Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Gm22717-201ENSMUST00000122703 171 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Rpusd2Q149F1 Gm24288-201ENSMUST00000157630 144 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Rpusd2Q149F1 Gm23714-201ENSMUST00000179259 105 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Rpusd2Q149F1 Gm23730-201ENSMUST00000083236 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Rpusd2Q149F1 Gm24612-201ENSMUST00000083267 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Rpusd2Q149F1 Gm25055-201ENSMUST00000157369 76 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Rpusd2Q149F1 Gm23122-201ENSMUST00000157645 103 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Rpusd2Q149F1 Gm25465-201ENSMUST00000157716 105 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Rpusd2Q149F1 Mir7010-201ENSMUST00000183464 63 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Rpusd2Q149F1 Gm23267-201ENSMUST00000178490 132 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Rpusd2Q149F1 Gm42533-201ENSMUST00000196247 157 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Rpusd2Q149F1 AC139186.1-201ENSMUST00000197610 94 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Rpusd2Q149F1 Gm29344-201ENSMUST00000068143 210 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Rpusd2Q149F1 Gm25128-201ENSMUST00000083339 76 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Rpusd2Q149F1 Gm25524-201ENSMUST00000101821 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Rpusd2Q149F1 Vmn1r-ps69-201ENSMUST00000172759 201 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Rpusd2Q149F1 Gm24942-201ENSMUST00000158328 114 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Rpusd2Q149F1 Gm25715-201ENSMUST00000158627 125 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Rpusd2Q149F1 AC160976.1-201ENSMUST00000215092 148 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Rpusd2Q149F1 Gm25138-201ENSMUST00000083248 136 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Rpusd2Q149F1 Mir3071-201ENSMUST00000093621 80 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Rpusd2Q149F1 Gm27980-201ENSMUST00000184094 169 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Rpusd2Q149F1 Gm24070-201ENSMUST00000104519 130 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Rpusd2Q149F1 n-R5s6-201ENSMUST00000122663 88 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Rpusd2Q149F1 Gm39149-201ENSMUST00000210258 186 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
Rpusd2Q149F1 Gm26338-201ENSMUST00000102372 110 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Rpusd2Q149F1 Gm11084-201ENSMUST00000112062 69 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
Rpusd2Q149F1 Scarna3b-201ENSMUST00000157533 139 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Rpusd2Q149F1 Gm23221-201ENSMUST00000158118 93 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Rpusd2Q149F1 Mir15a-201ENSMUST00000175266 84 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Rpusd2Q149F1 Gm27326-201ENSMUST00000183504 95 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Rpusd2Q149F1 Mir3070a-201ENSMUST00000175468 89 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Rpusd2Q149F1 Mir7665-201ENSMUST00000184907 63 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Rpusd2Q149F1 Olfr1253-204ENSMUST00000215988 6332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
Rpusd2Q149F1 Gm23590-201ENSMUST00000157661 104 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Rpusd2Q149F1 Gm24400-201ENSMUST00000157865 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Rpusd2Q149F1 Gm24321-201ENSMUST00000175348 80 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Rpusd2Q149F1 Gm25010-201ENSMUST00000158403 65 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Rpusd2Q149F1 Gm22401-201ENSMUST00000174927 117 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Rpusd2Q149F1 Gm22595-201ENSMUST00000104250 130 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Rpusd2Q149F1 AC113441.1-201ENSMUST00000223464 134 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Rpusd2Q149F1 Gm25495-201ENSMUST00000104431 131 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Rpusd2Q149F1 Gm23036-201ENSMUST00000157885 99 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Rpusd2Q149F1 Gm25894-201ENSMUST00000083458 75 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Rpusd2Q149F1 Tex15-201ENSMUST00000009772 8405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
Rpusd2Q149F1 Mir7063-201ENSMUST00000184158 91 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Rpusd2Q149F1 Gm43911-201ENSMUST00000203097 76 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Rpusd2Q149F1 Mir101a-201ENSMUST00000083517 83 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Rpusd2Q149F1 Gm25309-201ENSMUST00000116728 126 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Rpusd2Q149F1 Gm25166-201ENSMUST00000158909 111 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Rpusd2Q149F1 Gm25993-201ENSMUST00000175391 80 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Rpusd2Q149F1 Gm44962-201ENSMUST00000206460 279 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Rpusd2Q149F1 Gm25307-201ENSMUST00000158885 106 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Rpusd2Q149F1 Gm27943-201ENSMUST00000184844 116 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Rpusd2Q149F1 Mir343-201ENSMUST00000102360 75 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Rpusd2Q149F1 Gm22720-201ENSMUST00000122710 87 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Rpusd2Q149F1 Gm23630-201ENSMUST00000175292 104 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Rpusd2Q149F1 AC129019.2-201ENSMUST00000222063 202 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Rpusd2Q149F1 Gm26491-201ENSMUST00000179268 121 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Rpusd2Q149F1 Gm27894-201ENSMUST00000184177 92 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Rpusd2Q149F1 Mir7231-201ENSMUST00000196252 61 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Rpusd2Q149F1 Gm45125-201ENSMUST00000206908 151 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Rpusd2Q149F1 Pcdh11x-208ENSMUST00000193899 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
Rpusd2Q149F1 Vmn1r73-202ENSMUST00000226516 6155 ntAPPRIS P1 BASIC1.53□□□□□ -2.16
Rpusd2Q149F1 Gm24996-201ENSMUST00000158390 99 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Rpusd2Q149F1 Gm27974-201ENSMUST00000183415 105 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Rpusd2Q149F1 Gm27587-201ENSMUST00000185116 163 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Rpusd2Q149F1 Gm44327-201ENSMUST00000200068 117 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Rpusd2Q149F1 Gm23245-201ENSMUST00000083370 135 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Rpusd2Q149F1 Gm24895-201ENSMUST00000122742 74 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Rpusd2Q149F1 Gm22542-201ENSMUST00000158166 95 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Rpusd2Q149F1 Mir6962-201ENSMUST00000199512 63 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Rpusd2Q149F1 Mir211-201ENSMUST00000083651 106 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Rpusd2Q149F1 Gm22165-201ENSMUST00000158414 103 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Rpusd2Q149F1 A730009L09Rik-202ENSMUST00000210306 201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
Rpusd2Q149F1 Gm27711-201ENSMUST00000183802 118 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Rpusd2Q149F1 Gm25296-201ENSMUST00000082566 67 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Rpusd2Q149F1 Gm26375-201ENSMUST00000101829 106 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Rpusd2Q149F1 Mir717-201ENSMUST00000102259 109 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Rpusd2Q149F1 Gm22965-201ENSMUST00000157958 101 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Rpusd2Q149F1 DQ267101-201ENSMUST00000082562 73 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Rpusd2Q149F1 Gm22780-201ENSMUST00000104084 132 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Rpusd2Q149F1 Gm22074-201ENSMUST00000158595 113 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Rpusd2Q149F1 Gm23020-201ENSMUST00000158766 253 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Rpusd2Q149F1 Gm44455-201ENSMUST00000200061 82 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Rpusd2Q149F1 AC125190.3-201ENSMUST00000223224 121 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Rpusd2Q149F1 Gm25802-201ENSMUST00000082639 77 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Rpusd2Q149F1 Gm26082-201ENSMUST00000104070 127 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Rpusd2Q149F1 Snord13-201ENSMUST00000157627 104 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Rpusd2Q149F1 Gm23636-201ENSMUST00000175070 95 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Rpusd2Q149F1 Gm24252-201ENSMUST00000083700 132 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Rpusd2Q149F1 Gm24259-201ENSMUST00000083740 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Rpusd2Q149F1 Gm22559-201ENSMUST00000157329 134 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Rpusd2Q149F1 Gm38274-201ENSMUST00000195689 148 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Rpusd2Q149F1 Mir200a-201ENSMUST00000083466 90 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Rpusd2Q149F1 Mir33-201ENSMUST00000083531 69 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Rpusd2Q149F1 Mir3968-201ENSMUST00000175355 100 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Rpusd2Q149F1 Mir448-201ENSMUST00000083516 112 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Rpusd2Q149F1 Gm24797-201ENSMUST00000178103 107 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Rpusd2Q149F1 Mir3473d-201ENSMUST00000175346 81 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 172.3 ms