Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKU8

Lmx1a, LIM homeobox transcription factor 1-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmx1aQ9JKU8 Gm26233-201ENSMUST00000175530 70 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
Lmx1aQ9JKU8 Gm27928-201ENSMUST00000183747 256 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
Lmx1aQ9JKU8 Gm45429-201ENSMUST00000209527 172 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
Lmx1aQ9JKU8 Gm23726-201ENSMUST00000178937 67 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
Lmx1aQ9JKU8 Mir677-202ENSMUST00000197076 78 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
Lmx1aQ9JKU8 Gm24704-201ENSMUST00000093715 107 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
Lmx1aQ9JKU8 Mir466b-3-201ENSMUST00000103806 81 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
Lmx1aQ9JKU8 Gm43324-201ENSMUST00000197482 289 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
Lmx1aQ9JKU8 Gm26456-201ENSMUST00000082831 111 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
Lmx1aQ9JKU8 Mir669m-1-201ENSMUST00000158945 98 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
Lmx1aQ9JKU8 Gm44470-201ENSMUST00000203913 142 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
Lmx1aQ9JKU8 Gm22938-201ENSMUST00000103956 120 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
Lmx1aQ9JKU8 Mir6961-201ENSMUST00000183874 67 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
Lmx1aQ9JKU8 Mir3071-201ENSMUST00000093621 80 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
Lmx1aQ9JKU8 Snord70-201ENSMUST00000104157 87 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
Lmx1aQ9JKU8 Gm26018-201ENSMUST00000104406 128 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
Lmx1aQ9JKU8 Snord72-201ENSMUST00000104549 81 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
Lmx1aQ9JKU8 Gm23651-201ENSMUST00000116755 120 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
Lmx1aQ9JKU8 Gm24971-201ENSMUST00000175581 110 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
Lmx1aQ9JKU8 Mir6237-201ENSMUST00000183808 91 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
Lmx1aQ9JKU8 Traj53-201ENSMUST00000103690 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.8□□□□□ -2.54
Lmx1aQ9JKU8 Mir466f-1-201ENSMUST00000104779 94 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
Lmx1aQ9JKU8 Gm25425-201ENSMUST00000157611 96 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
Lmx1aQ9JKU8 Gm38298-201ENSMUST00000193578 118 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
Lmx1aQ9JKU8 Mir23a-201ENSMUST00000083677 75 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
Lmx1aQ9JKU8 Gm19248-201ENSMUST00000209404 110 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
Lmx1aQ9JKU8 Mir302c-201ENSMUST00000083548 68 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
Lmx1aQ9JKU8 Gm37832-201ENSMUST00000118935 189 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
Lmx1aQ9JKU8 Gm25622-201ENSMUST00000157217 104 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
Lmx1aQ9JKU8 Gm23072-201ENSMUST00000158243 123 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
Lmx1aQ9JKU8 Gm26337-201ENSMUST00000178000 79 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
Lmx1aQ9JKU8 Gm23494-201ENSMUST00000116830 126 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
Lmx1aQ9JKU8 Gm27784-201ENSMUST00000184926 113 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
Lmx1aQ9JKU8 mt-Tt-201ENSMUST00000082422 67 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
Lmx1aQ9JKU8 Gm24091-201ENSMUST00000082550 83 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
Lmx1aQ9JKU8 Gm22055-201ENSMUST00000083388 107 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
Lmx1aQ9JKU8 Gm23711-201ENSMUST00000083856 83 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
Lmx1aQ9JKU8 Gm10351-201ENSMUST00000087694 125 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
Lmx1aQ9JKU8 Gm12086-201ENSMUST00000120863 228 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
Lmx1aQ9JKU8 Gm24108-201ENSMUST00000175495 77 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
Lmx1aQ9JKU8 Gm23216-201ENSMUST00000179545 107 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
Lmx1aQ9JKU8 Mir7673-201ENSMUST00000184567 64 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
Lmx1aQ9JKU8 Gm44322-201ENSMUST00000196830 115 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
Lmx1aQ9JKU8 AC140930.2-201ENSMUST00000221803 109 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
Lmx1aQ9JKU8 Gm24918-201ENSMUST00000083022 130 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
Lmx1aQ9JKU8 Gm23922-201ENSMUST00000178792 79 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
Lmx1aQ9JKU8 Gm24657-201ENSMUST00000180085 79 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
Lmx1aQ9JKU8 Gm22996-201ENSMUST00000180236 79 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
Lmx1aQ9JKU8 Gm27549-201ENSMUST00000183508 62 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
Lmx1aQ9JKU8 Gm42773-201ENSMUST00000196962 148 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
Lmx1aQ9JKU8 mt-Atp8-201ENSMUST00000082407 204 ntAPPRIS P1 BASIC-0.85□□□□□ -2.55
Lmx1aQ9JKU8 Mir7-1-201ENSMUST00000083500 108 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
Lmx1aQ9JKU8 Gm24047-201ENSMUST00000102405 104 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
Lmx1aQ9JKU8 Gm25943-201ENSMUST00000103791 90 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
Lmx1aQ9JKU8 Mir466b-7-201ENSMUST00000103804 88 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
Lmx1aQ9JKU8 Mir466b-5-201ENSMUST00000103900 88 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
Lmx1aQ9JKU8 Gm23904-201ENSMUST00000157567 124 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
Lmx1aQ9JKU8 Mir466b-4-201ENSMUST00000178801 90 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
Lmx1aQ9JKU8 Gm25285-201ENSMUST00000178951 90 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
Lmx1aQ9JKU8 Gm23308-201ENSMUST00000179475 107 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
Lmx1aQ9JKU8 Mir466b-6-201ENSMUST00000180061 90 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
Lmx1aQ9JKU8 Mir466c-2-201ENSMUST00000180211 90 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
Lmx1aQ9JKU8 Gm23199-201ENSMUST00000158812 107 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
Lmx1aQ9JKU8 Gm26291-201ENSMUST00000158889 137 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
Lmx1aQ9JKU8 Gm25071-201ENSMUST00000175232 70 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
Lmx1aQ9JKU8 Gm24801-201ENSMUST00000178503 105 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
Lmx1aQ9JKU8 AC165138.1-201ENSMUST00000226984 270 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
Lmx1aQ9JKU8 Gm22305-201ENSMUST00000082690 108 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
Lmx1aQ9JKU8 Mir369-201ENSMUST00000083627 79 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
Lmx1aQ9JKU8 Gm22165-201ENSMUST00000158414 103 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
Lmx1aQ9JKU8 Gm26109-201ENSMUST00000083970 70 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
Lmx1aQ9JKU8 Gm24590-201ENSMUST00000116699 119 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
Lmx1aQ9JKU8 Gm23812-201ENSMUST00000175156 84 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
Lmx1aQ9JKU8 Gm23374-201ENSMUST00000175408 84 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
Lmx1aQ9JKU8 Gm27639-201ENSMUST00000184937 85 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
Lmx1aQ9JKU8 Gm44353-201ENSMUST00000200618 138 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
Lmx1aQ9JKU8 Traj43-201ENSMUST00000103699 57 ntAPPRIS P1 BASIC-0.9□□□□□ -2.55
Lmx1aQ9JKU8 Gm23166-201ENSMUST00000157164 101 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
Lmx1aQ9JKU8 Gm25653-201ENSMUST00000158473 138 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
Lmx1aQ9JKU8 Gm23017-201ENSMUST00000177583 72 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
Lmx1aQ9JKU8 Igkv13-78-1-201ENSMUST00000199298 200 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
Lmx1aQ9JKU8 Gm25401-201ENSMUST00000082975 106 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
Lmx1aQ9JKU8 Gm25991-201ENSMUST00000102439 99 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
Lmx1aQ9JKU8 Cyp2j7-ps1-201ENSMUST00000122430 173 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
Lmx1aQ9JKU8 Gm22459-201ENSMUST00000082577 108 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
Lmx1aQ9JKU8 Gm26412-201ENSMUST00000157666 55 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
Lmx1aQ9JKU8 Gm25712-201ENSMUST00000158634 93 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
Lmx1aQ9JKU8 Gm22140-201ENSMUST00000158745 120 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
Lmx1aQ9JKU8 Gm22013-201ENSMUST00000158788 103 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
Lmx1aQ9JKU8 Gm25870-201ENSMUST00000179845 79 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
Lmx1aQ9JKU8 Gm27263-201ENSMUST00000184760 76 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
Lmx1aQ9JKU8 Gm45655-201ENSMUST00000211625 160 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
Lmx1aQ9JKU8 Gm25225-201ENSMUST00000158197 102 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
Lmx1aQ9JKU8 Gm25440-201ENSMUST00000158279 154 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
Lmx1aQ9JKU8 Gm25010-201ENSMUST00000158403 65 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
Lmx1aQ9JKU8 Mir7055-201ENSMUST00000197423 59 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
Lmx1aQ9JKU8 Gm26054-201ENSMUST00000083037 107 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
Lmx1aQ9JKU8 Zfp813-ps-201ENSMUST00000186652 2506 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
Lmx1aQ9JKU8 Gm23607-201ENSMUST00000104550 126 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
Lmx1aQ9JKU8 Gm22195-201ENSMUST00000116861 108 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 192.4 ms