Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 Traj53-201ENSMUST00000103690 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.14□□□□□ -2.39
Cldn4O35054 Gm44932-201ENSMUST00000206799 121 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Cldn4O35054 Gm22454-201ENSMUST00000082583 107 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Cldn4O35054 AC154506.4-201ENSMUST00000224898 3416 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Cldn4O35054 Gm25022-201ENSMUST00000102205 83 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Cldn4O35054 Mir467a-6-201ENSMUST00000177790 83 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Cldn4O35054 Mir467a-3-201ENSMUST00000178082 83 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Cldn4O35054 Mir467a-7-201ENSMUST00000178635 83 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Cldn4O35054 Mir467a-10-201ENSMUST00000179320 83 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Cldn4O35054 Mir467a-5-201ENSMUST00000179352 83 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Cldn4O35054 Mir467a-2-201ENSMUST00000179447 83 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Cldn4O35054 Mir467a-9-201ENSMUST00000179752 83 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Cldn4O35054 Mir467a-4-201ENSMUST00000179923 83 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Cldn4O35054 Mir467a-8-201ENSMUST00000180070 83 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Cldn4O35054 CT571266.1-201ENSMUST00000222859 153 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Cldn4O35054 Gm25619-201ENSMUST00000122621 104 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Cldn4O35054 Gm23761-201ENSMUST00000158347 104 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Cldn4O35054 Gm24796-201ENSMUST00000104007 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Cldn4O35054 Gm25609-201ENSMUST00000104019 104 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Cldn4O35054 Gm27549-201ENSMUST00000183508 62 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Cldn4O35054 Mir126a-201ENSMUST00000083606 73 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Cldn4O35054 Gm24199-201ENSMUST00000157808 136 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Cldn4O35054 Mir363-201ENSMUST00000093598 75 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Cldn4O35054 Gm24381-201ENSMUST00000122697 104 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Cldn4O35054 Gm24868-201ENSMUST00000157265 136 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Cldn4O35054 Gm24077-201ENSMUST00000158183 136 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Cldn4O35054 Gm24134-201ENSMUST00000083361 71 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Cldn4O35054 Gm26104-201ENSMUST00000157250 108 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Cldn4O35054 Gm24903-201ENSMUST00000158131 126 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Cldn4O35054 Mir6904-201ENSMUST00000183443 67 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Cldn4O35054 Mir3967-201ENSMUST00000198710 68 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Cldn4O35054 Gm22805-201ENSMUST00000082739 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Cldn4O35054 Gm25275-201ENSMUST00000104297 129 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Cldn4O35054 Gm25964-201ENSMUST00000157171 97 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Cldn4O35054 Gm22962-201ENSMUST00000157962 73 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Cldn4O35054 Gm37750-201ENSMUST00000193563 129 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Cldn4O35054 Gm45655-201ENSMUST00000211625 160 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Cldn4O35054 Gm25296-201ENSMUST00000082566 67 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Cldn4O35054 Gm25112-201ENSMUST00000122680 104 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Cldn4O35054 Snord50a-201ENSMUST00000178154 72 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Cldn4O35054 Gm24463-201ENSMUST00000178417 72 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Cldn4O35054 Gm22455-201ENSMUST00000082580 71 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Cldn4O35054 Gm25061-201ENSMUST00000104665 107 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Cldn4O35054 Snord85-201ENSMUST00000083262 73 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Cldn4O35054 Gm22368-201ENSMUST00000102416 109 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Cldn4O35054 Gm25542-201ENSMUST00000116889 94 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Cldn4O35054 AC129019.2-201ENSMUST00000222063 202 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Cldn4O35054 Mir3071-201ENSMUST00000093621 80 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Cldn4O35054 Gm24064-201ENSMUST00000157486 106 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Cldn4O35054 Snora26-201ENSMUST00000175614 121 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Cldn4O35054 Gm25740-201ENSMUST00000180247 107 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Cldn4O35054 Gm27937-201ENSMUST00000183605 88 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Cldn4O35054 Mir7651-201ENSMUST00000184154 64 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Cldn4O35054 Gm38208-201ENSMUST00000192476 114 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Cldn4O35054 Gm22458-201ENSMUST00000082576 107 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Cldn4O35054 Gm25644-201ENSMUST00000083209 107 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Cldn4O35054 Gm25522-201ENSMUST00000158394 105 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Cldn4O35054 Gm22413-201ENSMUST00000175465 85 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Cldn4O35054 Gm45374-201ENSMUST00000211388 136 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Cldn4O35054 CT030166.3-201ENSMUST00000223203 193 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Cldn4O35054 Gm22827-201ENSMUST00000083766 107 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Cldn4O35054 Gm22838-201ENSMUST00000158437 99 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Cldn4O35054 Gm23159-201ENSMUST00000175088 77 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Cldn4O35054 Gm26499-201ENSMUST00000178544 79 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Cldn4O35054 Gm26096-201ENSMUST00000179084 79 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Cldn4O35054 Gm22459-201ENSMUST00000082577 108 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Cldn4O35054 Mir382-201ENSMUST00000083494 76 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Cldn4O35054 Gm23715-201ENSMUST00000157354 106 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Cldn4O35054 Mir7673-201ENSMUST00000184567 64 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Cldn4O35054 Gm25854-201ENSMUST00000082792 72 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Cldn4O35054 Gm23442-201ENSMUST00000082919 134 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Cldn4O35054 Gm25703-201ENSMUST00000083123 151 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Cldn4O35054 Mir6915-201ENSMUST00000198839 69 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Cldn4O35054 Mir741-201ENSMUST00000103931 71 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Cldn4O35054 Gm22327-201ENSMUST00000158899 108 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Cldn4O35054 Mir191-201ENSMUST00000196210 74 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Cldn4O35054 Gm43206-201ENSMUST00000197990 114 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Cldn4O35054 Gm25681-201ENSMUST00000083938 106 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Cldn4O35054 Gm26051-201ENSMUST00000104642 93 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Cldn4O35054 Gm26210-201ENSMUST00000158680 91 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Cldn4O35054 Mir344-2-201ENSMUST00000175446 80 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Cldn4O35054 Gm24070-201ENSMUST00000104519 130 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Cldn4O35054 Gm27987-201ENSMUST00000184023 93 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Cldn4O35054 Gm27977-201ENSMUST00000185159 111 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Cldn4O35054 Mir23a-201ENSMUST00000083677 75 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Cldn4O35054 Gm24256-201ENSMUST00000083696 84 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Cldn4O35054 Mir672-201ENSMUST00000102331 100 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Cldn4O35054 Gm25417-201ENSMUST00000104212 131 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Cldn4O35054 Gm24843-201ENSMUST00000158682 76 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Cldn4O35054 AL845349.1-201ENSMUST00000213794 78 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Cldn4O35054 Gm25186-201ENSMUST00000083909 108 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Cldn4O35054 Gm25309-201ENSMUST00000116728 126 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Cldn4O35054 Gm22077-201ENSMUST00000157594 93 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Cldn4O35054 Gm22539-201ENSMUST00000158167 117 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Cldn4O35054 Gm22087-201ENSMUST00000158339 88 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Cldn4O35054 Gm25010-201ENSMUST00000158403 65 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Cldn4O35054 Mir1950-201ENSMUST00000158526 74 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Cldn4O35054 Ranbp2-ps1-201ENSMUST00000184001 403 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Cldn4O35054 mt-Tl1-201ENSMUST00000082391 75 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Cldn4O35054 Gm23817-201ENSMUST00000158449 104 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 226.9 ms