Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Gm42506-201ENSMUST00000202009 150 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Chmp3Q9CQ10 AC113441.1-201ENSMUST00000223464 134 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Chmp3Q9CQ10 Gm24920-201ENSMUST00000083018 85 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Chmp3Q9CQ10 Gm24278-201ENSMUST00000104239 127 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Chmp3Q9CQ10 Gm22542-201ENSMUST00000158166 95 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Chmp3Q9CQ10 Mir6380-201ENSMUST00000184334 81 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Chmp3Q9CQ10 AC125190.3-201ENSMUST00000223224 121 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Chmp3Q9CQ10 Mir362-201ENSMUST00000093592 65 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Chmp3Q9CQ10 Gm22149-201ENSMUST00000104442 136 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Chmp3Q9CQ10 Mir3473d-201ENSMUST00000175346 81 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Chmp3Q9CQ10 AC124196.2-201ENSMUST00000224835 145 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Chmp3Q9CQ10 Gm25296-201ENSMUST00000082566 67 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Chmp3Q9CQ10 Traj13-201ENSMUST00000103728 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.03□□□□□ -2.24
Chmp3Q9CQ10 Gm24226-201ENSMUST00000158826 97 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Chmp3Q9CQ10 Mir6394-201ENSMUST00000184738 99 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Chmp3Q9CQ10 Gm38274-201ENSMUST00000195689 148 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Chmp3Q9CQ10 AC129019.2-201ENSMUST00000222063 202 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Chmp3Q9CQ10 mt-Tm-201ENSMUST00000082395 69 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Chmp3Q9CQ10 Gm44457-201ENSMUST00000198109 76 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Chmp3Q9CQ10 Traj9-201ENSMUST00000103731 58 ntAPPRIS P1 BASIC0.99□□□□□ -2.25
Chmp3Q9CQ10 Gm24070-201ENSMUST00000104519 130 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Chmp3Q9CQ10 CT030170.1-201ENSMUST00000222183 148 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Chmp3Q9CQ10 Gm8251-201ENSMUST00000168641 5985 ntAPPRIS P1 BASIC0.98□□□□□ -2.25
Chmp3Q9CQ10 Gm25440-201ENSMUST00000158279 154 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Chmp3Q9CQ10 Gm26257-201ENSMUST00000122500 107 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Chmp3Q9CQ10 Gm44301-201ENSMUST00000200362 143 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Chmp3Q9CQ10 Gm25309-201ENSMUST00000116728 126 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Chmp3Q9CQ10 Mir6985-201ENSMUST00000184641 61 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Chmp3Q9CQ10 AC157278.1-201ENSMUST00000221621 148 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Chmp3Q9CQ10 Gm24201-201ENSMUST00000082946 125 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Chmp3Q9CQ10 Olfr867-203ENSMUST00000216538 4617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
Chmp3Q9CQ10 Gm24396-201ENSMUST00000116905 93 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Chmp3Q9CQ10 Gm23020-201ENSMUST00000158766 253 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Chmp3Q9CQ10 Gm39149-201ENSMUST00000210258 186 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
Chmp3Q9CQ10 Gm25496-201ENSMUST00000104430 120 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Chmp3Q9CQ10 Mir6389-201ENSMUST00000183661 102 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Chmp3Q9CQ10 Gm44458-201ENSMUST00000196594 143 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Chmp3Q9CQ10 Gm22689-201ENSMUST00000102452 110 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Chmp3Q9CQ10 Gm23072-201ENSMUST00000158243 123 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Chmp3Q9CQ10 Gm22165-201ENSMUST00000158414 103 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Chmp3Q9CQ10 Gm44345-201ENSMUST00000199560 135 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Chmp3Q9CQ10 mt-Tw-201ENSMUST00000082397 67 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Chmp3Q9CQ10 Vmn1r75-202ENSMUST00000226622 6638 ntAPPRIS P2 BASIC0.93□□□□□ -2.26
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Chmp3Q9CQ10 Gm25010-201ENSMUST00000158403 65 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Chmp3Q9CQ10 Gm23649-201ENSMUST00000179007 107 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
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Chmp3Q9CQ10 Gm26484-201ENSMUST00000158018 106 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
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Chmp3Q9CQ10 Mir670-201ENSMUST00000102380 100 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Chmp3Q9CQ10 Gm22595-201ENSMUST00000104250 130 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Chmp3Q9CQ10 Mir3109-201ENSMUST00000175301 88 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Chmp3Q9CQ10 Gm23735-201ENSMUST00000082551 134 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Chmp3Q9CQ10 Mir717-201ENSMUST00000102259 109 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Chmp3Q9CQ10 Gm24796-201ENSMUST00000104007 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Chmp3Q9CQ10 Gm27450-201ENSMUST00000104632 90 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Chmp3Q9CQ10 Gm24400-201ENSMUST00000157865 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Chmp3Q9CQ10 Gm23036-201ENSMUST00000157885 99 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Chmp3Q9CQ10 CT009723.2-201ENSMUST00000215702 124 ntTSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
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Chmp3Q9CQ10 Gm24342-201ENSMUST00000103907 104 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Chmp3Q9CQ10 Gm25275-201ENSMUST00000104297 129 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Chmp3Q9CQ10 Gm11084-201ENSMUST00000112062 69 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.84□□□□□ -2.27
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Chmp3Q9CQ10 Gm22981-201ENSMUST00000082611 75 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Chmp3Q9CQ10 Gm24927-201ENSMUST00000083397 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Chmp3Q9CQ10 Gm25652-201ENSMUST00000083780 103 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
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Chmp3Q9CQ10 Gm22239-201ENSMUST00000175220 103 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Chmp3Q9CQ10 Gm24612-201ENSMUST00000083267 107 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Chmp3Q9CQ10 Mir23a-201ENSMUST00000083677 75 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Chmp3Q9CQ10 Gm13577-201ENSMUST00000121365 205 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
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Chmp3Q9CQ10 Gm25648-201ENSMUST00000177844 79 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Chmp3Q9CQ10 Gm38113-201ENSMUST00000193704 201 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Chmp3Q9CQ10 Mir487b-201ENSMUST00000102265 82 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Chmp3Q9CQ10 Gm20386-201ENSMUST00000174010 132 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Chmp3Q9CQ10 Gm45541-201ENSMUST00000210443 54 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Chmp3Q9CQ10 Mir18-201ENSMUST00000083469 96 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Chmp3Q9CQ10 Gm22717-201ENSMUST00000122703 171 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Chmp3Q9CQ10 Gm23008-201ENSMUST00000158946 80 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Chmp3Q9CQ10 Gm27263-201ENSMUST00000184760 76 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Chmp3Q9CQ10 Gm23494-201ENSMUST00000116830 126 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Chmp3Q9CQ10 Gm22039-201ENSMUST00000157278 132 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Chmp3Q9CQ10 Gm23590-201ENSMUST00000157661 104 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
Chmp3Q9CQ10 Snora62-201ENSMUST00000082991 149 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
Chmp3Q9CQ10 Gm25161-201ENSMUST00000158913 132 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
Chmp3Q9CQ10 Gm26139-201ENSMUST00000180098 107 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
Chmp3Q9CQ10 Gm22298-201ENSMUST00000082662 133 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
Chmp3Q9CQ10 Gm22078-201ENSMUST00000157593 103 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Chmp3Q9CQ10 Gm26236-201ENSMUST00000175536 137 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Chmp3Q9CQ10 Mir7065-201ENSMUST00000185110 61 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Chmp3Q9CQ10 Mir7231-201ENSMUST00000196252 61 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Chmp3Q9CQ10 AC238676.2-201ENSMUST00000220910 94 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
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