Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Speer3W4VSP1 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Speer3W4VSP1 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Speer3W4VSP1 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Speer3W4VSP1 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Speer3W4VSP1 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Speer3W4VSP1 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Speer3W4VSP1 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Speer3W4VSP1 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Speer3W4VSP1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Speer3W4VSP1 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Speer3W4VSP1 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Speer3W4VSP1 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Speer3W4VSP1 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Speer3W4VSP1 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Speer3W4VSP1 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Speer3W4VSP1 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Speer3W4VSP1 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Speer3W4VSP1 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Speer3W4VSP1 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Speer3W4VSP1 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Speer3W4VSP1 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Speer3W4VSP1 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Speer3W4VSP1 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Speer3W4VSP1 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Speer3W4VSP1 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Speer3W4VSP1 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Speer3W4VSP1 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Speer3W4VSP1 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Speer3W4VSP1 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Speer3W4VSP1 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Speer3W4VSP1 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Speer3W4VSP1 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Speer3W4VSP1 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Speer3W4VSP1 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Speer3W4VSP1 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Speer3W4VSP1 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Speer3W4VSP1 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Speer3W4VSP1 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Speer3W4VSP1 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Speer3W4VSP1 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Speer3W4VSP1 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Speer3W4VSP1 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Speer3W4VSP1 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Speer3W4VSP1 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Speer3W4VSP1 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Speer3W4VSP1 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Speer3W4VSP1 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Speer3W4VSP1 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Speer3W4VSP1 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Speer3W4VSP1 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Speer3W4VSP1 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Speer3W4VSP1 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Speer3W4VSP1 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Speer3W4VSP1 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Speer3W4VSP1 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Speer3W4VSP1 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Speer3W4VSP1 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Speer3W4VSP1 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Speer3W4VSP1 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Speer3W4VSP1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Speer3W4VSP1 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Speer3W4VSP1 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Speer3W4VSP1 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Speer3W4VSP1 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Speer3W4VSP1 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Speer3W4VSP1 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Speer3W4VSP1 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Speer3W4VSP1 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Speer3W4VSP1 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Speer3W4VSP1 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Speer3W4VSP1 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Speer3W4VSP1 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Speer3W4VSP1 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Speer3W4VSP1 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Speer3W4VSP1 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Speer3W4VSP1 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Speer3W4VSP1 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Speer3W4VSP1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Speer3W4VSP1 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Speer3W4VSP1 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Speer3W4VSP1 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Speer3W4VSP1 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Speer3W4VSP1 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Speer3W4VSP1 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Speer3W4VSP1 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Speer3W4VSP1 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Speer3W4VSP1 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Speer3W4VSP1 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Speer3W4VSP1 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Speer3W4VSP1 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Speer3W4VSP1 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Speer3W4VSP1 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Speer3W4VSP1 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Speer3W4VSP1 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Speer3W4VSP1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Speer3W4VSP1 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Speer3W4VSP1 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Speer3W4VSP1 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Speer3W4VSP1 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms