Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H2

Trbv13-3, T cell receptor beta, variable 13-3 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm17364-201ENSMUST00000163881 72 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0,64□□□□□ -2,51
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm23726-201ENSMUST00000178937 67 ntBASIC-0,64□□□□□ -2,51
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm22732-201ENSMUST00000158093 121 ntBASIC-0,65□□□□□ -2,51
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Mir6481-201ENSMUST00000184617 110 ntBASIC-0,65□□□□□ -2,51
Trbv13-3A0A0B4J1H2 AC167019.1-201ENSMUST00000227913 106 ntBASIC-0,65□□□□□ -2,51
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Snora62-201ENSMUST00000082991 149 ntBASIC-0,65□□□□□ -2,51
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm22297-201ENSMUST00000083312 106 ntBASIC-0,65□□□□□ -2,51
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Traj53-201ENSMUST00000103690 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0,66□□□□□ -2,52
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm22911-201ENSMUST00000177920 107 ntBASIC-0,66□□□□□ -2,52
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm45688-201ENSMUST00000210002 101 ntBASIC-0,66□□□□□ -2,52
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Mir23a-201ENSMUST00000083677 75 ntBASIC-0,66□□□□□ -2,52
Trbv13-3A0A0B4J1H2 n-R5s8-201ENSMUST00000104121 118 ntBASIC-0,67□□□□□ -2,52
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm24916-201ENSMUST00000157287 79 ntBASIC-0,67□□□□□ -2,52
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm22384-201ENSMUST00000158187 104 ntBASIC-0,67□□□□□ -2,52
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm22140-201ENSMUST00000158745 120 ntBASIC-0,67□□□□□ -2,52
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm23197-201ENSMUST00000158809 112 ntBASIC-0,67□□□□□ -2,52
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm27735-201ENSMUST00000185085 76 ntBASIC-0,67□□□□□ -2,52
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm22055-201ENSMUST00000083388 107 ntBASIC-0,67□□□□□ -2,52
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm24384-201ENSMUST00000122693 75 ntBASIC-0,68□□□□□ -2,52
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm24001-201ENSMUST00000158463 85 ntBASIC-0,68□□□□□ -2,52
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Mir344h-1-201ENSMUST00000174922 60 ntBASIC-0,68□□□□□ -2,52
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Mir344h-2-201ENSMUST00000175612 60 ntBASIC-0,68□□□□□ -2,52
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Mir378c-201ENSMUST00000184478 99 ntBASIC-0,68□□□□□ -2,52
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Snord45b-201ENSMUST00000082797 71 ntBASIC-0,68□□□□□ -2,52
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Mir369-201ENSMUST00000083627 79 ntBASIC-0,68□□□□□ -2,52
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm24683-201ENSMUST00000104840 88 ntBASIC-0,69□□□□□ -2,52
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm24801-201ENSMUST00000178503 105 ntBASIC-0,69□□□□□ -2,52
Trbv13-3A0A0B4J1H2 AL929417.1-201ENSMUST00000214901 124 ntBASIC-0,69□□□□□ -2,52
Trbv13-3A0A0B4J1H2 AC132833.2-201ENSMUST00000228699 157 ntBASIC-0,69□□□□□ -2,52
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm24918-201ENSMUST00000083022 130 ntBASIC-0,69□□□□□ -2,52
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Mir3071-201ENSMUST00000093621 80 ntBASIC-0,69□□□□□ -2,52
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm25991-201ENSMUST00000102439 99 ntBASIC-0,7□□□□□ -2,52
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm24377-201ENSMUST00000104398 131 ntBASIC-0,7□□□□□ -2,52
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm23494-201ENSMUST00000116830 126 ntBASIC-0,7□□□□□ -2,52
Trbv13-3A0A0B4J1H2 AC166341.8-201ENSMUST00000221267 108 ntBASIC-0,7□□□□□ -2,52
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Mirlet7d-201ENSMUST00000083519 103 ntBASIC-0,7□□□□□ -2,52
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm22827-201ENSMUST00000083766 107 ntBASIC-0,7□□□□□ -2,52
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm10813-201ENSMUST00000099936 90 ntBASIC-0,7□□□□□ -2,52
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Mir6904-201ENSMUST00000183443 67 ntBASIC-0,71□□□□□ -2,52
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm27549-201ENSMUST00000183508 62 ntBASIC-0,71□□□□□ -2,52
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Mir7673-201ENSMUST00000184567 64 ntBASIC-0,71□□□□□ -2,52
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm22672-201ENSMUST00000104414 134 ntBASIC-0,72□□□□□ -2,52
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Mir103-1-201ENSMUST00000083619 86 ntBASIC-0,72□□□□□ -2,52
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Mir183-201ENSMUST00000083685 70 ntBASIC-0,72□□□□□ -2,52
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm24381-201ENSMUST00000122697 104 ntBASIC-0,73□□□□□ -2,53
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm27884-201ENSMUST00000183865 76 ntBASIC-0,73□□□□□ -2,53
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm26081-201ENSMUST00000104068 132 ntBASIC-0,74□□□□□ -2,53
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm24336-201ENSMUST00000104203 146 ntBASIC-0,74□□□□□ -2,53
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm25646-201ENSMUST00000178527 79 ntBASIC-0,74□□□□□ -2,53
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm45655-201ENSMUST00000211625 160 ntBASIC-0,74□□□□□ -2,53
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Mir148a-201ENSMUST00000083571 99 ntBASIC-0,74□□□□□ -2,53
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Mir18b-201ENSMUST00000103923 83 ntBASIC-0,75□□□□□ -2,53
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm27686-201ENSMUST00000185123 91 ntBASIC-0,75□□□□□ -2,53
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm11250-201ENSMUST00000142137 306 ntTSL 5 BASIC-0,76□□□□□ -2,53
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm25010-201ENSMUST00000158403 65 ntBASIC-0,76□□□□□ -2,53
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm25678-201ENSMUST00000174984 73 ntBASIC-0,76□□□□□ -2,53
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm20108-201ENSMUST00000219977 153 ntBASIC-0,77□□□□□ -2,53
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm6293-201ENSMUST00000050339 195 ntBASIC-0,77□□□□□ -2,53
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm22459-201ENSMUST00000082577 108 ntBASIC-0,77□□□□□ -2,53
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Mir669m-1-201ENSMUST00000158945 98 ntBASIC-0,78□□□□□ -2,53
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm24926-201ENSMUST00000178053 79 ntBASIC-0,78□□□□□ -2,53
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm22632-201ENSMUST00000178266 79 ntBASIC-0,78□□□□□ -2,53
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Mir5124b-201ENSMUST00000184251 85 ntBASIC-0,78□□□□□ -2,53
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm42844-201ENSMUST00000200355 112 ntBASIC-0,78□□□□□ -2,53
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm45125-201ENSMUST00000206908 151 ntBASIC-0,78□□□□□ -2,53
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Mir5117-201ENSMUST00000083226 84 ntBASIC-0,78□□□□□ -2,53
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm24183-201ENSMUST00000122572 93 ntBASIC-0,79□□□□□ -2,54
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm23044-201ENSMUST00000157891 100 ntBASIC-0,79□□□□□ -2,54
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Rnu6-ps2-201ENSMUST00000178059 107 ntBASIC-0,79□□□□□ -2,54
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm25753-201ENSMUST00000116792 121 ntBASIC-0,8□□□□□ -2,54
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm23261-201ENSMUST00000158316 136 ntBASIC-0,8□□□□□ -2,54
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm22165-201ENSMUST00000158414 103 ntBASIC-0,8□□□□□ -2,54
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm24971-201ENSMUST00000175581 110 ntBASIC-0,8□□□□□ -2,54
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm27937-201ENSMUST00000183605 88 ntBASIC-0,8□□□□□ -2,54
Trbv13-3A0A0B4J1H2 mt-Tv-201ENSMUST00000082389 69 ntBASIC-0,8□□□□□ -2,54
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm24134-201ENSMUST00000083361 71 ntBASIC-0,8□□□□□ -2,54
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm25915-201ENSMUST00000104265 126 ntBASIC-0,82□□□□□ -2,54
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm22490-201ENSMUST00000157188 119 ntBASIC-0,82□□□□□ -2,54
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm22770-201ENSMUST00000158368 67 ntBASIC-0,82□□□□□ -2,54
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Mir5619-201ENSMUST00000176065 61 ntBASIC-0,82□□□□□ -2,54
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm22070-201ENSMUST00000178475 107 ntBASIC-0,82□□□□□ -2,54
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm25870-201ENSMUST00000179845 79 ntBASIC-0,82□□□□□ -2,54
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm27263-201ENSMUST00000184760 76 ntBASIC-0,82□□□□□ -2,54
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Mir466-201ENSMUST00000093591 73 ntBASIC-0,82□□□□□ -2,54
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm24070-201ENSMUST00000104519 130 ntBASIC-0,83□□□□□ -2,54
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm17490-201ENSMUST00000166779 63 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0,83□□□□□ -2,54
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Sult1c2-ps2-201ENSMUST00000196414 276 ntBASIC-0,83□□□□□ -2,54
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Mir717-201ENSMUST00000102259 109 ntBASIC-0,84□□□□□ -2,54
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm25108-201ENSMUST00000122473 78 ntBASIC-0,84□□□□□ -2,54
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm25098-201ENSMUST00000177580 79 ntBASIC-0,84□□□□□ -2,54
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm23017-201ENSMUST00000177583 72 ntBASIC-0,84□□□□□ -2,54
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm23356-201ENSMUST00000177610 79 ntBASIC-0,84□□□□□ -2,54
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm24027-201ENSMUST00000177611 79 ntBASIC-0,84□□□□□ -2,54
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm22511-201ENSMUST00000177628 79 ntBASIC-0,84□□□□□ -2,54
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm22630-201ENSMUST00000177781 79 ntBASIC-0,84□□□□□ -2,54
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm23560-201ENSMUST00000177782 79 ntBASIC-0,84□□□□□ -2,54
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm25462-201ENSMUST00000177833 79 ntBASIC-0,84□□□□□ -2,54
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm26059-201ENSMUST00000177865 79 ntBASIC-0,84□□□□□ -2,54
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm22255-201ENSMUST00000177933 79 ntBASIC-0,84□□□□□ -2,54
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm25146-201ENSMUST00000177976 79 ntBASIC-0,84□□□□□ -2,54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9,6 ms