Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm25229-201ENSMUST00000178587 79 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
Ccl20O89093 Gm25449-201ENSMUST00000179389 79 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
Ccl20O89093 Gm26207-201ENSMUST00000082909 104 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
Ccl20O89093 Mir148a-201ENSMUST00000083571 99 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
Ccl20O89093 Gm25089-201ENSMUST00000102015 79 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
Ccl20O89093 Mir717-201ENSMUST00000102259 109 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
Ccl20O89093 Mir741-201ENSMUST00000103931 71 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
Ccl20O89093 Mir5124a-201ENSMUST00000175528 72 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
Ccl20O89093 Gm25840-201ENSMUST00000177821 79 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
Ccl20O89093 Gm24952-201ENSMUST00000177909 79 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
Ccl20O89093 Gm23682-201ENSMUST00000178146 79 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
Ccl20O89093 Gm24652-201ENSMUST00000178223 79 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
Ccl20O89093 Gm22629-201ENSMUST00000178272 79 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
Ccl20O89093 Gm24021-201ENSMUST00000178435 79 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
Ccl20O89093 Gm22274-201ENSMUST00000178441 79 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
Ccl20O89093 Gm22050-201ENSMUST00000178442 79 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
Ccl20O89093 Gm23688-201ENSMUST00000178502 79 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
Ccl20O89093 Gm23944-201ENSMUST00000178607 79 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
Ccl20O89093 Gm26283-201ENSMUST00000178625 79 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
Ccl20O89093 Gm25452-201ENSMUST00000178776 79 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
Ccl20O89093 Gm23286-201ENSMUST00000178963 79 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
Ccl20O89093 Gm22640-201ENSMUST00000179035 79 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
Ccl20O89093 Gm25984-201ENSMUST00000179129 79 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
Ccl20O89093 Gm25585-201ENSMUST00000179469 79 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
Ccl20O89093 Gm26374-201ENSMUST00000179737 79 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
Ccl20O89093 Gm24040-201ENSMUST00000179786 79 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
Ccl20O89093 Gm25017-201ENSMUST00000179805 79 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
Ccl20O89093 Gm25870-201ENSMUST00000179845 79 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
Ccl20O89093 Gm23618-201ENSMUST00000179912 79 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
Ccl20O89093 Gm26284-201ENSMUST00000180107 79 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
Ccl20O89093 Gm24570-201ENSMUST00000180314 79 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
Ccl20O89093 Gm24654-201ENSMUST00000180315 79 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
Ccl20O89093 Gm26081-201ENSMUST00000104068 132 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
Ccl20O89093 Gm22048-201ENSMUST00000104721 89 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
Ccl20O89093 Gm22842-201ENSMUST00000157709 118 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
Ccl20O89093 Gm23350-201ENSMUST00000158429 103 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
Ccl20O89093 Gm24971-201ENSMUST00000175581 110 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
Ccl20O89093 Gm27639-201ENSMUST00000184937 85 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
Ccl20O89093 Gm22605-201ENSMUST00000158289 108 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
Ccl20O89093 Gm24070-201ENSMUST00000104519 130 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
Ccl20O89093 Gm37832-201ENSMUST00000118935 189 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
Ccl20O89093 Gm24637-201ENSMUST00000158674 85 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
Ccl20O89093 Gm23017-201ENSMUST00000177583 72 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
Ccl20O89093 Mir5124b-201ENSMUST00000184251 85 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
Ccl20O89093 Gm25696-201ENSMUST00000082900 105 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
Ccl20O89093 Gm24099-201ENSMUST00000083384 107 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
Ccl20O89093 Zfp813-ps-201ENSMUST00000186652 2506 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
Ccl20O89093 Gm26425-201ENSMUST00000122529 82 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
Ccl20O89093 Gm43038-201ENSMUST00000202359 88 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
Ccl20O89093 Gm24587-201ENSMUST00000116697 89 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
Ccl20O89093 Gm22677-201ENSMUST00000116977 108 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
Ccl20O89093 Gm25964-201ENSMUST00000157171 97 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
Ccl20O89093 Gm25802-201ENSMUST00000082639 77 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
Ccl20O89093 Gm23678-201ENSMUST00000083157 107 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
Ccl20O89093 Gm23138-201ENSMUST00000083365 103 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
Ccl20O89093 Mir487b-201ENSMUST00000102265 82 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
Ccl20O89093 Gm27784-201ENSMUST00000184926 113 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
Ccl20O89093 Gm26456-201ENSMUST00000082831 111 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
Ccl20O89093 Gm24793-201ENSMUST00000104289 132 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
Ccl20O89093 Gm22298-201ENSMUST00000082662 133 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
Ccl20O89093 Gm25879-201ENSMUST00000104330 107 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
Ccl20O89093 Gm25322-201ENSMUST00000122556 104 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
Ccl20O89093 Gm24167-201ENSMUST00000177733 124 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
Ccl20O89093 Gm24028-201ENSMUST00000178991 124 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
Ccl20O89093 Mir8116-201ENSMUST00000184134 97 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
Ccl20O89093 Mir7094-2-201ENSMUST00000184622 60 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
Ccl20O89093 Mir7094-1-201ENSMUST00000199671 60 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
Ccl20O89093 Gm24201-201ENSMUST00000082946 125 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
Ccl20O89093 Gm23790-201ENSMUST00000083013 107 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
Ccl20O89093 Gm24162-201ENSMUST00000093665 102 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
Ccl20O89093 Gm25431-201ENSMUST00000101978 107 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
Ccl20O89093 Gm27975-201ENSMUST00000184400 101 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
Ccl20O89093 Mir677-202ENSMUST00000197076 78 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
Ccl20O89093 mt-Tf-201ENSMUST00000082387 68 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
Ccl20O89093 Cyp2j7-ps1-201ENSMUST00000122430 173 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
Ccl20O89093 Gm25440-201ENSMUST00000158279 154 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
Ccl20O89093 Gm44311-201ENSMUST00000196448 69 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
Ccl20O89093 Gm42773-201ENSMUST00000196962 148 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
Ccl20O89093 Gm22813-202ENSMUST00000200346 124 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
Ccl20O89093 Gm26054-201ENSMUST00000083037 107 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
Ccl20O89093 Gm24492-201ENSMUST00000083798 107 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
Ccl20O89093 Snora16a-202ENSMUST00000196061 137 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
Ccl20O89093 Mirlet7d-201ENSMUST00000083519 103 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
Ccl20O89093 Mir103-1-201ENSMUST00000083619 86 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
Ccl20O89093 Gm23955-201ENSMUST00000157214 100 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
Ccl20O89093 Gm22413-201ENSMUST00000175465 85 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
Ccl20O89093 Gm27607-201ENSMUST00000185162 122 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
Ccl20O89093 Gm22335-201ENSMUST00000157724 99 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
Ccl20O89093 Mir6905-201ENSMUST00000184228 70 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
Ccl20O89093 Gm27977-201ENSMUST00000185159 111 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
Ccl20O89093 Gm24705-201ENSMUST00000082808 107 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
Ccl20O89093 Gm22004-201ENSMUST00000101884 107 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
Ccl20O89093 Gm26441-201ENSMUST00000082590 104 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
Ccl20O89093 Snora2b-201ENSMUST00000084005 137 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
Ccl20O89093 Gm24714-201ENSMUST00000102382 101 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
Ccl20O89093 Gm25609-201ENSMUST00000104019 104 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
Ccl20O89093 Gm24467-201ENSMUST00000157887 126 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
Ccl20O89093 AC122327.1-201ENSMUST00000220778 108 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
Ccl20O89093 Gm25641-201ENSMUST00000175135 108 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
Ccl20O89093 Mir3101-201ENSMUST00000175607 88 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 133.9 ms