Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Vmn1r185-210ENSMUST00000228367 6982 ntAPPRIS P1 BASIC3,06□□□□□ -1,92
Hoxd11P23813 Gm23989-201ENSMUST00000117030 66 ntBASIC3,06□□□□□ -1,92
Hoxd11P23813 Gm23470-201ENSMUST00000157129 120 ntBASIC3,06□□□□□ -1,92
Hoxd11P23813 Gm27894-201ENSMUST00000184177 92 ntBASIC3,06□□□□□ -1,92
Hoxd11P23813 CT030161.1-201ENSMUST00000218411 124 ntBASIC3,06□□□□□ -1,92
Hoxd11P23813 Gm24445-201ENSMUST00000083981 107 ntBASIC3,06□□□□□ -1,92
Hoxd11P23813 Mir500-201ENSMUST00000093600 92 ntBASIC3,06□□□□□ -1,92
Hoxd11P23813 Knl1-203ENSMUST00000099542 6525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3,05□□□□□ -1,92
Hoxd11P23813 Gm23992-201ENSMUST00000174981 67 ntBASIC3,05□□□□□ -1,92
Hoxd11P23813 B3galt2-201ENSMUST00000038252 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3,04□□□□□ -1,92
Hoxd11P23813 Gm24475-201ENSMUST00000157435 143 ntBASIC3,04□□□□□ -1,92
Hoxd11P23813 Gm25049-201ENSMUST00000158597 73 ntBASIC3,04□□□□□ -1,92
Hoxd11P23813 Sacs-203ENSMUST00000119943 14991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3,03□□□□□ -1,92
Hoxd11P23813 Gm43911-201ENSMUST00000203097 76 ntBASIC3,03□□□□□ -1,92
Hoxd11P23813 AC129202.2-201ENSMUST00000225123 177 ntBASIC3,03□□□□□ -1,92
Hoxd11P23813 Mir223-201ENSMUST00000102112 110 ntBASIC3,02□□□□□ -1,93
Hoxd11P23813 Gm25832-201ENSMUST00000104140 130 ntBASIC3,02□□□□□ -1,93
Hoxd11P23813 Gm12432-201ENSMUST00000119540 186 ntBASIC3,02□□□□□ -1,93
Hoxd11P23813 Mir184-201ENSMUST00000083662 69 ntBASIC3,02□□□□□ -1,93
Hoxd11P23813 Gm25968-201ENSMUST00000157167 100 ntBASIC3,01□□□□□ -1,93
Hoxd11P23813 Mir5123-201ENSMUST00000177794 83 ntBASIC3,01□□□□□ -1,93
Hoxd11P23813 Gm27326-201ENSMUST00000183504 95 ntBASIC3,01□□□□□ -1,93
Hoxd11P23813 Gm38323-201ENSMUST00000192450 210 ntBASIC3,01□□□□□ -1,93
Hoxd11P23813 Olfr839-ps1-201ENSMUST00000212127 7759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3,01□□□□□ -1,93
Hoxd11P23813 Gm23109-201ENSMUST00000116867 126 ntBASIC3□□□□□ -1,93
Hoxd11P23813 Gm27420-201ENSMUST00000183823 79 ntBASIC3□□□□□ -1,93
Hoxd11P23813 Gm24044-201ENSMUST00000083107 156 ntBASIC3□□□□□ -1,93
Hoxd11P23813 Arhgap5-204ENSMUST00000219443 9323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2,99□□□□□ -1,93
Hoxd11P23813 Vmn1r185-211ENSMUST00000228467 6915 ntAPPRIS P1 BASIC2,99□□□□□ -1,93
Hoxd11P23813 Gm22752-201ENSMUST00000102083 109 ntBASIC2,99□□□□□ -1,93
Hoxd11P23813 Gm23340-201ENSMUST00000158955 123 ntBASIC2,99□□□□□ -1,93
Hoxd11P23813 Gm37557-201ENSMUST00000191640 139 ntBASIC2,99□□□□□ -1,93
Hoxd11P23813 AC154832.1-201ENSMUST00000228928 141 ntBASIC2,99□□□□□ -1,93
Hoxd11P23813 Gm25275-201ENSMUST00000104297 129 ntBASIC2,98□□□□□ -1,93
Hoxd11P23813 Pak3-202ENSMUST00000112863 8657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2,97□□□□□ -1,93
Hoxd11P23813 Gm22164-201ENSMUST00000158413 106 ntBASIC2,97□□□□□ -1,93
Hoxd11P23813 Mir497-201ENSMUST00000200557 84 ntBASIC2,97□□□□□ -1,93
Hoxd11P23813 Gm25791-201ENSMUST00000083292 137 ntBASIC2,97□□□□□ -1,93
Hoxd11P23813 Gm37494-202ENSMUST00000188038 16021 ntTSL 5 BASIC2,96□□□□□ -1,93
Hoxd11P23813 Gm23325-201ENSMUST00000157422 129 ntBASIC2,96□□□□□ -1,94
Hoxd11P23813 Naaladl2-202ENSMUST00000203414 9330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2,96□□□□□ -1,94
Hoxd11P23813 Dst-211ENSMUST00000183034 23201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2,95□□□□□ -1,94
Hoxd11P23813 Mir693-201ENSMUST00000102187 89 ntBASIC2,95□□□□□ -1,94
Hoxd11P23813 Gm25903-201ENSMUST00000158492 103 ntBASIC2,95□□□□□ -1,94
Hoxd11P23813 Gm28794-201ENSMUST00000185276 136 ntBASIC2,95□□□□□ -1,94
Hoxd11P23813 Gm23853-201ENSMUST00000158375 104 ntBASIC2,94□□□□□ -1,94
Hoxd11P23813 Gm25658-201ENSMUST00000158472 128 ntBASIC2,94□□□□□ -1,94
Hoxd11P23813 Gm24920-201ENSMUST00000083018 85 ntBASIC2,94□□□□□ -1,94
Hoxd11P23813 Olfr109-203ENSMUST00000214938 5550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2,93□□□□□ -1,94
Hoxd11P23813 Gm24500-201ENSMUST00000158447 124 ntBASIC2,93□□□□□ -1,94
Hoxd11P23813 Mir6405-201ENSMUST00000184584 124 ntBASIC2,93□□□□□ -1,94
Hoxd11P23813 Gm22961-201ENSMUST00000157964 106 ntBASIC2,92□□□□□ -1,94
Hoxd11P23813 Gm27798-201ENSMUST00000184989 71 ntBASIC2,92□□□□□ -1,94
Hoxd11P23813 Gm44384-201ENSMUST00000200208 114 ntBASIC2,92□□□□□ -1,94
Hoxd11P23813 F8-202ENSMUST00000114085 7295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2,92□□□□□ -1,94
Hoxd11P23813 Mir7010-201ENSMUST00000183464 63 ntBASIC2,91□□□□□ -1,94
Hoxd11P23813 Mir6240-201ENSMUST00000184281 117 ntBASIC2,91□□□□□ -1,94
Hoxd11P23813 Gm44458-201ENSMUST00000196594 143 ntBASIC2,91□□□□□ -1,94
Hoxd11P23813 Gm44327-201ENSMUST00000200068 117 ntBASIC2,91□□□□□ -1,94
Hoxd11P23813 Gm42506-201ENSMUST00000202009 150 ntBASIC2,91□□□□□ -1,94
Hoxd11P23813 Gm22455-201ENSMUST00000082580 71 ntBASIC2,91□□□□□ -1,94
Hoxd11P23813 n-R5s197-201ENSMUST00000083302 119 ntBASIC2,91□□□□□ -1,94
Hoxd11P23813 Mir30d-201ENSMUST00000083503 82 ntBASIC2,91□□□□□ -1,94
Hoxd11P23813 Gm24890-201ENSMUST00000104389 102 ntBASIC2,9□□□□□ -1,95
Hoxd11P23813 Gm23416-201ENSMUST00000175520 95 ntBASIC2,9□□□□□ -1,95
Hoxd11P23813 Mir6896-201ENSMUST00000198033 73 ntBASIC2,9□□□□□ -1,95
Hoxd11P23813 Gm23033-201ENSMUST00000157996 134 ntBASIC2,89□□□□□ -1,95
Hoxd11P23813 Gm24321-201ENSMUST00000175348 80 ntBASIC2,89□□□□□ -1,95
Hoxd11P23813 Mir3079-201ENSMUST00000175428 90 ntBASIC2,89□□□□□ -1,95
Hoxd11P23813 Gm22858-201ENSMUST00000174972 76 ntBASIC2,88□□□□□ -1,95
Hoxd11P23813 Olfr851-202ENSMUST00000214130 7123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2,87□□□□□ -1,95
Hoxd11P23813 Gm24097-201ENSMUST00000178720 107 ntBASIC2,87□□□□□ -1,95
Hoxd11P23813 Vmn1r80-205ENSMUST00000227755 10455 ntAPPRIS P1 BASIC2,86□□□□□ -1,95
Hoxd11P23813 Gm37778-201ENSMUST00000191732 190 ntBASIC2,86□□□□□ -1,95
Hoxd11P23813 Traj9-201ENSMUST00000103731 58 ntAPPRIS P1 BASIC2,85□□□□□ -1,95
Hoxd11P23813 Gm26224-201ENSMUST00000082506 80 ntBASIC2,85□□□□□ -1,95
Hoxd11P23813 Gm24271-201ENSMUST00000102327 111 ntBASIC2,84□□□□□ -1,95
Hoxd11P23813 Mir499-201ENSMUST00000102357 79 ntBASIC2,84□□□□□ -1,95
Hoxd11P23813 Snord96a-201ENSMUST00000082791 81 ntBASIC2,84□□□□□ -1,95
Hoxd11P23813 Dmd-203ENSMUST00000114000 14910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2,84□□□□□ -1,96
Hoxd11P23813 Gm8251-201ENSMUST00000168641 5985 ntAPPRIS P1 BASIC2,83□□□□□ -1,96
Hoxd11P23813 Gm26301-201ENSMUST00000104813 95 ntBASIC2,83□□□□□ -1,96
Hoxd11P23813 Gm22074-201ENSMUST00000158595 113 ntBASIC2,83□□□□□ -1,96
Hoxd11P23813 Snord93-201ENSMUST00000175580 71 ntBASIC2,83□□□□□ -1,96
Hoxd11P23813 Gm38074-201ENSMUST00000193467 145 ntTSL 5 BASIC2,83□□□□□ -1,96
Hoxd11P23813 Ranbp2-201ENSMUST00000003310 9608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2,82□□□□□ -1,96
Hoxd11P23813 Gm22517-201ENSMUST00000158265 136 ntBASIC2,81□□□□□ -1,96
Hoxd11P23813 Gm27648-201ENSMUST00000184315 107 ntBASIC2,81□□□□□ -1,96
Hoxd11P23813 Mir7665-201ENSMUST00000184907 63 ntBASIC2,81□□□□□ -1,96
Hoxd11P23813 Gm25894-201ENSMUST00000083458 75 ntBASIC2,81□□□□□ -1,96
Hoxd11P23813 Gm27700-201ENSMUST00000185003 81 ntBASIC2,8□□□□□ -1,96
Hoxd11P23813 Gm44303-201ENSMUST00000196348 83 ntBASIC2,8□□□□□ -1,96
Hoxd11P23813 Thoc2-201ENSMUST00000047037 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2,8□□□□□ -1,96
Hoxd11P23813 Gm26406-201ENSMUST00000158503 124 ntBASIC2,78□□□□□ -1,96
Hoxd11P23813 Gm23409-201ENSMUST00000158516 237 ntBASIC2,78□□□□□ -1,96
Hoxd11P23813 Gm27527-201ENSMUST00000183903 99 ntBASIC2,78□□□□□ -1,96
Hoxd11P23813 Zbtb37-203ENSMUST00000162226 18814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2,78□□□□□ -1,96
Hoxd11P23813 Mir295-201ENSMUST00000104694 69 ntBASIC2,77□□□□□ -1,97
Hoxd11P23813 Gm27786-201ENSMUST00000184337 70 ntBASIC2,77□□□□□ -1,97
Hoxd11P23813 Gm27443-201ENSMUST00000184660 98 ntBASIC2,77□□□□□ -1,97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99,6 ms