Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKQ4

Irx5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx5Q9JKQ4 Gm24165-201ENSMUST00000082718 128 ntBASIC2,05□□□□□ -2,08
Irx5Q9JKQ4 Gm6272-201ENSMUST00000121256 171 ntBASIC2,04□□□□□ -2,08
Irx5Q9JKQ4 Scarna3b-201ENSMUST00000157533 139 ntBASIC2,04□□□□□ -2,08
Irx5Q9JKQ4 Mir148b-201ENSMUST00000083626 97 ntBASIC2,04□□□□□ -2,08
Irx5Q9JKQ4 Gm23328-201ENSMUST00000157418 132 ntBASIC2,03□□□□□ -2,08
Irx5Q9JKQ4 Mir7079-201ENSMUST00000184697 69 ntBASIC2,03□□□□□ -2,08
Irx5Q9JKQ4 Mir6950-201ENSMUST00000184438 73 ntBASIC2,02□□□□□ -2,09
Irx5Q9JKQ4 AC117232.1-201ENSMUST00000197964 119 ntBASIC2,02□□□□□ -2,09
Irx5Q9JKQ4 Gm22603-201ENSMUST00000157603 96 ntBASIC2,01□□□□□ -2,09
Irx5Q9JKQ4 Gm23783-201ENSMUST00000157941 102 ntBASIC2,01□□□□□ -2,09
Irx5Q9JKQ4 Snora62-201ENSMUST00000082991 149 ntBASIC2,01□□□□□ -2,09
Irx5Q9JKQ4 Mir500-201ENSMUST00000093600 92 ntBASIC2,01□□□□□ -2,09
Irx5Q9JKQ4 Zfp654-201ENSMUST00000052588 4741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2,09
Irx5Q9JKQ4 Gm22785-201ENSMUST00000104087 132 ntBASIC2□□□□□ -2,09
Irx5Q9JKQ4 Gm22340-201ENSMUST00000157717 114 ntBASIC2□□□□□ -2,09
Irx5Q9JKQ4 Gm22542-201ENSMUST00000158166 95 ntBASIC2□□□□□ -2,09
Irx5Q9JKQ4 Gm22520-201ENSMUST00000158269 129 ntBASIC2□□□□□ -2,09
Irx5Q9JKQ4 Gm23020-201ENSMUST00000158766 253 ntBASIC2□□□□□ -2,09
Irx5Q9JKQ4 Mir344d-3-201ENSMUST00000175458 80 ntBASIC2□□□□□ -2,09
Irx5Q9JKQ4 Gm27587-201ENSMUST00000185116 163 ntBASIC2□□□□□ -2,09
Irx5Q9JKQ4 AC139186.1-201ENSMUST00000197610 94 ntBASIC2□□□□□ -2,09
Irx5Q9JKQ4 Gm25968-201ENSMUST00000157167 100 ntBASIC1,99□□□□□ -2,09
Irx5Q9JKQ4 Gm24222-201ENSMUST00000158834 93 ntBASIC1,99□□□□□ -2,09
Irx5Q9JKQ4 Gm25035-201ENSMUST00000175414 77 ntBASIC1,99□□□□□ -2,09
Irx5Q9JKQ4 Gm42845-201ENSMUST00000197766 105 ntBASIC1,99□□□□□ -2,09
Irx5Q9JKQ4 Mir343-201ENSMUST00000102360 75 ntBASIC1,98□□□□□ -2,09
Irx5Q9JKQ4 Gm15115-201ENSMUST00000121145 264 ntBASIC1,98□□□□□ -2,09
Irx5Q9JKQ4 AC161271.1-201ENSMUST00000226914 150 ntBASIC1,98□□□□□ -2,09
Irx5Q9JKQ4 Gm24500-201ENSMUST00000158447 124 ntBASIC1,97□□□□□ -2,09
Irx5Q9JKQ4 Gm25658-201ENSMUST00000158472 128 ntBASIC1,97□□□□□ -2,09
Irx5Q9JKQ4 Mir873a-201ENSMUST00000104863 77 ntBASIC1,96□□□□□ -2,1
Irx5Q9JKQ4 Gm23989-201ENSMUST00000117030 66 ntBASIC1,96□□□□□ -2,1
Irx5Q9JKQ4 Mir223-201ENSMUST00000102112 110 ntBASIC1,95□□□□□ -2,1
Irx5Q9JKQ4 Gm21961-201ENSMUST00000110100 114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1,95□□□□□ -2,1
Irx5Q9JKQ4 Gm22164-201ENSMUST00000158413 106 ntBASIC1,95□□□□□ -2,1
Irx5Q9JKQ4 Gm23342-201ENSMUST00000158958 115 ntBASIC1,95□□□□□ -2,1
Irx5Q9JKQ4 Gm38323-201ENSMUST00000192450 210 ntBASIC1,95□□□□□ -2,1
Irx5Q9JKQ4 Gm23173-201ENSMUST00000157161 160 ntBASIC1,94□□□□□ -2,1
Irx5Q9JKQ4 Mir7016-201ENSMUST00000184308 72 ntBASIC1,94□□□□□ -2,1
Irx5Q9JKQ4 AC125190.3-201ENSMUST00000223224 121 ntBASIC1,94□□□□□ -2,1
Irx5Q9JKQ4 Gm24942-201ENSMUST00000158328 114 ntBASIC1,93□□□□□ -2,1
Irx5Q9JKQ4 AC144671.1-201ENSMUST00000215265 99 ntBASIC1,93□□□□□ -2,1
Irx5Q9JKQ4 Mir10b-201ENSMUST00000083566 68 ntBASIC1,93□□□□□ -2,1
Irx5Q9JKQ4 Olfr1253-204ENSMUST00000215988 6332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1,92□□□□□ -2,1
Irx5Q9JKQ4 Gm21954-201ENSMUST00000179544 51 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1,91□□□□□ -2,1
Irx5Q9JKQ4 Gm27420-201ENSMUST00000183823 79 ntBASIC1,91□□□□□ -2,1
Irx5Q9JKQ4 mt-Tw-201ENSMUST00000082397 67 ntBASIC1,91□□□□□ -2,1
Irx5Q9JKQ4 Arhgap5-204ENSMUST00000219443 9323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1,91□□□□□ -2,1
Irx5Q9JKQ4 Gm24278-201ENSMUST00000104239 127 ntBASIC1,9□□□□□ -2,11
Irx5Q9JKQ4 Gm25279-201ENSMUST00000122608 133 ntBASIC1,89□□□□□ -2,11
Irx5Q9JKQ4 Mir669m-2-201ENSMUST00000158355 98 ntBASIC1,89□□□□□ -2,11
Irx5Q9JKQ4 Gm37778-201ENSMUST00000191732 190 ntBASIC1,88□□□□□ -2,11
Irx5Q9JKQ4 Gm25275-201ENSMUST00000104297 129 ntBASIC1,87□□□□□ -2,11
Irx5Q9JKQ4 Gm23853-201ENSMUST00000158375 104 ntBASIC1,87□□□□□ -2,11
Irx5Q9JKQ4 Gm24920-201ENSMUST00000083018 85 ntBASIC1,87□□□□□ -2,11
Irx5Q9JKQ4 Mir196b-201ENSMUST00000083509 85 ntBASIC1,87□□□□□ -2,11
Irx5Q9JKQ4 Snhg14-211ENSMUST00000189581 6861 ntTSL 1 (best) BASIC1,86□□□□□ -2,11
Irx5Q9JKQ4 Gm22925-201ENSMUST00000174956 102 ntBASIC1,85□□□□□ -2,11
Irx5Q9JKQ4 Mir320-201ENSMUST00000083594 82 ntBASIC1,85□□□□□ -2,11
Irx5Q9JKQ4 Gm23992-201ENSMUST00000174981 67 ntBASIC1,84□□□□□ -2,11
Irx5Q9JKQ4 Gm23416-201ENSMUST00000175520 95 ntBASIC1,84□□□□□ -2,11
Irx5Q9JKQ4 Gm44327-201ENSMUST00000200068 117 ntBASIC1,84□□□□□ -2,11
Irx5Q9JKQ4 Gm26224-201ENSMUST00000082506 80 ntBASIC1,84□□□□□ -2,11
Irx5Q9JKQ4 Gm22455-201ENSMUST00000082580 71 ntBASIC1,84□□□□□ -2,11
Irx5Q9JKQ4 Snord96a-201ENSMUST00000082791 81 ntBASIC1,84□□□□□ -2,11
Irx5Q9JKQ4 Vmn1r78-203ENSMUST00000228664 8100 ntAPPRIS P1 BASIC1,83□□□□□ -2,12
Irx5Q9JKQ4 Mir297b-201ENSMUST00000102268 109 ntBASIC1,83□□□□□ -2,12
Irx5Q9JKQ4 Mir3079-201ENSMUST00000175428 90 ntBASIC1,83□□□□□ -2,12
Irx5Q9JKQ4 Mir7010-201ENSMUST00000183464 63 ntBASIC1,83□□□□□ -2,12
Irx5Q9JKQ4 Gm24321-201ENSMUST00000175348 80 ntBASIC1,82□□□□□ -2,12
Irx5Q9JKQ4 Mir6351-201ENSMUST00000183826 99 ntBASIC1,82□□□□□ -2,12
Irx5Q9JKQ4 Vmn1r73-202ENSMUST00000226516 6155 ntAPPRIS P1 BASIC1,81□□□□□ -2,12
Irx5Q9JKQ4 Traj9-201ENSMUST00000103731 58 ntAPPRIS P1 BASIC1,81□□□□□ -2,12
Irx5Q9JKQ4 Gm25894-201ENSMUST00000083458 75 ntBASIC1,81□□□□□ -2,12
Irx5Q9JKQ4 Gm24271-201ENSMUST00000102327 111 ntBASIC1,8□□□□□ -2,12
Irx5Q9JKQ4 Gm25791-201ENSMUST00000083292 137 ntBASIC1,8□□□□□ -2,12
Irx5Q9JKQ4 Gm25247-201ENSMUST00000175475 90 ntBASIC1,79□□□□□ -2,12
Irx5Q9JKQ4 Gm44384-201ENSMUST00000200208 114 ntBASIC1,79□□□□□ -2,12
Irx5Q9JKQ4 Gm23122-201ENSMUST00000157645 103 ntBASIC1,78□□□□□ -2,12
Irx5Q9JKQ4 Gm22074-201ENSMUST00000158595 113 ntBASIC1,78□□□□□ -2,12
Irx5Q9JKQ4 Gm25049-201ENSMUST00000158597 73 ntBASIC1,78□□□□□ -2,12
Irx5Q9JKQ4 Gm27798-201ENSMUST00000184989 71 ntBASIC1,77□□□□□ -2,13
Irx5Q9JKQ4 Gm38074-201ENSMUST00000193467 145 ntTSL 5 BASIC1,76□□□□□ -2,13
Irx5Q9JKQ4 Vmn1r75-203ENSMUST00000226855 6548 ntAPPRIS P2 BASIC1,75□□□□□ -2,13
Irx5Q9JKQ4 Gm25497-201ENSMUST00000104425 132 ntBASIC1,75□□□□□ -2,13
Irx5Q9JKQ4 Gm23636-201ENSMUST00000175070 95 ntBASIC1,75□□□□□ -2,13
Irx5Q9JKQ4 Pcdh11x-208ENSMUST00000193899 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1,74□□□□□ -2,13
Irx5Q9JKQ4 Snord13-201ENSMUST00000157627 104 ntBASIC1,74□□□□□ -2,13
Irx5Q9JKQ4 Gm25903-201ENSMUST00000158492 103 ntBASIC1,74□□□□□ -2,13
Irx5Q9JKQ4 Gm27248-201ENSMUST00000184004 166 ntBASIC1,74□□□□□ -2,13
Irx5Q9JKQ4 Gm27607-201ENSMUST00000185162 122 ntBASIC1,74□□□□□ -2,13
Irx5Q9JKQ4 Gm23240-201ENSMUST00000083009 121 ntBASIC1,74□□□□□ -2,13
Irx5Q9JKQ4 n-R5s6-201ENSMUST00000122663 88 ntBASIC1,73□□□□□ -2,13
Irx5Q9JKQ4 Mir92-2-201ENSMUST00000083679 91 ntBASIC1,73□□□□□ -2,13
Irx5Q9JKQ4 Gm8251-201ENSMUST00000168641 5985 ntAPPRIS P1 BASIC1,72□□□□□ -2,13
Irx5Q9JKQ4 Gm22780-201ENSMUST00000104084 132 ntBASIC1,72□□□□□ -2,13
Irx5Q9JKQ4 Mir3070a-201ENSMUST00000175468 89 ntBASIC1,72□□□□□ -2,13
Irx5Q9JKQ4 Mir6896-201ENSMUST00000198033 73 ntBASIC1,72□□□□□ -2,13
Irx5Q9JKQ4 Gm25138-201ENSMUST00000083248 136 ntBASIC1,72□□□□□ -2,13
Irx5Q9JKQ4 A730009L09Rik-202ENSMUST00000210306 201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1,71□□□□□ -2,14
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