Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Gm44483-201ENSMUST00000197203 97 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Hoxd9P28357 Gm24895-201ENSMUST00000122742 74 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Hoxd9P28357 Gm23221-201ENSMUST00000158118 93 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Hoxd9P28357 Gm24500-201ENSMUST00000158447 124 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Hoxd9P28357 Mir1954-201ENSMUST00000175595 86 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Hoxd9P28357 Gm25326-201ENSMUST00000101903 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Hoxd9P28357 Gm24377-201ENSMUST00000104398 131 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Hoxd9P28357 Gm23329-201ENSMUST00000157415 108 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Hoxd9P28357 Gm24808-201ENSMUST00000157993 118 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Hoxd9P28357 Gm25993-201ENSMUST00000175391 80 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Hoxd9P28357 Mir7010-201ENSMUST00000183464 63 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Hoxd9P28357 Gm27493-201ENSMUST00000184128 78 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Hoxd9P28357 Mir7079-201ENSMUST00000184697 69 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Hoxd9P28357 Gm22746-201ENSMUST00000082494 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Hoxd9P28357 Gm22233-201ENSMUST00000157464 114 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Hoxd9P28357 Gm23122-201ENSMUST00000157645 103 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Hoxd9P28357 Gm25868-201ENSMUST00000158253 114 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Hoxd9P28357 Gm22340-201ENSMUST00000157717 114 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Hoxd9P28357 Gm44211-201ENSMUST00000204867 145 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Hoxd9P28357 Snord57-201ENSMUST00000083338 72 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Hoxd9P28357 Gm23020-201ENSMUST00000158766 253 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Hoxd9P28357 Gm25307-201ENSMUST00000158885 106 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Hoxd9P28357 Traj60-201ENSMUST00000167781 54 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Hoxd9P28357 Gm27587-201ENSMUST00000185116 163 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Hoxd9P28357 Gm25296-201ENSMUST00000082566 67 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Hoxd9P28357 Gm22127-201ENSMUST00000083239 106 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Hoxd9P28357 Gm22720-201ENSMUST00000122710 87 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Hoxd9P28357 Gm23955-201ENSMUST00000157214 100 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Hoxd9P28357 Gm22559-201ENSMUST00000157329 134 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Hoxd9P28357 Gm23328-201ENSMUST00000157418 132 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Hoxd9P28357 Gm23783-201ENSMUST00000157941 102 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Hoxd9P28357 Gm22542-201ENSMUST00000158166 95 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Hoxd9P28357 Vmn1r73-202ENSMUST00000226516 6155 ntAPPRIS P1 BASIC1.29□□□□□ -2.2
Hoxd9P28357 Gm25495-201ENSMUST00000104431 131 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Hoxd9P28357 n-R5s6-201ENSMUST00000122663 88 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Hoxd9P28357 Gm16399-201ENSMUST00000181423 219 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Hoxd9P28357 Gm27263-201ENSMUST00000184760 76 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Hoxd9P28357 Gm6607-201ENSMUST00000215035 328 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Hoxd9P28357 Gm22298-201ENSMUST00000082662 133 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Hoxd9P28357 Gm25222-201ENSMUST00000158199 126 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Hoxd9P28357 Gm24321-201ENSMUST00000175348 80 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Hoxd9P28357 Gm25138-201ENSMUST00000083248 136 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Hoxd9P28357 n-R5s157-201ENSMUST00000122543 121 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Hoxd9P28357 Gm26306-201ENSMUST00000157773 119 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Hoxd9P28357 Gm24297-201ENSMUST00000158300 68 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Hoxd9P28357 Gm27711-201ENSMUST00000183802 118 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Hoxd9P28357 AC139186.1-201ENSMUST00000197610 94 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Hoxd9P28357 Mir343-201ENSMUST00000102360 75 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Hoxd9P28357 Gm24796-201ENSMUST00000104007 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Hoxd9P28357 Gm23573-201ENSMUST00000104408 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Hoxd9P28357 Gm26052-201ENSMUST00000104646 84 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Hoxd9P28357 Gm42533-201ENSMUST00000196247 157 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Hoxd9P28357 AC125190.3-201ENSMUST00000223224 121 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Hoxd9P28357 Gm25894-201ENSMUST00000083458 75 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Hoxd9P28357 Mir23a-201ENSMUST00000083677 75 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Hoxd9P28357 Traj45-201ENSMUST00000103697 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.23□□□□□ -2.21
Hoxd9P28357 Mir3070a-201ENSMUST00000175468 89 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Hoxd9P28357 Gm44327-201ENSMUST00000200068 117 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Hoxd9P28357 Mir10b-201ENSMUST00000083566 68 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Hoxd9P28357 Tex15-201ENSMUST00000009772 8405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
Hoxd9P28357 Gm10945-201ENSMUST00000105596 60 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
Hoxd9P28357 Gm27943-201ENSMUST00000184844 116 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Hoxd9P28357 Gm23494-201ENSMUST00000116830 126 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Hoxd9P28357 Mir15a-201ENSMUST00000175266 84 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Hoxd9P28357 mt-Tw-201ENSMUST00000082397 67 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Hoxd9P28357 Mir181b-1-201ENSMUST00000083524 80 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Hoxd9P28357 Mir7063-201ENSMUST00000184158 91 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Hoxd9P28357 Gm25128-201ENSMUST00000083339 76 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Hoxd9P28357 Gm23017-201ENSMUST00000177583 72 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Hoxd9P28357 Snora62-201ENSMUST00000082991 149 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Hoxd9P28357 Gm23245-201ENSMUST00000083370 135 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Hoxd9P28357 Mir101a-201ENSMUST00000083517 83 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Hoxd9P28357 Gm24865-201ENSMUST00000103246 96 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Hoxd9P28357 Gm22431-201ENSMUST00000158545 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Hoxd9P28357 Gm21954-201ENSMUST00000179544 51 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
Hoxd9P28357 Gm24920-201ENSMUST00000083018 85 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Hoxd9P28357 Mir196b-201ENSMUST00000083509 85 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Hoxd9P28357 Mir211-201ENSMUST00000083651 106 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Hoxd9P28357 Gm25522-201ENSMUST00000158394 105 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Hoxd9P28357 Gm42845-201ENSMUST00000197766 105 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Hoxd9P28357 Gm44455-201ENSMUST00000200061 82 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Hoxd9P28357 Gm25497-201ENSMUST00000104425 132 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Hoxd9P28357 Gm25247-201ENSMUST00000175475 90 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Hoxd9P28357 Gm27607-201ENSMUST00000185162 122 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Hoxd9P28357 Traj9-201ENSMUST00000103731 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.14□□□□□ -2.23
Hoxd9P28357 Gm22780-201ENSMUST00000104084 132 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Hoxd9P28357 Mir1904-201ENSMUST00000122702 80 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Hoxd9P28357 Gm25166-201ENSMUST00000158909 111 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Hoxd9P28357 Gm22302-201ENSMUST00000082657 106 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Hoxd9P28357 Gm24252-201ENSMUST00000083700 132 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Hoxd9P28357 Gm24555-201ENSMUST00000104548 124 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Hoxd9P28357 Gm22485-201ENSMUST00000157990 109 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Hoxd9P28357 Gm22074-201ENSMUST00000158595 113 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Hoxd9P28357 Gm26363-201ENSMUST00000158866 83 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Hoxd9P28357 Mir3473d-201ENSMUST00000175346 81 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Hoxd9P28357 Mir200a-201ENSMUST00000083466 90 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Hoxd9P28357 Mirlet7g-201ENSMUST00000083506 88 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Hoxd9P28357 Gm23636-201ENSMUST00000175070 95 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Hoxd9P28357 Mir7091-201ENSMUST00000184075 79 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Hoxd9P28357 Gm22303-201ENSMUST00000082686 122 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
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