Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Scarna3a-201ENSMUST00000158911 140 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RpainQ9CWY9 Gm24271-201ENSMUST00000102327 111 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RpainQ9CWY9 Gm29432-201ENSMUST00000185397 139 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RpainQ9CWY9 Snord45b-201ENSMUST00000082797 71 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RpainQ9CWY9 Mir494-201ENSMUST00000093632 85 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RpainQ9CWY9 Mir297-1-201ENSMUST00000103800 76 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RpainQ9CWY9 Mir6394-201ENSMUST00000184738 99 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RpainQ9CWY9 Gm45655-201ENSMUST00000211625 160 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RpainQ9CWY9 Gm13065-201ENSMUST00000119178 141 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RpainQ9CWY9 Gm23340-201ENSMUST00000158955 123 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RpainQ9CWY9 Mir3079-201ENSMUST00000175428 90 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RpainQ9CWY9 Gm24342-201ENSMUST00000103907 104 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RpainQ9CWY9 Gm23012-201ENSMUST00000104149 83 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RpainQ9CWY9 Gm23708-201ENSMUST00000104367 123 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RpainQ9CWY9 Gm23989-201ENSMUST00000117030 66 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RpainQ9CWY9 Gm22233-201ENSMUST00000157464 114 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RpainQ9CWY9 Gm25868-201ENSMUST00000158253 114 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RpainQ9CWY9 Gm24020-201ENSMUST00000180156 108 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RpainQ9CWY9 Gm25705-201ENSMUST00000083119 104 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RpainQ9CWY9 Gm22652-201ENSMUST00000083207 131 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RpainQ9CWY9 Mir196b-201ENSMUST00000083509 85 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RpainQ9CWY9 Gm25496-201ENSMUST00000104430 120 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RpainQ9CWY9 Gm10974-201ENSMUST00000107486 126 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
RpainQ9CWY9 Gm24226-201ENSMUST00000158826 97 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RpainQ9CWY9 Gm25300-201ENSMUST00000175284 84 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RpainQ9CWY9 Gm27717-201ENSMUST00000183933 151 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RpainQ9CWY9 Gm5581-201ENSMUST00000072940 2550 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RpainQ9CWY9 Gm24233-201ENSMUST00000104317 122 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RpainQ9CWY9 Gm23853-201ENSMUST00000158375 104 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RpainQ9CWY9 Gm25768-201ENSMUST00000158570 98 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RpainQ9CWY9 Mir344-201ENSMUST00000083634 95 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RpainQ9CWY9 Gm43885-201ENSMUST00000204928 2542 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RpainQ9CWY9 Mir669h-201ENSMUST00000116944 125 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RpainQ9CWY9 Mir6985-201ENSMUST00000184641 61 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RpainQ9CWY9 Gm26438-201ENSMUST00000082593 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RpainQ9CWY9 Snord95-201ENSMUST00000082846 68 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RpainQ9CWY9 Gm22520-201ENSMUST00000158269 129 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RpainQ9CWY9 Gm22565-201ENSMUST00000175540 69 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RpainQ9CWY9 Mir6380-201ENSMUST00000184334 81 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RpainQ9CWY9 Gm27554-201ENSMUST00000185074 98 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RpainQ9CWY9 AC157278.1-201ENSMUST00000221621 148 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RpainQ9CWY9 Mir219a-2-201ENSMUST00000083551 97 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RpainQ9CWY9 n-R5s157-201ENSMUST00000122543 121 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RpainQ9CWY9 Gm24942-201ENSMUST00000158328 114 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RpainQ9CWY9 Vmn1r-ps69-201ENSMUST00000172759 201 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RpainQ9CWY9 Gm38274-201ENSMUST00000195689 148 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RpainQ9CWY9 Gm42506-201ENSMUST00000202009 150 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RpainQ9CWY9 Gm44211-201ENSMUST00000204867 145 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RpainQ9CWY9 Gm25683-201ENSMUST00000083940 131 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RpainQ9CWY9 Gm23416-201ENSMUST00000175520 95 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RpainQ9CWY9 Gm27937-201ENSMUST00000183605 88 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RpainQ9CWY9 Mir7663-201ENSMUST00000183950 61 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RpainQ9CWY9 Mir7673-201ENSMUST00000184567 64 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RpainQ9CWY9 Gm27977-201ENSMUST00000185159 111 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RpainQ9CWY9 Mir876-201ENSMUST00000104659 81 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RpainQ9CWY9 Gm25715-201ENSMUST00000158627 125 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RpainQ9CWY9 Mir15b-201ENSMUST00000083646 64 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RpainQ9CWY9 n-R5s12-201ENSMUST00000083785 119 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RpainQ9CWY9 Gm25183-201ENSMUST00000157752 106 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RpainQ9CWY9 Gm25641-201ENSMUST00000175135 108 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RpainQ9CWY9 Gm23649-201ENSMUST00000179007 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RpainQ9CWY9 Mir6381-201ENSMUST00000183426 87 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RpainQ9CWY9 Gm42533-201ENSMUST00000196247 157 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RpainQ9CWY9 Gm44458-201ENSMUST00000196594 143 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RpainQ9CWY9 Gm25138-201ENSMUST00000083248 136 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RpainQ9CWY9 Gm25128-201ENSMUST00000083339 76 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RpainQ9CWY9 Gm26257-201ENSMUST00000122500 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RpainQ9CWY9 Gm25055-201ENSMUST00000157369 76 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RpainQ9CWY9 Gm22087-201ENSMUST00000158339 88 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RpainQ9CWY9 Mir3070a-201ENSMUST00000175468 89 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RpainQ9CWY9 Gm21954-201ENSMUST00000179544 51 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
RpainQ9CWY9 Gm22459-201ENSMUST00000082577 108 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RpainQ9CWY9 Zfp654-201ENSMUST00000052588 4741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
RpainQ9CWY9 Vmn1r75-202ENSMUST00000226622 6638 ntAPPRIS P2 BASIC1.04□□□□□ -2.24
RpainQ9CWY9 Gm382-201ENSMUST00000096332 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
RpainQ9CWY9 Gm27450-201ENSMUST00000104632 90 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RpainQ9CWY9 Gm23893-201ENSMUST00000158106 134 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RpainQ9CWY9 Mir15a-201ENSMUST00000175266 84 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RpainQ9CWY9 Mir7010-201ENSMUST00000183464 63 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RpainQ9CWY9 Gm42677-201ENSMUST00000196363 127 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RpainQ9CWY9 Mir22-201ENSMUST00000083595 95 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RpainQ9CWY9 Gm24431-201ENSMUST00000104073 66 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RpainQ9CWY9 Gm27974-201ENSMUST00000183415 105 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RpainQ9CWY9 Gm23347-201ENSMUST00000083823 82 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RpainQ9CWY9 Mir3071-201ENSMUST00000093621 80 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RpainQ9CWY9 Gm14533-201ENSMUST00000117088 93 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RpainQ9CWY9 n-R5s6-201ENSMUST00000122663 88 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RpainQ9CWY9 Gm23072-201ENSMUST00000158243 123 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RpainQ9CWY9 Gm25656-201ENSMUST00000158466 66 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RpainQ9CWY9 Gm24927-201ENSMUST00000083397 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RpainQ9CWY9 Gm25894-201ENSMUST00000083458 75 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RpainQ9CWY9 Gm25652-201ENSMUST00000083780 103 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RpainQ9CWY9 Gm24701-201ENSMUST00000101946 105 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RpainQ9CWY9 Gm24288-201ENSMUST00000157630 144 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RpainQ9CWY9 Gm25506-201ENSMUST00000104339 70 ntBASIC1□□□□□ -2.25
RpainQ9CWY9 Gm44301-201ENSMUST00000200362 143 ntBASIC1□□□□□ -2.25
RpainQ9CWY9 Gm22078-201ENSMUST00000157593 103 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
RpainQ9CWY9 CT030170.1-201ENSMUST00000222183 148 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
RpainQ9CWY9 Gm26338-201ENSMUST00000102372 110 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
RpainQ9CWY9 Gm22039-201ENSMUST00000157278 132 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 410.5 ms