Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm3550W4VSN7 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm3550W4VSN7 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm3550W4VSN7 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm3550W4VSN7 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm3550W4VSN7 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm3550W4VSN7 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm3550W4VSN7 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm3550W4VSN7 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm3550W4VSN7 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm3550W4VSN7 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm3550W4VSN7 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm3550W4VSN7 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm3550W4VSN7 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm3550W4VSN7 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm3550W4VSN7 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm3550W4VSN7 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm3550W4VSN7 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm3550W4VSN7 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm3550W4VSN7 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm3550W4VSN7 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm3550W4VSN7 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm3550W4VSN7 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm3550W4VSN7 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm3550W4VSN7 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm3550W4VSN7 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm3550W4VSN7 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm3550W4VSN7 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm3550W4VSN7 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm3550W4VSN7 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm3550W4VSN7 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm3550W4VSN7 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm3550W4VSN7 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm3550W4VSN7 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm3550W4VSN7 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm3550W4VSN7 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm3550W4VSN7 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm3550W4VSN7 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm3550W4VSN7 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm3550W4VSN7 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm3550W4VSN7 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm3550W4VSN7 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm3550W4VSN7 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm3550W4VSN7 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm3550W4VSN7 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm3550W4VSN7 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm3550W4VSN7 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm3550W4VSN7 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm3550W4VSN7 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm3550W4VSN7 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm3550W4VSN7 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm3550W4VSN7 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm3550W4VSN7 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm3550W4VSN7 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm3550W4VSN7 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm3550W4VSN7 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm3550W4VSN7 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm3550W4VSN7 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm3550W4VSN7 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm3550W4VSN7 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm3550W4VSN7 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm3550W4VSN7 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm3550W4VSN7 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm3550W4VSN7 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm3550W4VSN7 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm3550W4VSN7 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm3550W4VSN7 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm3550W4VSN7 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm3550W4VSN7 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm3550W4VSN7 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm3550W4VSN7 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm3550W4VSN7 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm3550W4VSN7 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm3550W4VSN7 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm3550W4VSN7 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm3550W4VSN7 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Gm3550W4VSN7 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Gm3550W4VSN7 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Gm3550W4VSN7 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Gm3550W4VSN7 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm3550W4VSN7 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm3550W4VSN7 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm3550W4VSN7 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm3550W4VSN7 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm3550W4VSN7 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm3550W4VSN7 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm3550W4VSN7 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm3550W4VSN7 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm3550W4VSN7 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm3550W4VSN7 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm3550W4VSN7 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm3550W4VSN7 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm3550W4VSN7 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm3550W4VSN7 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm3550W4VSN7 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm3550W4VSN7 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm3550W4VSN7 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm3550W4VSN7 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm3550W4VSN7 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm3550W4VSN7 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms