Protein–RNA interactions for Protein: O89093
Ccl20, C-C motif chemokine 20, mouse
Protein |
RNA |
Prediction (catRAPID) |
Interaction (Experimental data) |
Gene |
UniProt Accession |
Transcript Symbol |
Ensembl Transcript ID |
Length |
Transcript Status |
Prediction Score |
Prediction z-Score |
p-Value |
Fold Change |
Ccl20 | O89093 | Gm24183-201 | ENSMUST00000122572 | 93 nt | BASIC | -0,66 | □□□□□ -2,52 | | |
Ccl20 | O89093 | Gm22732-201 | ENSMUST00000158093 | 121 nt | BASIC | -0,66 | □□□□□ -2,52 | | |
Ccl20 | O89093 | Gm24926-201 | ENSMUST00000178053 | 79 nt | BASIC | -0,66 | □□□□□ -2,52 | | |
Ccl20 | O89093 | Gm22632-201 | ENSMUST00000178266 | 79 nt | BASIC | -0,66 | □□□□□ -2,52 | | |
Ccl20 | O89093 | Snord45b-201 | ENSMUST00000082797 | 71 nt | BASIC | -0,66 | □□□□□ -2,52 | | |
Ccl20 | O89093 | Gm25137-201 | ENSMUST00000083251 | 110 nt | BASIC | -0,66 | □□□□□ -2,52 | | |
Ccl20 | O89093 | Gm24377-201 | ENSMUST00000104398 | 131 nt | BASIC | -0,67 | □□□□□ -2,52 | | |
Ccl20 | O89093 | Gm22490-201 | ENSMUST00000157188 | 119 nt | BASIC | -0,67 | □□□□□ -2,52 | | |
Ccl20 | O89093 | Gm22962-201 | ENSMUST00000157962 | 73 nt | BASIC | -0,67 | □□□□□ -2,52 | | |
Ccl20 | O89093 | Gm23197-201 | ENSMUST00000158809 | 112 nt | BASIC | -0,67 | □□□□□ -2,52 | | |
Ccl20 | O89093 | Gm27686-201 | ENSMUST00000185123 | 91 nt | BASIC | -0,67 | □□□□□ -2,52 | | |
Ccl20 | O89093 | Gm20108-201 | ENSMUST00000219977 | 153 nt | BASIC | -0,67 | □□□□□ -2,52 | | |
Ccl20 | O89093 | Gm23578-201 | ENSMUST00000103943 | 104 nt | BASIC | -0,68 | □□□□□ -2,52 | | |
Ccl20 | O89093 | Gm10563-201 | ENSMUST00000115821 | 237 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | -0,68 | □□□□□ -2,52 | | |
Ccl20 | O89093 | Gm23261-201 | ENSMUST00000158316 | 136 nt | BASIC | -0,68 | □□□□□ -2,52 | | |
Ccl20 | O89093 | Gm22770-201 | ENSMUST00000158368 | 67 nt | BASIC | -0,68 | □□□□□ -2,52 | | |
Ccl20 | O89093 | Gm23036-201 | ENSMUST00000157885 | 99 nt | BASIC | -0,69 | □□□□□ -2,52 | | |
Ccl20 | O89093 | Mir344h-1-201 | ENSMUST00000174922 | 60 nt | BASIC | -0,69 | □□□□□ -2,52 | | |
Ccl20 | O89093 | Gm25678-201 | ENSMUST00000174984 | 73 nt | BASIC | -0,69 | □□□□□ -2,52 | | |
Ccl20 | O89093 | Mir344h-2-201 | ENSMUST00000175612 | 60 nt | BASIC | -0,69 | □□□□□ -2,52 | | |
Ccl20 | O89093 | Gm42844-201 | ENSMUST00000200355 | 112 nt | BASIC | -0,69 | □□□□□ -2,52 | | |
Ccl20 | O89093 | Gm45655-201 | ENSMUST00000211625 | 160 nt | BASIC | -0,69 | □□□□□ -2,52 | | |
Ccl20 | O89093 | Mir466-201 | ENSMUST00000093591 | 73 nt | BASIC | -0,69 | □□□□□ -2,52 | | |
Ccl20 | O89093 | Traj38-201 | ENSMUST00000103704 | 62 nt | APPRIS P1 BASIC | -0,7 | □□□□□ -2,52 | | |
Ccl20 | O89093 | Mir297a-2-201 | ENSMUST00000103795 | 90 nt | BASIC | -0,7 | □□□□□ -2,52 | | |
Ccl20 | O89093 | Mir378c-201 | ENSMUST00000184478 | 99 nt | BASIC | -0,7 | □□□□□ -2,52 | | |
Ccl20 | O89093 | Mir5117-201 | ENSMUST00000083226 | 84 nt | BASIC | -0,7 | □□□□□ -2,52 | | |
Ccl20 | O89093 | Gm22827-201 | ENSMUST00000083766 | 107 nt | BASIC | -0,7 | □□□□□ -2,52 | | |
Ccl20 | O89093 | n-R5s8-201 | ENSMUST00000104121 | 118 nt | BASIC | -0,71 | □□□□□ -2,52 | | |
Ccl20 | O89093 | Gm25787-201 | ENSMUST00000104709 | 92 nt | BASIC | -0,71 | □□□□□ -2,52 | | |
Ccl20 | O89093 | Gm25920-201 | ENSMUST00000158307 | 99 nt | BASIC | -0,71 | □□□□□ -2,52 | | |
Ccl20 | O89093 | Gm24676-201 | ENSMUST00000158758 | 75 nt | BASIC | -0,71 | □□□□□ -2,52 | | |
Ccl20 | O89093 | Gm22459-201 | ENSMUST00000082577 | 108 nt | BASIC | -0,71 | □□□□□ -2,52 | | |
Ccl20 | O89093 | Gm26454-201 | ENSMUST00000082682 | 107 nt | BASIC | -0,71 | □□□□□ -2,52 | | |
Ccl20 | O89093 | Gm25812-201 | ENSMUST00000082751 | 103 nt | BASIC | -0,71 | □□□□□ -2,52 | | |
Ccl20 | O89093 | Gm24868-201 | ENSMUST00000157265 | 136 nt | BASIC | -0,72 | □□□□□ -2,52 | | |
Ccl20 | O89093 | Gm25885-201 | ENSMUST00000157779 | 109 nt | BASIC | -0,72 | □□□□□ -2,52 | | |
Ccl20 | O89093 | Gm24077-201 | ENSMUST00000158183 | 136 nt | BASIC | -0,72 | □□□□□ -2,52 | | |
Ccl20 | O89093 | Gm22165-201 | ENSMUST00000158414 | 103 nt | BASIC | -0,72 | □□□□□ -2,52 | | |
Ccl20 | O89093 | Gm23180-201 | ENSMUST00000158686 | 125 nt | BASIC | -0,72 | □□□□□ -2,52 | | |
Ccl20 | O89093 | Gm25596-201 | ENSMUST00000178368 | 107 nt | BASIC | -0,72 | □□□□□ -2,52 | | |
Ccl20 | O89093 | Gm45125-201 | ENSMUST00000206908 | 151 nt | BASIC | -0,72 | □□□□□ -2,52 | | |
Ccl20 | O89093 | Gm6607-201 | ENSMUST00000215035 | 328 nt | BASIC | -0,72 | □□□□□ -2,52 | | |
Ccl20 | O89093 | Gm25684-201 | ENSMUST00000083941 | 107 nt | BASIC | -0,72 | □□□□□ -2,52 | | |
Ccl20 | O89093 | Gm23749-201 | ENSMUST00000104223 | 131 nt | BASIC | -0,73 | □□□□□ -2,53 | | |
Ccl20 | O89093 | Gm25753-201 | ENSMUST00000116792 | 121 nt | BASIC | -0,73 | □□□□□ -2,53 | | |
Ccl20 | O89093 | Gm25010-201 | ENSMUST00000158403 | 65 nt | BASIC | -0,73 | □□□□□ -2,53 | | |
Ccl20 | O89093 | Gm25098-201 | ENSMUST00000177580 | 79 nt | BASIC | -0,73 | □□□□□ -2,53 | | |
Ccl20 | O89093 | Gm23356-201 | ENSMUST00000177610 | 79 nt | BASIC | -0,73 | □□□□□ -2,53 | | |
Ccl20 | O89093 | Gm24027-201 | ENSMUST00000177611 | 79 nt | BASIC | -0,73 | □□□□□ -2,53 | | |
Ccl20 | O89093 | Gm22511-201 | ENSMUST00000177628 | 79 nt | BASIC | -0,73 | □□□□□ -2,53 | | |
Ccl20 | O89093 | Gm22630-201 | ENSMUST00000177781 | 79 nt | BASIC | -0,73 | □□□□□ -2,53 | | |
Ccl20 | O89093 | Gm23560-201 | ENSMUST00000177782 | 79 nt | BASIC | -0,73 | □□□□□ -2,53 | | |
Ccl20 | O89093 | Gm25462-201 | ENSMUST00000177833 | 79 nt | BASIC | -0,73 | □□□□□ -2,53 | | |
Ccl20 | O89093 | Gm26059-201 | ENSMUST00000177865 | 79 nt | BASIC | -0,73 | □□□□□ -2,53 | | |
Ccl20 | O89093 | Gm22255-201 | ENSMUST00000177933 | 79 nt | BASIC | -0,73 | □□□□□ -2,53 | | |
Ccl20 | O89093 | Gm25146-201 | ENSMUST00000177976 | 79 nt | BASIC | -0,73 | □□□□□ -2,53 | | |
Ccl20 | O89093 | Gm25523-201 | ENSMUST00000178044 | 79 nt | BASIC | -0,73 | □□□□□ -2,53 | | |
Ccl20 | O89093 | Gm24585-201 | ENSMUST00000178104 | 79 nt | BASIC | -0,73 | □□□□□ -2,53 | | |
Ccl20 | O89093 | Gm22627-201 | ENSMUST00000178127 | 79 nt | BASIC | -0,73 | □□□□□ -2,53 | | |
Ccl20 | O89093 | Gm22912-201 | ENSMUST00000178242 | 79 nt | BASIC | -0,73 | □□□□□ -2,53 | | |
Ccl20 | O89093 | Gm24866-201 | ENSMUST00000178338 | 79 nt | BASIC | -0,73 | □□□□□ -2,53 | | |
Ccl20 | O89093 | Gm22524-201 | ENSMUST00000178357 | 79 nt | BASIC | -0,73 | □□□□□ -2,53 | | |
Ccl20 | O89093 | Gm25710-201 | ENSMUST00000178367 | 79 nt | BASIC | -0,73 | □□□□□ -2,53 | | |
Ccl20 | O89093 | Gm23575-201 | ENSMUST00000178406 | 79 nt | BASIC | -0,73 | □□□□□ -2,53 | | |
Ccl20 | O89093 | Gm24872-201 | ENSMUST00000178434 | 79 nt | BASIC | -0,73 | □□□□□ -2,53 | | |
Ccl20 | O89093 | Gm22449-201 | ENSMUST00000178924 | 79 nt | BASIC | -0,73 | □□□□□ -2,53 | | |
Ccl20 | O89093 | Gm24702-201 | ENSMUST00000178965 | 79 nt | BASIC | -0,73 | □□□□□ -2,53 | | |
Ccl20 | O89093 | Gm24206-201 | ENSMUST00000179011 | 79 nt | BASIC | -0,73 | □□□□□ -2,53 | | |
Ccl20 | O89093 | Gm24528-201 | ENSMUST00000179164 | 79 nt | BASIC | -0,73 | □□□□□ -2,53 | | |
Ccl20 | O89093 | Gm22909-201 | ENSMUST00000179190 | 79 nt | BASIC | -0,73 | □□□□□ -2,53 | | |
Ccl20 | O89093 | Gm26334-201 | ENSMUST00000179403 | 79 nt | BASIC | -0,73 | □□□□□ -2,53 | | |
Ccl20 | O89093 | Gm25463-201 | ENSMUST00000179405 | 79 nt | BASIC | -0,73 | □□□□□ -2,53 | | |
Ccl20 | O89093 | Gm25742-201 | ENSMUST00000179530 | 79 nt | BASIC | -0,73 | □□□□□ -2,53 | | |
Ccl20 | O89093 | Gm25209-201 | ENSMUST00000179576 | 79 nt | BASIC | -0,73 | □□□□□ -2,53 | | |
Ccl20 | O89093 | Gm26392-201 | ENSMUST00000179661 | 79 nt | BASIC | -0,73 | □□□□□ -2,53 | | |
Ccl20 | O89093 | Gm25230-201 | ENSMUST00000179740 | 79 nt | BASIC | -0,73 | □□□□□ -2,53 | | |
Ccl20 | O89093 | Gm26434-201 | ENSMUST00000179778 | 79 nt | BASIC | -0,73 | □□□□□ -2,53 | | |
Ccl20 | O89093 | Gm25741-201 | ENSMUST00000179825 | 79 nt | BASIC | -0,73 | □□□□□ -2,53 | | |
Ccl20 | O89093 | Gm24759-201 | ENSMUST00000179827 | 79 nt | BASIC | -0,73 | □□□□□ -2,53 | | |
Ccl20 | O89093 | Gm24219-201 | ENSMUST00000179861 | 79 nt | BASIC | -0,73 | □□□□□ -2,53 | | |
Ccl20 | O89093 | Gm24134-201 | ENSMUST00000083361 | 71 nt | BASIC | -0,73 | □□□□□ -2,53 | | |
Ccl20 | O89093 | Gm23254-201 | ENSMUST00000097244 | 79 nt | BASIC | -0,73 | □□□□□ -2,53 | | |
Ccl20 | O89093 | Mir669f-201 | ENSMUST00000103850 | 121 nt | BASIC | -0,74 | □□□□□ -2,53 | | |
Ccl20 | O89093 | Gm24336-201 | ENSMUST00000104203 | 146 nt | BASIC | -0,74 | □□□□□ -2,53 | | |
Ccl20 | O89093 | Mir5619-201 | ENSMUST00000176065 | 61 nt | BASIC | -0,75 | □□□□□ -2,53 | | |
Ccl20 | O89093 | Gm23966-201 | ENSMUST00000179823 | 107 nt | BASIC | -0,75 | □□□□□ -2,53 | | |
Ccl20 | O89093 | Gm27937-201 | ENSMUST00000183605 | 88 nt | BASIC | -0,75 | □□□□□ -2,53 | | |
Ccl20 | O89093 | Sult1c2-ps2-201 | ENSMUST00000196414 | 276 nt | BASIC | -0,75 | □□□□□ -2,53 | | |
Ccl20 | O89093 | Gm20734-201 | ENSMUST00000216939 | 193 nt | BASIC | -0,75 | □□□□□ -2,53 | | |
Ccl20 | O89093 | Gm26253-201 | ENSMUST00000122493 | 103 nt | BASIC | -0,76 | □□□□□ -2,53 | | |
Ccl20 | O89093 | Gm27263-201 | ENSMUST00000184760 | 76 nt | BASIC | -0,76 | □□□□□ -2,53 | | |
Ccl20 | O89093 | Gm6293-201 | ENSMUST00000050339 | 195 nt | BASIC | -0,76 | □□□□□ -2,53 | | |
Ccl20 | O89093 | Mir183-201 | ENSMUST00000083685 | 70 nt | BASIC | -0,76 | □□□□□ -2,53 | | |
Ccl20 | O89093 | Traj35-201 | ENSMUST00000103706 | 65 nt | APPRIS P1 BASIC | -0,77 | □□□□□ -2,53 | | |
Ccl20 | O89093 | Mir18b-201 | ENSMUST00000103923 | 83 nt | BASIC | -0,77 | □□□□□ -2,53 | | |
Ccl20 | O89093 | Gm25619-201 | ENSMUST00000122621 | 104 nt | BASIC | -0,77 | □□□□□ -2,53 | | |
Ccl20 | O89093 | Gm22205-201 | ENSMUST00000122655 | 71 nt | BASIC | -0,77 | □□□□□ -2,53 | | |
Ccl20 | O89093 | Gm22340-201 | ENSMUST00000157717 | 114 nt | BASIC | -0,77 | □□□□□ -2,53 | | |
Ccl20 | O89093 | Gm22607-201 | ENSMUST00000158291 | 105 nt | BASIC | -0,77 | □□□□□ -2,53 | | |
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