Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Gm24219-201ENSMUST00000179861 79 ntBASIC-2,89□□□□□ -2,87
ApobE9Q414 Mir5117-201ENSMUST00000083226 84 ntBASIC-2,89□□□□□ -2,87
ApobE9Q414 Gm23504-201ENSMUST00000158988 95 ntBASIC-2,89□□□□□ -2,87
ApobE9Q414 Gm10351-201ENSMUST00000087694 125 ntBASIC-2,89□□□□□ -2,87
ApobE9Q414 Gm25681-201ENSMUST00000083938 106 ntBASIC-2,89□□□□□ -2,87
ApobE9Q414 Gm23191-201ENSMUST00000179147 107 ntBASIC-2,89□□□□□ -2,87
ApobE9Q414 Gm25859-201ENSMUST00000083710 91 ntBASIC-2,89□□□□□ -2,87
ApobE9Q414 Mir466f-3-201ENSMUST00000104788 94 ntBASIC-2,9□□□□□ -2,87
ApobE9Q414 Mir466f-2-201ENSMUST00000104805 94 ntBASIC-2,9□□□□□ -2,87
ApobE9Q414 Gm24729-201ENSMUST00000158225 137 ntBASIC-2,9□□□□□ -2,87
ApobE9Q414 Mir16-2-201ENSMUST00000083672 95 ntBASIC-2,9□□□□□ -2,87
ApobE9Q414 Mir181a-2-201ENSMUST00000083489 76 ntBASIC-2,9□□□□□ -2,87
ApobE9Q414 Gm24423-201ENSMUST00000101982 106 ntBASIC-2,91□□□□□ -2,87
ApobE9Q414 Gm27585-201ENSMUST00000183717 199 ntBASIC-2,91□□□□□ -2,88
ApobE9Q414 Gm25798-201ENSMUST00000082641 107 ntBASIC-2,91□□□□□ -2,88
ApobE9Q414 Gm26279-201ENSMUST00000157095 102 ntBASIC-2,91□□□□□ -2,88
ApobE9Q414 Mir3970-201ENSMUST00000199287 90 ntBASIC-2,91□□□□□ -2,88
ApobE9Q414 Mir146-201ENSMUST00000083667 65 ntBASIC-2,91□□□□□ -2,88
ApobE9Q414 Gm10972-201ENSMUST00000107276 81 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-2,92□□□□□ -2,88
ApobE9Q414 Gm22205-201ENSMUST00000122655 71 ntBASIC-2,92□□□□□ -2,88
ApobE9Q414 Gm25887-201ENSMUST00000157777 84 ntBASIC-2,92□□□□□ -2,88
ApobE9Q414 AC116589.3-202ENSMUST00000221770 649 ntBASIC-2,92□□□□□ -2,88
ApobE9Q414 AC116589.6-201ENSMUST00000222252 649 ntBASIC-2,92□□□□□ -2,88
ApobE9Q414 Mir876-201ENSMUST00000104659 81 ntBASIC-2,93□□□□□ -2,88
ApobE9Q414 Gm23988-201ENSMUST00000117034 122 ntBASIC-2,93□□□□□ -2,88
ApobE9Q414 Gm24946-201ENSMUST00000158332 106 ntBASIC-2,93□□□□□ -2,88
ApobE9Q414 Tmsb15b2-202ENSMUST00000180194 243 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC-2,93□□□□□ -2,88
ApobE9Q414 Gm23210-201ENSMUST00000158668 98 ntBASIC-2,94□□□□□ -2,88
ApobE9Q414 Gm22139-201ENSMUST00000158747 105 ntBASIC-2,94□□□□□ -2,88
ApobE9Q414 Gm8034-201ENSMUST00000178853 132 ntBASIC-2,94□□□□□ -2,88
ApobE9Q414 Gm25313-201ENSMUST00000101817 116 ntBASIC-2,94□□□□□ -2,88
ApobE9Q414 Gm25163-201ENSMUST00000158905 104 ntBASIC-2,94□□□□□ -2,88
ApobE9Q414 Gm22746-201ENSMUST00000082494 107 ntBASIC-2,94□□□□□ -2,88
ApobE9Q414 Rnu5g-201ENSMUST00000093721 116 ntBASIC-2,94□□□□□ -2,88
ApobE9Q414 Gm27686-201ENSMUST00000185123 91 ntBASIC-2,95□□□□□ -2,88
ApobE9Q414 Gm25696-201ENSMUST00000082900 105 ntBASIC-2,95□□□□□ -2,88
ApobE9Q414 Gm23262-201ENSMUST00000158323 168 ntBASIC-2,95□□□□□ -2,88
ApobE9Q414 Gm27671-201ENSMUST00000183739 66 ntBASIC-2,95□□□□□ -2,88
ApobE9Q414 Gm27539-201ENSMUST00000184971 224 ntBASIC-2,95□□□□□ -2,88
ApobE9Q414 Gm23016-201ENSMUST00000158431 62 ntBASIC-2,96□□□□□ -2,88
ApobE9Q414 Gm23573-201ENSMUST00000104408 107 ntBASIC-2,98□□□□□ -2,89
ApobE9Q414 AC140930.2-201ENSMUST00000221803 109 ntBASIC-2,98□□□□□ -2,89
ApobE9Q414 Gm24392-201ENSMUST00000158136 103 ntBASIC-2,99□□□□□ -2,89
ApobE9Q414 Gm24667-201ENSMUST00000158938 103 ntBASIC-2,99□□□□□ -2,89
ApobE9Q414 Gm24121-201ENSMUST00000102029 106 ntBASIC-2,99□□□□□ -2,89
ApobE9Q414 Mir881-201ENSMUST00000104844 78 ntBASIC-2,99□□□□□ -2,89
ApobE9Q414 Mir669a-7-201ENSMUST00000180364 87 ntBASIC-2,99□□□□□ -2,89
ApobE9Q414 Mir669a-6-201ENSMUST00000196127 87 ntBASIC-2,99□□□□□ -2,89
ApobE9Q414 Mir669a-12-201ENSMUST00000197274 87 ntBASIC-2,99□□□□□ -2,89
ApobE9Q414 Mir669a-5-201ENSMUST00000197439 87 ntBASIC-2,99□□□□□ -2,89
ApobE9Q414 Mir669a-10-201ENSMUST00000197745 87 ntBASIC-2,99□□□□□ -2,89
ApobE9Q414 Mir669a-11-201ENSMUST00000197952 87 ntBASIC-2,99□□□□□ -2,89
ApobE9Q414 Mir669a-4-201ENSMUST00000198665 87 ntBASIC-2,99□□□□□ -2,89
ApobE9Q414 Mir669a-9-201ENSMUST00000200087 87 ntBASIC-2,99□□□□□ -2,89
ApobE9Q414 Mir669a-8-201ENSMUST00000200268 87 ntBASIC-2,99□□□□□ -2,89
ApobE9Q414 Gm25316-201ENSMUST00000116826 118 ntBASIC-3□□□□□ -2,89
ApobE9Q414 Gm27755-201ENSMUST00000184623 132 ntBASIC-3□□□□□ -2,89
ApobE9Q414 Gm26425-201ENSMUST00000122529 82 ntBASIC-3□□□□□ -2,89
ApobE9Q414 Gm26466-201ENSMUST00000179615 79 ntBASIC-3□□□□□ -2,89
ApobE9Q414 Gm22070-201ENSMUST00000178475 107 ntBASIC-3,01□□□□□ -2,89
ApobE9Q414 Mir7231-201ENSMUST00000196252 61 ntBASIC-3,02□□□□□ -2,89
ApobE9Q414 Gm25985-201ENSMUST00000122677 107 ntBASIC-3,02□□□□□ -2,89
ApobE9Q414 Mir465c-2-201ENSMUST00000104757 81 ntBASIC-3,02□□□□□ -2,89
ApobE9Q414 Gm24393-201ENSMUST00000158135 97 ntBASIC-3,02□□□□□ -2,89
ApobE9Q414 Mir465c-1-201ENSMUST00000093560 81 ntBASIC-3,02□□□□□ -2,89
ApobE9Q414 Gm25586-201ENSMUST00000082499 112 ntBASIC-3,03□□□□□ -2,89
ApobE9Q414 Gm24316-201ENSMUST00000083041 107 ntBASIC-3,03□□□□□ -2,89
ApobE9Q414 Gm29817-201ENSMUST00000210098 172 ntBASIC-3,03□□□□□ -2,89
ApobE9Q414 Snord64-201ENSMUST00000104003 67 ntBASIC-3,04□□□□□ -2,9
ApobE9Q414 Gm26499-201ENSMUST00000178544 79 ntBASIC-3,04□□□□□ -2,9
ApobE9Q414 Gm26096-201ENSMUST00000179084 79 ntBASIC-3,04□□□□□ -2,9
ApobE9Q414 Gm23947-201ENSMUST00000093636 107 ntBASIC-3,04□□□□□ -2,9
ApobE9Q414 Gm25978-201ENSMUST00000158698 90 ntBASIC-3,05□□□□□ -2,9
ApobE9Q414 Gm25326-201ENSMUST00000101903 107 ntBASIC-3,05□□□□□ -2,9
ApobE9Q414 Gm45002-201ENSMUST00000208045 120 ntBASIC-3,05□□□□□ -2,9
ApobE9Q414 Gm24947-201ENSMUST00000158334 110 ntBASIC-3,05□□□□□ -2,9
ApobE9Q414 Mir15b-201ENSMUST00000083646 64 ntBASIC-3,05□□□□□ -2,9
ApobE9Q414 Gm22733-201ENSMUST00000158094 91 ntBASIC-3,06□□□□□ -2,9
ApobE9Q414 Gm25087-201ENSMUST00000101992 78 ntBASIC-3,07□□□□□ -2,9
ApobE9Q414 Gm22965-201ENSMUST00000157958 101 ntBASIC-3,07□□□□□ -2,9
ApobE9Q414 Gm26467-201ENSMUST00000097257 78 ntBASIC-3,07□□□□□ -2,9
ApobE9Q414 Snord78-201ENSMUST00000104032 66 ntBASIC-3,07□□□□□ -2,9
ApobE9Q414 n-R5s214-201ENSMUST00000122494 121 ntBASIC-3,07□□□□□ -2,9
ApobE9Q414 Gm26026-201ENSMUST00000122726 123 ntBASIC-3,07□□□□□ -2,9
ApobE9Q414 CT030170.1-201ENSMUST00000222183 148 ntBASIC-3,07□□□□□ -2,9
ApobE9Q414 Gm37545-201ENSMUST00000186512 148 ntBASIC-3,08□□□□□ -2,9
ApobE9Q414 AC167192.1-201ENSMUST00000225908 139 ntBASIC-3,08□□□□□ -2,9
ApobE9Q414 Gm25579-201ENSMUST00000083407 106 ntBASIC-3,08□□□□□ -2,9
ApobE9Q414 AC238676.2-201ENSMUST00000220910 94 ntBASIC-3,08□□□□□ -2,9
ApobE9Q414 Mir466b-2-201ENSMUST00000103778 82 ntBASIC-3,09□□□□□ -2,9
ApobE9Q414 Gm12815-201ENSMUST00000121737 135 ntBASIC-3,09□□□□□ -2,9
ApobE9Q414 Gm22977-201ENSMUST00000082615 107 ntBASIC-3,09□□□□□ -2,9
ApobE9Q414 Gm24754-201ENSMUST00000177997 107 ntBASIC-3,11□□□□□ -2,91
ApobE9Q414 Gm25404-201ENSMUST00000082970 107 ntBASIC-3,11□□□□□ -2,91
ApobE9Q414 Gm43238-201ENSMUST00000196463 359 ntBASIC-3,12□□□□□ -2,91
ApobE9Q414 AC192333.2-201ENSMUST00000224771 196 ntBASIC-3,12□□□□□ -2,91
ApobE9Q414 AC165138.1-201ENSMUST00000226984 270 ntBASIC-3,12□□□□□ -2,91
ApobE9Q414 Mir664-201ENSMUST00000196796 69 ntBASIC-3,12□□□□□ -2,91
ApobE9Q414 Gm24183-201ENSMUST00000122572 93 ntBASIC-3,12□□□□□ -2,91
ApobE9Q414 Gm25929-201ENSMUST00000082784 107 ntBASIC-3,12□□□□□ -2,91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23,8 ms