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Protein–RNA interactions for Protein: O35054
Cldn4, Claudin-4, mouse
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (Experimental data)
Gene
UniProt Accession
Transcript Symbol
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
Cldn4
O35054
Traj53-201
ENSMUST00000103690
66 nt
APPRIS P1
BASIC
0.14
□□□□□ -2.39
Cldn4
O35054
Gm44932-201
ENSMUST00000206799
121 nt
BASIC
0.14
□□□□□ -2.39
Cldn4
O35054
Gm22454-201
ENSMUST00000082583
107 nt
BASIC
0.14
□□□□□ -2.39
Cldn4
O35054
AC154506.4-201
ENSMUST00000224898
3416 nt
BASIC
0.14
□□□□□ -2.39
Cldn4
O35054
Gm25022-201
ENSMUST00000102205
83 nt
BASIC
0.13
□□□□□ -2.39
Cldn4
O35054
Mir467a-6-201
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83 nt
BASIC
0.13
□□□□□ -2.39
Cldn4
O35054
Mir467a-3-201
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83 nt
BASIC
0.13
□□□□□ -2.39
Cldn4
O35054
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83 nt
BASIC
0.13
□□□□□ -2.39
Cldn4
O35054
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83 nt
BASIC
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□□□□□ -2.39
Cldn4
O35054
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83 nt
BASIC
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□□□□□ -2.39
Cldn4
O35054
Mir467a-2-201
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BASIC
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□□□□□ -2.39
Cldn4
O35054
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BASIC
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□□□□□ -2.39
Cldn4
O35054
Mir467a-4-201
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83 nt
BASIC
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□□□□□ -2.39
Cldn4
O35054
Mir467a-8-201
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BASIC
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□□□□□ -2.39
Cldn4
O35054
CT571266.1-201
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BASIC
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□□□□□ -2.39
Cldn4
O35054
Gm25619-201
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BASIC
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□□□□□ -2.39
Cldn4
O35054
Gm23761-201
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BASIC
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□□□□□ -2.39
Cldn4
O35054
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BASIC
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□□□□□ -2.39
Cldn4
O35054
Gm25609-201
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104 nt
BASIC
0.11
□□□□□ -2.39
Cldn4
O35054
Gm27549-201
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62 nt
BASIC
0.11
□□□□□ -2.39
Cldn4
O35054
Mir126a-201
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73 nt
BASIC
0.11
□□□□□ -2.39
Cldn4
O35054
Gm24199-201
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136 nt
BASIC
0.1
□□□□□ -2.39
Cldn4
O35054
Mir363-201
ENSMUST00000093598
75 nt
BASIC
0.1
□□□□□ -2.39
Cldn4
O35054
Gm24381-201
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BASIC
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□□□□□ -2.4
Cldn4
O35054
Gm24868-201
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136 nt
BASIC
0.09
□□□□□ -2.4
Cldn4
O35054
Gm24077-201
ENSMUST00000158183
136 nt
BASIC
0.09
□□□□□ -2.4
Cldn4
O35054
Gm24134-201
ENSMUST00000083361
71 nt
BASIC
0.09
□□□□□ -2.4
Cldn4
O35054
Gm26104-201
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108 nt
BASIC
0.08
□□□□□ -2.4
Cldn4
O35054
Gm24903-201
ENSMUST00000158131
126 nt
BASIC
0.08
□□□□□ -2.4
Cldn4
O35054
Mir6904-201
ENSMUST00000183443
67 nt
BASIC
0.08
□□□□□ -2.4
Cldn4
O35054
Mir3967-201
ENSMUST00000198710
68 nt
BASIC
0.08
□□□□□ -2.4
Cldn4
O35054
Gm22805-201
ENSMUST00000082739
107 nt
BASIC
0.08
□□□□□ -2.4
Cldn4
O35054
Gm25275-201
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BASIC
0.07
□□□□□ -2.4
Cldn4
O35054
Gm25964-201
ENSMUST00000157171
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BASIC
0.07
□□□□□ -2.4
Cldn4
O35054
Gm22962-201
ENSMUST00000157962
73 nt
BASIC
0.07
□□□□□ -2.4
Cldn4
O35054
Gm37750-201
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129 nt
BASIC
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□□□□□ -2.4
Cldn4
O35054
Gm45655-201
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160 nt
BASIC
0.07
□□□□□ -2.4
Cldn4
O35054
Gm25296-201
ENSMUST00000082566
67 nt
BASIC
0.07
□□□□□ -2.4
Cldn4
O35054
Gm25112-201
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BASIC
0.06
□□□□□ -2.4
Cldn4
O35054
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BASIC
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□□□□□ -2.4
Cldn4
O35054
Gm24463-201
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BASIC
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□□□□□ -2.4
Cldn4
O35054
Gm22455-201
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BASIC
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□□□□□ -2.4
Cldn4
O35054
Gm25061-201
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BASIC
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□□□□□ -2.4
Cldn4
O35054
Snord85-201
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73 nt
BASIC
0.05
□□□□□ -2.4
Cldn4
O35054
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BASIC
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□□□□□ -2.4
Cldn4
O35054
Gm25542-201
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BASIC
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□□□□□ -2.4
Cldn4
O35054
AC129019.2-201
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BASIC
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□□□□□ -2.4
Cldn4
O35054
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BASIC
0.04
□□□□□ -2.4
Cldn4
O35054
Gm24064-201
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BASIC
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□□□□□ -2.4
Cldn4
O35054
Snora26-201
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121 nt
BASIC
0.03
□□□□□ -2.4
Cldn4
O35054
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BASIC
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□□□□□ -2.4
Cldn4
O35054
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BASIC
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□□□□□ -2.4
Cldn4
O35054
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BASIC
0.03
□□□□□ -2.4
Cldn4
O35054
Gm38208-201
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BASIC
0.03
□□□□□ -2.4
Cldn4
O35054
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BASIC
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□□□□□ -2.4
Cldn4
O35054
Gm25644-201
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107 nt
BASIC
0.03
□□□□□ -2.4
Cldn4
O35054
Gm25522-201
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BASIC
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□□□□□ -2.41
Cldn4
O35054
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BASIC
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□□□□□ -2.41
Cldn4
O35054
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BASIC
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□□□□□ -2.41
Cldn4
O35054
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BASIC
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□□□□□ -2.41
Cldn4
O35054
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BASIC
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□□□□□ -2.41
Cldn4
O35054
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BASIC
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□□□□□ -2.41
Cldn4
O35054
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BASIC
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Cldn4
O35054
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BASIC
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Cldn4
O35054
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BASIC
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Cldn4
O35054
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BASIC
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O35054
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BASIC
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Cldn4
O35054
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BASIC
0
□□□□□ -2.41
Cldn4
O35054
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BASIC
0
□□□□□ -2.41
Cldn4
O35054
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BASIC
0
□□□□□ -2.41
Cldn4
O35054
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BASIC
0
□□□□□ -2.41
Cldn4
O35054
Gm25703-201
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151 nt
BASIC
0
□□□□□ -2.41
Cldn4
O35054
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BASIC
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□□□□□ -2.41
Cldn4
O35054
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BASIC
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□□□□□ -2.41
Cldn4
O35054
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BASIC
-0.03
□□□□□ -2.41
Cldn4
O35054
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BASIC
-0.03
□□□□□ -2.41
Cldn4
O35054
Gm43206-201
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114 nt
BASIC
-0.03
□□□□□ -2.41
Cldn4
O35054
Gm25681-201
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106 nt
BASIC
-0.03
□□□□□ -2.41
Cldn4
O35054
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BASIC
-0.04
□□□□□ -2.42
Cldn4
O35054
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91 nt
BASIC
-0.04
□□□□□ -2.42
Cldn4
O35054
Mir344-2-201
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BASIC
-0.04
□□□□□ -2.42
Cldn4
O35054
Gm24070-201
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BASIC
-0.05
□□□□□ -2.42
Cldn4
O35054
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93 nt
BASIC
-0.05
□□□□□ -2.42
Cldn4
O35054
Gm27977-201
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111 nt
BASIC
-0.05
□□□□□ -2.42
Cldn4
O35054
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75 nt
BASIC
-0.05
□□□□□ -2.42
Cldn4
O35054
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84 nt
BASIC
-0.05
□□□□□ -2.42
Cldn4
O35054
Mir672-201
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100 nt
BASIC
-0.06
□□□□□ -2.42
Cldn4
O35054
Gm25417-201
ENSMUST00000104212
131 nt
BASIC
-0.06
□□□□□ -2.42
Cldn4
O35054
Gm24843-201
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76 nt
BASIC
-0.06
□□□□□ -2.42
Cldn4
O35054
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78 nt
BASIC
-0.07
□□□□□ -2.42
Cldn4
O35054
Gm25186-201
ENSMUST00000083909
108 nt
BASIC
-0.07
□□□□□ -2.42
Cldn4
O35054
Gm25309-201
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126 nt
BASIC
-0.08
□□□□□ -2.42
Cldn4
O35054
Gm22077-201
ENSMUST00000157594
93 nt
BASIC
-0.08
□□□□□ -2.42
Cldn4
O35054
Gm22539-201
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117 nt
BASIC
-0.08
□□□□□ -2.42
Cldn4
O35054
Gm22087-201
ENSMUST00000158339
88 nt
BASIC
-0.08
□□□□□ -2.42
Cldn4
O35054
Gm25010-201
ENSMUST00000158403
65 nt
BASIC
-0.08
□□□□□ -2.42
Cldn4
O35054
Mir1950-201
ENSMUST00000158526
74 nt
BASIC
-0.08
□□□□□ -2.42
Cldn4
O35054
Ranbp2-ps1-201
ENSMUST00000184001
403 nt
BASIC
-0.08
□□□□□ -2.42
Cldn4
O35054
mt-Tl1-201
ENSMUST00000082391
75 nt
BASIC
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□□□□□ -2.42
Cldn4
O35054
Gm23817-201
ENSMUST00000158449
104 nt
BASIC
-0.09
□□□□□ -2.42
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