 129 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
Ccl20O89093 CT030170.1-201ENSMUST00000222183 148 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 137.4 ms