Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Gm24165-201ENSMUST00000082718 128 ntBASIC1,76□□□□□ -2,13
PtpreP49446 Olfr1253-204ENSMUST00000215988 6332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1,76□□□□□ -2,13
PtpreP49446 Vmn1r73-202ENSMUST00000226516 6155 ntAPPRIS P1 BASIC1,75□□□□□ -2,13
PtpreP49446 Gm11084-201ENSMUST00000112062 69 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1,75□□□□□ -2,13
PtpreP49446 Gm25541-201ENSMUST00000116888 126 ntBASIC1,75□□□□□ -2,13
PtpreP49446 Gm24262-201ENSMUST00000157431 144 ntBASIC1,75□□□□□ -2,13
PtpreP49446 Gm25656-201ENSMUST00000158466 66 ntBASIC1,75□□□□□ -2,13
PtpreP49446 Mir6240-201ENSMUST00000184281 117 ntBASIC1,75□□□□□ -2,13
PtpreP49446 Mir6962-201ENSMUST00000199512 63 ntBASIC1,75□□□□□ -2,13
PtpreP49446 Gm22673-201ENSMUST00000104415 131 ntBASIC1,74□□□□□ -2,13
PtpreP49446 Gm24400-201ENSMUST00000157865 107 ntBASIC1,74□□□□□ -2,13
PtpreP49446 Gm27248-201ENSMUST00000184004 166 ntBASIC1,74□□□□□ -2,13
PtpreP49446 Gm22474-201ENSMUST00000179407 107 ntBASIC1,73□□□□□ -2,13
PtpreP49446 Mir6351-201ENSMUST00000183826 99 ntBASIC1,73□□□□□ -2,13
PtpreP49446 AC139186.1-201ENSMUST00000197610 94 ntBASIC1,73□□□□□ -2,13
PtpreP49446 Mir653-201ENSMUST00000102402 85 ntBASIC1,72□□□□□ -2,13
PtpreP49446 Gm22595-201ENSMUST00000104250 130 ntBASIC1,72□□□□□ -2,13
PtpreP49446 Gm24070-201ENSMUST00000104519 130 ntBASIC1,72□□□□□ -2,13
PtpreP49446 Gm23989-201ENSMUST00000117030 66 ntBASIC1,72□□□□□ -2,13
PtpreP49446 Gm25055-201ENSMUST00000157369 76 ntBASIC1,72□□□□□ -2,13
PtpreP49446 Gm24996-201ENSMUST00000158390 99 ntBASIC1,72□□□□□ -2,13
PtpreP49446 Gm24174-201ENSMUST00000158933 111 ntBASIC1,72□□□□□ -2,13
PtpreP49446 Ighv1-23-201ENSMUST00000194625 351 ntAPPRIS P1 BASIC1,72□□□□□ -2,13
PtpreP49446 Gm39149-201ENSMUST00000210258 186 ntTSL 5 BASIC1,72□□□□□ -2,13
PtpreP49446 Gm24271-201ENSMUST00000102327 111 ntBASIC1,71□□□□□ -2,14
PtpreP49446 Gm25274-201ENSMUST00000104296 135 ntBASIC1,71□□□□□ -2,14
PtpreP49446 Gm23122-201ENSMUST00000157645 103 ntBASIC1,71□□□□□ -2,14
PtpreP49446 Gm23590-201ENSMUST00000157661 104 ntBASIC1,71□□□□□ -2,14
PtpreP49446 Gm22520-201ENSMUST00000158269 129 ntBASIC1,71□□□□□ -2,14
PtpreP49446 Mir3079-201ENSMUST00000175428 90 ntBASIC1,71□□□□□ -2,14
PtpreP49446 Mir7231-201ENSMUST00000196252 61 ntBASIC1,71□□□□□ -2,14
PtpreP49446 Gm22603-201ENSMUST00000157603 96 ntBASIC1,69□□□□□ -2,14
PtpreP49446 Gm23853-201ENSMUST00000158375 104 ntBASIC1,69□□□□□ -2,14
PtpreP49446 Zfp654-201ENSMUST00000052588 4741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1,68□□□□□ -2,14
PtpreP49446 Mir669a-3-201ENSMUST00000102074 109 ntBASIC1,68□□□□□ -2,14
PtpreP49446 Mir343-201ENSMUST00000102360 75 ntBASIC1,68□□□□□ -2,14
PtpreP49446 Gm12432-201ENSMUST00000119540 186 ntBASIC1,68□□□□□ -2,14
PtpreP49446 Gm24808-201ENSMUST00000157993 118 ntBASIC1,68□□□□□ -2,14
PtpreP49446 Traj60-201ENSMUST00000167781 54 ntBASIC1,68□□□□□ -2,14
PtpreP49446 AC113441.1-201ENSMUST00000223464 134 ntBASIC1,68□□□□□ -2,14
PtpreP49446 Gm23558-201ENSMUST00000157823 80 ntBASIC1,67□□□□□ -2,14
PtpreP49446 Gm22965-201ENSMUST00000157958 101 ntBASIC1,67□□□□□ -2,14
PtpreP49446 Gm24797-201ENSMUST00000178103 107 ntBASIC1,67□□□□□ -2,14
PtpreP49446 Gm26491-201ENSMUST00000179268 121 ntBASIC1,67□□□□□ -2,14
PtpreP49446 Gm24259-201ENSMUST00000083740 107 ntBASIC1,67□□□□□ -2,14
PtpreP49446 Gm25309-201ENSMUST00000116728 126 ntBASIC1,66□□□□□ -2,14
PtpreP49446 Vmn1r-ps69-201ENSMUST00000172759 201 ntBASIC1,66□□□□□ -2,14
PtpreP49446 Mir7059-201ENSMUST00000184825 59 ntBASIC1,66□□□□□ -2,14
PtpreP49446 Gm25715-201ENSMUST00000158627 125 ntBASIC1,65□□□□□ -2,15
PtpreP49446 Gm23416-201ENSMUST00000175520 95 ntBASIC1,65□□□□□ -2,15
PtpreP49446 Gm27493-201ENSMUST00000184128 78 ntBASIC1,65□□□□□ -2,15
PtpreP49446 Traj45-201ENSMUST00000103697 63 ntAPPRIS P1 BASIC1,64□□□□□ -2,15
PtpreP49446 Gm22233-201ENSMUST00000157464 114 ntBASIC1,64□□□□□ -2,15
PtpreP49446 Gm25868-201ENSMUST00000158253 114 ntBASIC1,64□□□□□ -2,15
PtpreP49446 Gm16399-201ENSMUST00000181423 219 ntBASIC1,64□□□□□ -2,15
PtpreP49446 Gm44211-201ENSMUST00000204867 145 ntBASIC1,64□□□□□ -2,15
PtpreP49446 Gm26338-201ENSMUST00000102372 110 ntBASIC1,63□□□□□ -2,15
PtpreP49446 Gm23329-201ENSMUST00000157415 108 ntBASIC1,63□□□□□ -2,15
PtpreP49446 Gm23036-201ENSMUST00000157885 99 ntBASIC1,63□□□□□ -2,15
PtpreP49446 Gm24723-201ENSMUST00000158233 132 ntBASIC1,63□□□□□ -2,15
PtpreP49446 Gm25087-201ENSMUST00000101992 78 ntBASIC1,62□□□□□ -2,15
PtpreP49446 Gm25170-201ENSMUST00000104191 129 ntBASIC1,62□□□□□ -2,15
PtpreP49446 Gm26301-201ENSMUST00000104813 95 ntBASIC1,62□□□□□ -2,15
PtpreP49446 Gm22720-201ENSMUST00000122710 87 ntBASIC1,62□□□□□ -2,15
PtpreP49446 Gm22165-201ENSMUST00000158414 103 ntBASIC1,62□□□□□ -2,15
PtpreP49446 Gm27980-201ENSMUST00000184094 169 ntBASIC1,62□□□□□ -2,15
PtpreP49446 Mir7052-201ENSMUST00000184821 65 ntBASIC1,62□□□□□ -2,15
PtpreP49446 Gm45125-201ENSMUST00000206908 151 ntBASIC1,62□□□□□ -2,15
PtpreP49446 Gm25802-201ENSMUST00000082639 77 ntBASIC1,62□□□□□ -2,15
PtpreP49446 Gm26467-201ENSMUST00000097257 78 ntBASIC1,62□□□□□ -2,15
PtpreP49446 Gm23410-201ENSMUST00000179967 107 ntBASIC1,61□□□□□ -2,15
PtpreP49446 Gm22505-201ENSMUST00000082956 108 ntBASIC1,61□□□□□ -2,15
PtpreP49446 Gm22363-201ENSMUST00000083100 108 ntBASIC1,61□□□□□ -2,15
PtpreP49446 Gm23814-201ENSMUST00000083230 102 ntBASIC1,61□□□□□ -2,15
PtpreP49446 Olfr820-202ENSMUST00000214917 4701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1,59□□□□□ -2,15
PtpreP49446 Gm24942-201ENSMUST00000158328 114 ntBASIC1,59□□□□□ -2,15
PtpreP49446 Mir7010-201ENSMUST00000183464 63 ntBASIC1,59□□□□□ -2,15
PtpreP49446 Gm38274-201ENSMUST00000195689 148 ntBASIC1,59□□□□□ -2,15
PtpreP49446 Gm25138-201ENSMUST00000083248 136 ntBASIC1,59□□□□□ -2,15
PtpreP49446 Gm25993-201ENSMUST00000175391 80 ntBASIC1,58□□□□□ -2,16
PtpreP49446 AC129019.2-201ENSMUST00000222063 202 ntBASIC1,58□□□□□ -2,16
PtpreP49446 Mir717-201ENSMUST00000102259 109 ntBASIC1,57□□□□□ -2,16
PtpreP49446 n-R5s157-201ENSMUST00000122543 121 ntBASIC1,57□□□□□ -2,16
PtpreP49446 Gm23328-201ENSMUST00000157418 132 ntBASIC1,57□□□□□ -2,16
PtpreP49446 Gm26007-201ENSMUST00000158798 120 ntBASIC1,57□□□□□ -2,16
PtpreP49446 Gm44490-201ENSMUST00000198566 127 ntBASIC1,57□□□□□ -2,16
PtpreP49446 Gm44962-201ENSMUST00000206460 279 ntBASIC1,57□□□□□ -2,16
PtpreP49446 Tex15-201ENSMUST00000009772 8405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1,56□□□□□ -2,16
PtpreP49446 Gm22016-201ENSMUST00000158793 114 ntBASIC1,56□□□□□ -2,16
PtpreP49446 Mir448-201ENSMUST00000083516 112 ntBASIC1,56□□□□□ -2,16
PtpreP49446 Gm10945-201ENSMUST00000105596 60 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1,55□□□□□ -2,16
PtpreP49446 Gm25307-201ENSMUST00000158885 106 ntBASIC1,55□□□□□ -2,16
PtpreP49446 Gm24321-201ENSMUST00000175348 80 ntBASIC1,55□□□□□ -2,16
PtpreP49446 Mir3070a-201ENSMUST00000175468 89 ntBASIC1,55□□□□□ -2,16
PtpreP49446 Mir1954-201ENSMUST00000175595 86 ntBASIC1,55□□□□□ -2,16
PtpreP49446 Gm25894-201ENSMUST00000083458 75 ntBASIC1,55□□□□□ -2,16
PtpreP49446 Gm22780-201ENSMUST00000104084 132 ntBASIC1,54□□□□□ -2,16
PtpreP49446 Gm23221-201ENSMUST00000158118 93 ntBASIC1,54□□□□□ -2,16
PtpreP49446 Gm24508-201ENSMUST00000180104 107 ntBASIC1,54□□□□□ -2,16
PtpreP49446 Gm42533-201ENSMUST00000196247 157 ntBASIC1,54□□□□□ -2,16
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