Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

Predictions only

Length 1,324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 Gm25010-201ENSMUST00000158403 65 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.73
Ccdc171E9Q1U1 AC126939.1-201ENSMUST00000224943 226 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.73
Ccdc171E9Q1U1 Gm22055-201ENSMUST00000083388 107 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.73
Ccdc171E9Q1U1 Gm24775-201ENSMUST00000157377 99 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
Ccdc171E9Q1U1 Gm22606-201ENSMUST00000158290 103 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
Ccdc171E9Q1U1 Gm23240-201ENSMUST00000083009 121 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
Ccdc171E9Q1U1 Mir1948-201ENSMUST00000157325 85 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
Ccdc171E9Q1U1 Gm22459-201ENSMUST00000082577 108 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
Ccdc171E9Q1U1 Gm21940-201ENSMUST00000204940 2278 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
Ccdc171E9Q1U1 Gm23504-201ENSMUST00000158988 95 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
Ccdc171E9Q1U1 Gm27549-201ENSMUST00000183508 62 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
Ccdc171E9Q1U1 Gm22197-201ENSMUST00000116866 58 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
Ccdc171E9Q1U1 Gm27798-201ENSMUST00000184989 71 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
Ccdc171E9Q1U1 Gm22503-201ENSMUST00000158983 115 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
Ccdc171E9Q1U1 Gm26091-201ENSMUST00000122704 82 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
Ccdc171E9Q1U1 Gm24725-201ENSMUST00000158229 125 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
Ccdc171E9Q1U1 Gm25091-201ENSMUST00000103997 71 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
Ccdc171E9Q1U1 Gm23947-201ENSMUST00000093636 107 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
Ccdc171E9Q1U1 Gm22385-201ENSMUST00000158189 101 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
Ccdc171E9Q1U1 Gm24225-201ENSMUST00000158825 98 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
Ccdc171E9Q1U1 Gm25367-201ENSMUST00000158846 106 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
Ccdc171E9Q1U1 Gm22464-201ENSMUST00000175273 64 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
Ccdc171E9Q1U1 Gm25158-201ENSMUST00000177681 121 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
Ccdc171E9Q1U1 Gm26229-201ENSMUST00000179699 121 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
Ccdc171E9Q1U1 Gm24201-201ENSMUST00000082946 125 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
Ccdc171E9Q1U1 Snord90-201ENSMUST00000104568 111 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
Ccdc171E9Q1U1 Gm37845-201ENSMUST00000194977 355 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
Ccdc171E9Q1U1 Mir7218-201ENSMUST00000200050 59 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
Ccdc171E9Q1U1 Gm23751-201ENSMUST00000157583 136 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
Ccdc171E9Q1U1 Gm26084-201ENSMUST00000157903 104 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
Ccdc171E9Q1U1 Gm25440-201ENSMUST00000158279 154 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
Ccdc171E9Q1U1 Gm26097-201ENSMUST00000179642 93 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
Ccdc171E9Q1U1 Gm22139-201ENSMUST00000158747 105 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
Ccdc171E9Q1U1 Gm27937-201ENSMUST00000183605 88 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
Ccdc171E9Q1U1 Gm27465-201ENSMUST00000184290 91 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
Ccdc171E9Q1U1 Gm27845-201ENSMUST00000184479 114 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
Ccdc171E9Q1U1 Snord80-201ENSMUST00000083801 81 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
Ccdc171E9Q1U1 Gm24070-201ENSMUST00000104519 130 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
Ccdc171E9Q1U1 Mir1969-201ENSMUST00000157623 94 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
Ccdc171E9Q1U1 Gm23337-201ENSMUST00000158959 118 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
Ccdc171E9Q1U1 Gm22373-201ENSMUST00000104584 89 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
Ccdc171E9Q1U1 Gm25619-201ENSMUST00000122621 104 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
Ccdc171E9Q1U1 Gm23173-201ENSMUST00000157161 160 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
Ccdc171E9Q1U1 Gm45655-201ENSMUST00000211625 160 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
Ccdc171E9Q1U1 Gm22828-201ENSMUST00000083768 107 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
Ccdc171E9Q1U1 Gm25370-201ENSMUST00000158159 94 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
Ccdc171E9Q1U1 Gm25229-201ENSMUST00000178587 79 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
Ccdc171E9Q1U1 Gm25862-201ENSMUST00000158250 129 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
Ccdc171E9Q1U1 Mir669j-201ENSMUST00000179023 121 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
Ccdc171E9Q1U1 Gm26204-201ENSMUST00000082906 107 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
Ccdc171E9Q1U1 Gm22772-201ENSMUST00000104451 121 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.75
Ccdc171E9Q1U1 Gm24054-201ENSMUST00000158619 105 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.75
Ccdc171E9Q1U1 Gm8034-201ENSMUST00000178853 132 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.75
Ccdc171E9Q1U1 Gm44377-201ENSMUST00000199039 87 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.75
Ccdc171E9Q1U1 Mir5619-201ENSMUST00000176065 61 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
Ccdc171E9Q1U1 Gm27415-201ENSMUST00000183720 95 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
Ccdc171E9Q1U1 Gm45002-201ENSMUST00000208045 120 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
Ccdc171E9Q1U1 AC109214.2-201ENSMUST00000220089 358 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
Ccdc171E9Q1U1 Gm25991-201ENSMUST00000102439 99 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
Ccdc171E9Q1U1 Gm44853-201ENSMUST00000209070 250 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
Ccdc171E9Q1U1 9230110F11Rik-202ENSMUST00000212907 191 ntTSL 5 BASIC-2.17□□□□□ -2.76
Ccdc171E9Q1U1 Gm13339-201ENSMUST00000120651 510 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
Ccdc171E9Q1U1 Gm27851-201ENSMUST00000183529 63 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
Ccdc171E9Q1U1 Gm23384-201ENSMUST00000158593 103 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
Ccdc171E9Q1U1 Gm26426-201ENSMUST00000177866 123 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
Ccdc171E9Q1U1 Gm26060-201ENSMUST00000180094 123 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
Ccdc171E9Q1U1 Gm22989-201ENSMUST00000158313 86 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
Ccdc171E9Q1U1 Gm23421-201ENSMUST00000158934 104 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
Ccdc171E9Q1U1 Gm44351-201ENSMUST00000200090 95 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
Ccdc171E9Q1U1 Gm43749-201ENSMUST00000199345 352 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
Ccdc171E9Q1U1 mt-Tn-201ENSMUST00000082399 71 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
Ccdc171E9Q1U1 Gm24988-201ENSMUST00000104460 121 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.77
Ccdc171E9Q1U1 Gm25449-201ENSMUST00000179389 79 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.77
Ccdc171E9Q1U1 Gm25135-201ENSMUST00000082648 143 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.77
Ccdc171E9Q1U1 Mir379-201ENSMUST00000083564 66 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.77
Ccdc171E9Q1U1 Gm23003-201ENSMUST00000179948 107 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
Ccdc171E9Q1U1 AC122210.2-201ENSMUST00000220216 115 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
Ccdc171E9Q1U1 Gm22783-201ENSMUST00000104089 107 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
Ccdc171E9Q1U1 Gm24724-201ENSMUST00000158230 107 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
Ccdc171E9Q1U1 Gm25397-201ENSMUST00000176951 92 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
Ccdc171E9Q1U1 Mir6237-201ENSMUST00000183808 91 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
Ccdc171E9Q1U1 Gm24134-201ENSMUST00000083361 71 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
Ccdc171E9Q1U1 Gm21961-201ENSMUST00000110100 114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-2.26□□□□□ -2.77
Ccdc171E9Q1U1 Gm25889-201ENSMUST00000157775 107 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
Ccdc171E9Q1U1 Gm22699-201ENSMUST00000175376 105 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
Ccdc171E9Q1U1 Gm26498-201ENSMUST00000177799 79 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
Ccdc171E9Q1U1 Gm26230-201ENSMUST00000180141 79 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
Ccdc171E9Q1U1 Gm24801-201ENSMUST00000178503 105 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
Ccdc171E9Q1U1 Mir471-201ENSMUST00000093596 67 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
Ccdc171E9Q1U1 Mir669g-201ENSMUST00000116809 123 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
Ccdc171E9Q1U1 Gm24673-201ENSMUST00000116948 124 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
Ccdc171E9Q1U1 Gm23637-201ENSMUST00000175075 94 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
Ccdc171E9Q1U1 Gm23108-201ENSMUST00000178295 124 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
Ccdc171E9Q1U1 Gm25285-201ENSMUST00000178951 90 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
Ccdc171E9Q1U1 Mir466c-2-201ENSMUST00000180211 90 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
Ccdc171E9Q1U1 Traj29-201ENSMUST00000103712 60 ntAPPRIS P1 BASIC-2.33□□□□□ -2.78
Ccdc171E9Q1U1 Gm22101-201ENSMUST00000157928 103 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
Ccdc171E9Q1U1 Gm27905-201ENSMUST00000184005 207 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
Ccdc171E9Q1U1 Snord78-201ENSMUST00000104032 66 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
Ccdc171E9Q1U1 Mir466f-3-201ENSMUST00000104788 94 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms