Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GSB3

Gm3880, Predicted pseudogene 3880, mousemouse

Predictions only

Length 72 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm25626-201ENSMUST00000177631 107 ntBASIC-1,15□□□□□ -2,59
Gm3880A0A1B0GSB3 Mir494-201ENSMUST00000093632 85 ntBASIC-1,15□□□□□ -2,59
Gm3880A0A1B0GSB3 Mir466b-3-201ENSMUST00000103806 81 ntBASIC-1,16□□□□□ -2,6
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm23651-201ENSMUST00000116755 120 ntBASIC-1,16□□□□□ -2,6
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm25316-201ENSMUST00000116826 118 ntBASIC-1,16□□□□□ -2,6
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm24400-201ENSMUST00000157865 107 ntBASIC-1,16□□□□□ -2,6
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm23316-201ENSMUST00000157997 114 ntBASIC-1,16□□□□□ -2,6
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm22770-201ENSMUST00000158368 67 ntBASIC-1,16□□□□□ -2,6
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm23864-201ENSMUST00000177607 107 ntBASIC-1,16□□□□□ -2,6
Gm3880A0A1B0GSB3 Mir8090-201ENSMUST00000185078 136 ntBASIC-1,16□□□□□ -2,6
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm44470-201ENSMUST00000203913 142 ntBASIC-1,16□□□□□ -2,6
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm45688-201ENSMUST00000210002 101 ntBASIC-1,16□□□□□ -2,6
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm25641-201ENSMUST00000175135 108 ntBASIC-1,17□□□□□ -2,6
Gm3880A0A1B0GSB3 Mir6375-201ENSMUST00000197176 95 ntBASIC-1,17□□□□□ -2,6
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm42844-201ENSMUST00000200355 112 ntBASIC-1,17□□□□□ -2,6
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm25417-201ENSMUST00000104212 131 ntBASIC-1,18□□□□□ -2,6
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm23434-201ENSMUST00000157179 100 ntBASIC-1,18□□□□□ -2,6
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm26104-201ENSMUST00000157250 108 ntBASIC-1,18□□□□□ -2,6
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm25493-201ENSMUST00000157375 103 ntBASIC-1,18□□□□□ -2,6
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm24775-201ENSMUST00000157377 99 ntBASIC-1,18□□□□□ -2,6
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm27332-201ENSMUST00000184893 112 ntBASIC-1,18□□□□□ -2,6
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm27554-201ENSMUST00000185074 98 ntBASIC-1,18□□□□□ -2,6
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm37746-201ENSMUST00000193249 198 ntBASIC-1,18□□□□□ -2,6
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm22258-201ENSMUST00000177645 94 ntBASIC-1,19□□□□□ -2,6
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm26032-201ENSMUST00000178535 94 ntBASIC-1,19□□□□□ -2,6
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm25210-201ENSMUST00000178813 94 ntBASIC-1,19□□□□□ -2,6
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm25157-201ENSMUST00000178914 94 ntBASIC-1,19□□□□□ -2,6
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm22046-201ENSMUST00000179027 94 ntBASIC-1,19□□□□□ -2,6
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm22941-201ENSMUST00000179630 94 ntBASIC-1,19□□□□□ -2,6
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm25471-201ENSMUST00000180126 94 ntBASIC-1,19□□□□□ -2,6
Gm3880A0A1B0GSB3 Mir451b-201ENSMUST00000196157 72 ntBASIC-1,19□□□□□ -2,6
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm24162-201ENSMUST00000093665 102 ntBASIC-1,19□□□□□ -2,6
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm25609-201ENSMUST00000104019 104 ntBASIC-1,2□□□□□ -2,6
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm24916-201ENSMUST00000157287 79 ntBASIC-1,2□□□□□ -2,6
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm24750-201ENSMUST00000157843 104 ntBASIC-1,2□□□□□ -2,6
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm22605-201ENSMUST00000158289 108 ntBASIC-1,2□□□□□ -2,6
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm22430-201ENSMUST00000158546 107 ntBASIC-1,2□□□□□ -2,6
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm22973-201ENSMUST00000083298 191 ntBASIC-1,2□□□□□ -2,6
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm26421-201ENSMUST00000104279 132 ntBASIC-1,21□□□□□ -2,6
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm22677-201ENSMUST00000116977 108 ntBASIC-1,21□□□□□ -2,6
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm26337-201ENSMUST00000178000 79 ntBASIC-1,21□□□□□ -2,6
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm17522-202ENSMUST00000186631 174 ntTSL 1 (best) BASIC-1,21□□□□□ -2,6
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm17412-202ENSMUST00000189566 174 ntTSL 1 (best) BASIC-1,21□□□□□ -2,6
Gm3880A0A1B0GSB3 Igkv13-78-1-201ENSMUST00000199298 200 ntBASIC-1,21□□□□□ -2,6
Gm3880A0A1B0GSB3 mt-Tt-201ENSMUST00000082422 67 ntBASIC-1,21□□□□□ -2,6
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm25696-201ENSMUST00000082900 105 ntBASIC-1,21□□□□□ -2,6
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm25565-201ENSMUST00000104605 105 ntBASIC-1,22□□□□□ -2,6
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm26425-201ENSMUST00000122529 82 ntBASIC-1,22□□□□□ -2,6
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm24637-201ENSMUST00000158674 85 ntBASIC-1,22□□□□□ -2,6
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm23922-201ENSMUST00000178792 79 ntBASIC-1,22□□□□□ -2,6
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm24657-201ENSMUST00000180085 79 ntBASIC-1,22□□□□□ -2,6
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm22996-201ENSMUST00000180236 79 ntBASIC-1,22□□□□□ -2,6
Gm3880A0A1B0GSB3 AC164561.1-201ENSMUST00000220414 115 ntBASIC-1,22□□□□□ -2,6
Gm3880A0A1B0GSB3 AC158537.2-201ENSMUST00000223575 150 ntBASIC-1,22□□□□□ -2,6
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm24459-201ENSMUST00000082730 86 ntBASIC-1,22□□□□□ -2,6
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm25497-201ENSMUST00000104425 132 ntBASIC-1,23□□□□□ -2,61
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm27975-201ENSMUST00000184400 101 ntBASIC-1,23□□□□□ -2,61
Gm3880A0A1B0GSB3 AC122327.1-201ENSMUST00000220778 108 ntBASIC-1,23□□□□□ -2,61
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm23970-201ENSMUST00000083319 107 ntBASIC-1,23□□□□□ -2,61
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm25496-201ENSMUST00000104430 120 ntBASIC-1,24□□□□□ -2,61
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm24988-201ENSMUST00000104460 121 ntBASIC-1,24□□□□□ -2,61
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm11084-201ENSMUST00000112062 69 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-1,24□□□□□ -2,61
Gm3880A0A1B0GSB3 Mir1969-201ENSMUST00000157623 94 ntBASIC-1,24□□□□□ -2,61
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm25601-201ENSMUST00000158356 105 ntBASIC-1,24□□□□□ -2,61
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm22621-201ENSMUST00000179678 74 ntBASIC-1,24□□□□□ -2,61
Gm3880A0A1B0GSB3 Mir7086-201ENSMUST00000183683 65 ntBASIC-1,24□□□□□ -2,61
Gm3880A0A1B0GSB3 Olfr1041-ps1-201ENSMUST00000215884 271 ntBASIC-1,24□□□□□ -2,61
Gm3880A0A1B0GSB3 mt-Tv-201ENSMUST00000082389 69 ntBASIC-1,24□□□□□ -2,61
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm22016-201ENSMUST00000158793 114 ntBASIC-1,25□□□□□ -2,61
Gm3880A0A1B0GSB3 AC161271.1-201ENSMUST00000226914 150 ntBASIC-1,25□□□□□ -2,61
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm26454-201ENSMUST00000082682 107 ntBASIC-1,25□□□□□ -2,61
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm24445-201ENSMUST00000083981 107 ntBASIC-1,25□□□□□ -2,61
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm24946-201ENSMUST00000158332 106 ntBASIC-1,26□□□□□ -2,61
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm23306-201ENSMUST00000179058 105 ntBASIC-1,26□□□□□ -2,61
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm25449-201ENSMUST00000179389 79 ntBASIC-1,26□□□□□ -2,61
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm26225-201ENSMUST00000082508 135 ntBASIC-1,26□□□□□ -2,61
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm25071-201ENSMUST00000175232 70 ntBASIC-1,28□□□□□ -2,61
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm26499-201ENSMUST00000178544 79 ntBASIC-1,28□□□□□ -2,61
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm26096-201ENSMUST00000179084 79 ntBASIC-1,28□□□□□ -2,61
Gm3880A0A1B0GSB3 Mir7231-201ENSMUST00000196252 61 ntBASIC-1,28□□□□□ -2,61
Gm3880A0A1B0GSB3 Mir122-201ENSMUST00000083468 66 ntBASIC-1,28□□□□□ -2,61
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm10351-201ENSMUST00000087694 125 ntBASIC-1,28□□□□□ -2,61
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm23988-201ENSMUST00000117034 122 ntBASIC-1,29□□□□□ -2,62
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm25646-201ENSMUST00000178527 79 ntBASIC-1,29□□□□□ -2,62
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm22464-201ENSMUST00000175273 64 ntBASIC-1,3□□□□□ -2,62
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm25248-201ENSMUST00000175473 98 ntBASIC-1,3□□□□□ -2,62
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm22490-201ENSMUST00000157188 119 ntBASIC-1,31□□□□□ -2,62
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm22011-201ENSMUST00000158790 123 ntBASIC-1,31□□□□□ -2,62
Gm3880A0A1B0GSB3 Trgj1-201ENSMUST00000200495 60 ntAPPRIS P1 BASIC-1,31□□□□□ -2,62
Gm3880A0A1B0GSB3 AC122210.2-201ENSMUST00000220216 115 ntBASIC-1,31□□□□□ -2,62
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm22805-201ENSMUST00000082739 107 ntBASIC-1,31□□□□□ -2,62
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm22149-201ENSMUST00000104442 136 ntBASIC-1,32□□□□□ -2,62
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm26253-201ENSMUST00000122493 103 ntBASIC-1,32□□□□□ -2,62
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm23468-201ENSMUST00000157125 108 ntBASIC-1,32□□□□□ -2,62
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm23590-201ENSMUST00000157661 104 ntBASIC-1,32□□□□□ -2,62
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm22070-201ENSMUST00000178475 107 ntBASIC-1,32□□□□□ -2,62
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm21836-201ENSMUST00000178787 63 ntAPPRIS P1 BASIC-1,32□□□□□ -2,62
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm27928-201ENSMUST00000183747 256 ntBASIC-1,32□□□□□ -2,62
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm2077-201ENSMUST00000195017 319 ntBASIC-1,32□□□□□ -2,62
Gm3880A0A1B0GSB3 Traj33-201ENSMUST00000103708 57 ntAPPRIS P1 BASIC-1,33□□□□□ -2,62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13,1 ms