Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm24183-201ENSMUST00000122572 93 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
Ccl20O89093 Gm22732-201ENSMUST00000158093 121 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
Ccl20O89093 Gm24926-201ENSMUST00000178053 79 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
Ccl20O89093 Gm22632-201ENSMUST00000178266 79 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
Ccl20O89093 Snord45b-201ENSMUST00000082797 71 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
Ccl20O89093 Gm25137-201ENSMUST00000083251 110 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
Ccl20O89093 Gm24377-201ENSMUST00000104398 131 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
Ccl20O89093 Gm22490-201ENSMUST00000157188 119 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
Ccl20O89093 Gm22962-201ENSMUST00000157962 73 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
Ccl20O89093 Gm23197-201ENSMUST00000158809 112 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
Ccl20O89093 Gm27686-201ENSMUST00000185123 91 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
Ccl20O89093 Gm20108-201ENSMUST00000219977 153 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
Ccl20O89093 Gm23578-201ENSMUST00000103943 104 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
Ccl20O89093 Gm10563-201ENSMUST00000115821 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.68□□□□□ -2.52
Ccl20O89093 Gm23261-201ENSMUST00000158316 136 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
Ccl20O89093 Gm22770-201ENSMUST00000158368 67 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
Ccl20O89093 Gm23036-201ENSMUST00000157885 99 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
Ccl20O89093 Mir344h-1-201ENSMUST00000174922 60 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
Ccl20O89093 Gm25678-201ENSMUST00000174984 73 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
Ccl20O89093 Mir344h-2-201ENSMUST00000175612 60 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
Ccl20O89093 Gm42844-201ENSMUST00000200355 112 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
Ccl20O89093 Gm45655-201ENSMUST00000211625 160 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
Ccl20O89093 Mir466-201ENSMUST00000093591 73 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
Ccl20O89093 Traj38-201ENSMUST00000103704 62 ntAPPRIS P1 BASIC-0.7□□□□□ -2.52
Ccl20O89093 Mir297a-2-201ENSMUST00000103795 90 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
Ccl20O89093 Mir378c-201ENSMUST00000184478 99 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
Ccl20O89093 Mir5117-201ENSMUST00000083226 84 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
Ccl20O89093 Gm22827-201ENSMUST00000083766 107 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
Ccl20O89093 n-R5s8-201ENSMUST00000104121 118 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
Ccl20O89093 Gm25787-201ENSMUST00000104709 92 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
Ccl20O89093 Gm25920-201ENSMUST00000158307 99 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
Ccl20O89093 Gm24676-201ENSMUST00000158758 75 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
Ccl20O89093 Gm22459-201ENSMUST00000082577 108 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
Ccl20O89093 Gm26454-201ENSMUST00000082682 107 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
Ccl20O89093 Gm25812-201ENSMUST00000082751 103 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
Ccl20O89093 Gm24868-201ENSMUST00000157265 136 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
Ccl20O89093 Gm25885-201ENSMUST00000157779 109 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
Ccl20O89093 Gm24077-201ENSMUST00000158183 136 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
Ccl20O89093 Gm22165-201ENSMUST00000158414 103 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
Ccl20O89093 Gm23180-201ENSMUST00000158686 125 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
Ccl20O89093 Gm25596-201ENSMUST00000178368 107 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
Ccl20O89093 Gm45125-201ENSMUST00000206908 151 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
Ccl20O89093 Gm6607-201ENSMUST00000215035 328 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
Ccl20O89093 Gm25684-201ENSMUST00000083941 107 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
Ccl20O89093 Gm23749-201ENSMUST00000104223 131 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
Ccl20O89093 Gm25753-201ENSMUST00000116792 121 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
Ccl20O89093 Gm25010-201ENSMUST00000158403 65 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
Ccl20O89093 Gm25098-201ENSMUST00000177580 79 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
Ccl20O89093 Gm23356-201ENSMUST00000177610 79 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
Ccl20O89093 Gm24027-201ENSMUST00000177611 79 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
Ccl20O89093 Gm22511-201ENSMUST00000177628 79 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
Ccl20O89093 Gm22630-201ENSMUST00000177781 79 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
Ccl20O89093 Gm23560-201ENSMUST00000177782 79 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
Ccl20O89093 Gm25462-201ENSMUST00000177833 79 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
Ccl20O89093 Gm26059-201ENSMUST00000177865 79 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
Ccl20O89093 Gm22255-201ENSMUST00000177933 79 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
Ccl20O89093 Gm25146-201ENSMUST00000177976 79 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
Ccl20O89093 Gm25523-201ENSMUST00000178044 79 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
Ccl20O89093 Gm24585-201ENSMUST00000178104 79 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
Ccl20O89093 Gm22627-201ENSMUST00000178127 79 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
Ccl20O89093 Gm22912-201ENSMUST00000178242 79 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
Ccl20O89093 Gm24866-201ENSMUST00000178338 79 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
Ccl20O89093 Gm22524-201ENSMUST00000178357 79 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
Ccl20O89093 Gm25710-201ENSMUST00000178367 79 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
Ccl20O89093 Gm23575-201ENSMUST00000178406 79 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
Ccl20O89093 Gm24872-201ENSMUST00000178434 79 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
Ccl20O89093 Gm22449-201ENSMUST00000178924 79 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
Ccl20O89093 Gm24702-201ENSMUST00000178965 79 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
Ccl20O89093 Gm24206-201ENSMUST00000179011 79 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
Ccl20O89093 Gm24528-201ENSMUST00000179164 79 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
Ccl20O89093 Gm22909-201ENSMUST00000179190 79 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
Ccl20O89093 Gm26334-201ENSMUST00000179403 79 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
Ccl20O89093 Gm25463-201ENSMUST00000179405 79 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
Ccl20O89093 Gm25742-201ENSMUST00000179530 79 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
Ccl20O89093 Gm25209-201ENSMUST00000179576 79 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
Ccl20O89093 Gm26392-201ENSMUST00000179661 79 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
Ccl20O89093 Gm25230-201ENSMUST00000179740 79 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
Ccl20O89093 Gm26434-201ENSMUST00000179778 79 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
Ccl20O89093 Gm25741-201ENSMUST00000179825 79 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
Ccl20O89093 Gm24759-201ENSMUST00000179827 79 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
Ccl20O89093 Gm24219-201ENSMUST00000179861 79 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
Ccl20O89093 Gm24134-201ENSMUST00000083361 71 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
Ccl20O89093 Gm23254-201ENSMUST00000097244 79 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
Ccl20O89093 Mir669f-201ENSMUST00000103850 121 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
Ccl20O89093 Gm24336-201ENSMUST00000104203 146 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
Ccl20O89093 Mir5619-201ENSMUST00000176065 61 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
Ccl20O89093 Gm23966-201ENSMUST00000179823 107 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
Ccl20O89093 Gm27937-201ENSMUST00000183605 88 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
Ccl20O89093 Sult1c2-ps2-201ENSMUST00000196414 276 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
Ccl20O89093 Gm20734-201ENSMUST00000216939 193 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
Ccl20O89093 Gm26253-201ENSMUST00000122493 103 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
Ccl20O89093 Gm27263-201ENSMUST00000184760 76 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
Ccl20O89093 Gm6293-201ENSMUST00000050339 195 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
Ccl20O89093 Mir183-201ENSMUST00000083685 70 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
Ccl20O89093 Traj35-201ENSMUST00000103706 65 ntAPPRIS P1 BASIC-0.77□□□□□ -2.53
Ccl20O89093 Mir18b-201ENSMUST00000103923 83 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
Ccl20O89093 Gm25619-201ENSMUST00000122621 104 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
Ccl20O89093 Gm22205-201ENSMUST00000122655 71 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
Ccl20O89093 Gm22340-201ENSMUST00000157717 114 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
Ccl20O89093 Gm22607-201ENSMUST00000158291 105 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 135.8 ms