Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Gm24942-201ENSMUST00000158328 114 ntBASIC1,25□□□□□ -2,21
Hoxb1P17919 Mir3070a-201ENSMUST00000175468 89 ntBASIC1,25□□□□□ -2,21
Hoxb1P17919 Gm27587-201ENSMUST00000185116 163 ntBASIC1,24□□□□□ -2,21
Hoxb1P17919 Gm44327-201ENSMUST00000200068 117 ntBASIC1,23□□□□□ -2,21
Hoxb1P17919 Mir23a-201ENSMUST00000083677 75 ntBASIC1,23□□□□□ -2,21
Hoxb1P17919 Gm23494-201ENSMUST00000116830 126 ntBASIC1,22□□□□□ -2,21
Hoxb1P17919 Gm23787-201ENSMUST00000122538 73 ntBASIC1,22□□□□□ -2,21
Hoxb1P17919 Gm22542-201ENSMUST00000158166 95 ntBASIC1,22□□□□□ -2,21
Hoxb1P17919 Gm27326-201ENSMUST00000183504 95 ntBASIC1,22□□□□□ -2,21
Hoxb1P17919 Gm42845-201ENSMUST00000197766 105 ntBASIC1,22□□□□□ -2,21
Hoxb1P17919 Gm23017-201ENSMUST00000177583 72 ntBASIC1,21□□□□□ -2,22
Hoxb1P17919 DQ267101-201ENSMUST00000082562 73 ntBASIC1,21□□□□□ -2,22
Hoxb1P17919 Gm22357-201ENSMUST00000082882 83 ntBASIC1,21□□□□□ -2,22
Hoxb1P17919 Mir1904-201ENSMUST00000122702 80 ntBASIC1,2□□□□□ -2,22
Hoxb1P17919 Gm23558-201ENSMUST00000157823 80 ntBASIC1,2□□□□□ -2,22
Hoxb1P17919 Gm23020-201ENSMUST00000158766 253 ntBASIC1,2□□□□□ -2,22
Hoxb1P17919 Mir8116-201ENSMUST00000184134 97 ntBASIC1,2□□□□□ -2,22
Hoxb1P17919 AC125190.3-201ENSMUST00000223224 121 ntBASIC1,2□□□□□ -2,22
Hoxb1P17919 Snora62-201ENSMUST00000082991 149 ntBASIC1,2□□□□□ -2,22
Hoxb1P17919 Mir7091-201ENSMUST00000184075 79 ntBASIC1,19□□□□□ -2,22
Hoxb1P17919 Mir7665-201ENSMUST00000184907 63 ntBASIC1,19□□□□□ -2,22
Hoxb1P17919 AC139186.1-201ENSMUST00000197610 94 ntBASIC1,19□□□□□ -2,22
Hoxb1P17919 Gm43911-201ENSMUST00000203097 76 ntBASIC1,19□□□□□ -2,22
Hoxb1P17919 Gm24920-201ENSMUST00000083018 85 ntBASIC1,19□□□□□ -2,22
Hoxb1P17919 Mir181b-1-201ENSMUST00000083524 80 ntBASIC1,19□□□□□ -2,22
Hoxb1P17919 Gm25779-201ENSMUST00000116710 95 ntBASIC1,18□□□□□ -2,22
Hoxb1P17919 Gm22074-201ENSMUST00000158595 113 ntBASIC1,18□□□□□ -2,22
Hoxb1P17919 Gm27974-201ENSMUST00000183415 105 ntBASIC1,18□□□□□ -2,22
Hoxb1P17919 Gm44455-201ENSMUST00000200061 82 ntBASIC1,18□□□□□ -2,22
Hoxb1P17919 Gm24555-201ENSMUST00000104548 124 ntBASIC1,17□□□□□ -2,22
Hoxb1P17919 Gm22431-201ENSMUST00000158545 107 ntBASIC1,17□□□□□ -2,22
Hoxb1P17919 Gm27894-201ENSMUST00000184177 92 ntBASIC1,17□□□□□ -2,22
Hoxb1P17919 Gm24379-201ENSMUST00000122695 86 ntBASIC1,16□□□□□ -2,22
Hoxb1P17919 Gm23122-201ENSMUST00000157645 103 ntBASIC1,16□□□□□ -2,22
Hoxb1P17919 Gm24297-201ENSMUST00000158300 68 ntBASIC1,16□□□□□ -2,22
Hoxb1P17919 Gm26363-201ENSMUST00000158866 83 ntBASIC1,16□□□□□ -2,22
Hoxb1P17919 Vmn1r73-202ENSMUST00000226516 6155 ntAPPRIS P1 BASIC1,15□□□□□ -2,22
Hoxb1P17919 Gm25522-201ENSMUST00000158394 105 ntBASIC1,15□□□□□ -2,23
Hoxb1P17919 Gm24777-201ENSMUST00000157644 107 ntBASIC1,14□□□□□ -2,23
Hoxb1P17919 Gm22455-201ENSMUST00000082580 71 ntBASIC1,14□□□□□ -2,23
Hoxb1P17919 Mir33-201ENSMUST00000083531 69 ntBASIC1,14□□□□□ -2,23
Hoxb1P17919 Gm23347-201ENSMUST00000083823 82 ntBASIC1,14□□□□□ -2,23
Hoxb1P17919 Traj9-201ENSMUST00000103731 58 ntAPPRIS P1 BASIC1,13□□□□□ -2,23
Hoxb1P17919 Gm27943-201ENSMUST00000184844 116 ntBASIC1,13□□□□□ -2,23
Hoxb1P17919 mt-Tw-201ENSMUST00000082397 67 ntBASIC1,13□□□□□ -2,23
Hoxb1P17919 Gm22302-201ENSMUST00000082657 106 ntBASIC1,13□□□□□ -2,23
Hoxb1P17919 Gm24865-201ENSMUST00000103246 96 ntBASIC1,12□□□□□ -2,23
Hoxb1P17919 Gm26082-201ENSMUST00000104070 127 ntBASIC1,12□□□□□ -2,23
Hoxb1P17919 Gm23483-201ENSMUST00000104179 108 ntBASIC1,12□□□□□ -2,23
Hoxb1P17919 Gm25768-201ENSMUST00000158570 98 ntBASIC1,12□□□□□ -2,23
Hoxb1P17919 Gm25275-201ENSMUST00000104297 129 ntBASIC1,11□□□□□ -2,23
Hoxb1P17919 Mir6962-201ENSMUST00000199512 63 ntBASIC1,11□□□□□ -2,23
Hoxb1P17919 Mir343-201ENSMUST00000102360 75 ntBASIC1,1□□□□□ -2,23
Hoxb1P17919 Mir3968-201ENSMUST00000175355 100 ntBASIC1,1□□□□□ -2,23
Hoxb1P17919 Mir8119-201ENSMUST00000183371 129 ntBASIC1,1□□□□□ -2,23
Hoxb1P17919 Olfr867-203ENSMUST00000216538 4617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1,1□□□□□ -2,23
Hoxb1P17919 Gm10974-201ENSMUST00000107486 126 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1,09□□□□□ -2,23
Hoxb1P17919 Snord32a-201ENSMUST00000083285 83 ntBASIC1,09□□□□□ -2,23
Hoxb1P17919 Mir200a-201ENSMUST00000083466 90 ntBASIC1,09□□□□□ -2,23
Hoxb1P17919 Mir448-201ENSMUST00000083516 112 ntBASIC1,09□□□□□ -2,23
Hoxb1P17919 Gm22980-201ENSMUST00000082608 70 ntBASIC1,08□□□□□ -2,24
Hoxb1P17919 Gm22303-201ENSMUST00000082686 122 ntBASIC1,08□□□□□ -2,24
Hoxb1P17919 Gm24020-201ENSMUST00000180156 108 ntBASIC1,07□□□□□ -2,24
Hoxb1P17919 Mir6364-201ENSMUST00000183396 86 ntBASIC1,07□□□□□ -2,24
Hoxb1P17919 Ighv1-23-201ENSMUST00000194625 351 ntAPPRIS P1 BASIC1,07□□□□□ -2,24
Hoxb1P17919 Snord35a-201ENSMUST00000083884 90 ntBASIC1,07□□□□□ -2,24
Hoxb1P17919 Gm12432-201ENSMUST00000119540 186 ntBASIC1,06□□□□□ -2,24
Hoxb1P17919 Mir7063-201ENSMUST00000184158 91 ntBASIC1,06□□□□□ -2,24
Hoxb1P17919 Mir6240-201ENSMUST00000184281 117 ntBASIC1,06□□□□□ -2,24
Hoxb1P17919 Mir7059-201ENSMUST00000184825 59 ntBASIC1,05□□□□□ -2,24
Hoxb1P17919 Gm24459-201ENSMUST00000082730 86 ntBASIC1,05□□□□□ -2,24
Hoxb1P17919 Mirlet7g-201ENSMUST00000083506 88 ntBASIC1,05□□□□□ -2,24
Hoxb1P17919 Olfr1099-202ENSMUST00000213456 4867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1,05□□□□□ -2,24
Hoxb1P17919 Gm25274-201ENSMUST00000104296 135 ntBASIC1,04□□□□□ -2,24
Hoxb1P17919 Gm22485-201ENSMUST00000157990 109 ntBASIC1,04□□□□□ -2,24
Hoxb1P17919 Gm22301-201ENSMUST00000082656 107 ntBASIC1,04□□□□□ -2,24
Hoxb1P17919 Gm22780-201ENSMUST00000104084 132 ntBASIC1,03□□□□□ -2,24
Hoxb1P17919 Gm22673-201ENSMUST00000104415 131 ntBASIC1,03□□□□□ -2,24
Hoxb1P17919 Gm23173-201ENSMUST00000157161 160 ntBASIC1,03□□□□□ -2,24
Hoxb1P17919 Gm23329-201ENSMUST00000157415 108 ntBASIC1,03□□□□□ -2,24
Hoxb1P17919 Gm24678-201ENSMUST00000158756 104 ntBASIC1,03□□□□□ -2,24
Hoxb1P17919 Mir7052-201ENSMUST00000184821 65 ntBASIC1,03□□□□□ -2,24
Hoxb1P17919 AC161271.1-201ENSMUST00000226914 150 ntBASIC1,03□□□□□ -2,24
Hoxb1P17919 Mir211-201ENSMUST00000083651 106 ntBASIC1,03□□□□□ -2,24
Hoxb1P17919 Gm24252-201ENSMUST00000083700 132 ntBASIC1,03□□□□□ -2,24
Hoxb1P17919 Mir695-201ENSMUST00000102261 109 ntBASIC1,02□□□□□ -2,25
Hoxb1P17919 Gm26301-201ENSMUST00000104813 95 ntBASIC1,02□□□□□ -2,25
Hoxb1P17919 Gm23893-201ENSMUST00000158106 134 ntBASIC1,02□□□□□ -2,25
Hoxb1P17919 Gm23636-201ENSMUST00000175070 95 ntBASIC1,02□□□□□ -2,25
Hoxb1P17919 Mir363-201ENSMUST00000093598 75 ntBASIC1,02□□□□□ -2,25
Hoxb1P17919 Mir3105-201ENSMUST00000175480 85 ntBASIC1,01□□□□□ -2,25
Hoxb1P17919 Mir7229-201ENSMUST00000197062 53 ntBASIC1,01□□□□□ -2,25
Hoxb1P17919 Gm25683-201ENSMUST00000083940 131 ntBASIC1,01□□□□□ -2,25
Hoxb1P17919 Gm21961-201ENSMUST00000110100 114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1□□□□□ -2,25
Hoxb1P17919 Mir1955-201ENSMUST00000158014 98 ntBASIC1□□□□□ -2,25
Hoxb1P17919 Mir3473d-201ENSMUST00000175346 81 ntBASIC1□□□□□ -2,25
Hoxb1P17919 Snord67-201ENSMUST00000104033 111 ntBASIC0,99□□□□□ -2,25
Hoxb1P17919 Mir196b-201ENSMUST00000083509 85 ntBASIC0,99□□□□□ -2,25
Hoxb1P17919 Gm22149-201ENSMUST00000104442 136 ntBASIC0,98□□□□□ -2,25
Hoxb1P17919 Gm23328-201ENSMUST00000157418 132 ntBASIC0,98□□□□□ -2,25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 145,7 ms