Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z331

Krt6b, Keratin, type II cytoskeletal 6B, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt6bQ9Z331 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt6bQ9Z331 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt6bQ9Z331 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt6bQ9Z331 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt6bQ9Z331 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt6bQ9Z331 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt6bQ9Z331 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt6bQ9Z331 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt6bQ9Z331 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt6bQ9Z331 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt6bQ9Z331 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt6bQ9Z331 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt6bQ9Z331 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt6bQ9Z331 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt6bQ9Z331 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt6bQ9Z331 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt6bQ9Z331 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt6bQ9Z331 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt6bQ9Z331 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt6bQ9Z331 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt6bQ9Z331 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt6bQ9Z331 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt6bQ9Z331 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt6bQ9Z331 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt6bQ9Z331 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt6bQ9Z331 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt6bQ9Z331 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt6bQ9Z331 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt6bQ9Z331 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt6bQ9Z331 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt6bQ9Z331 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt6bQ9Z331 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt6bQ9Z331 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt6bQ9Z331 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt6bQ9Z331 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt6bQ9Z331 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt6bQ9Z331 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt6bQ9Z331 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt6bQ9Z331 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt6bQ9Z331 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt6bQ9Z331 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt6bQ9Z331 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt6bQ9Z331 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt6bQ9Z331 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt6bQ9Z331 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt6bQ9Z331 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt6bQ9Z331 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt6bQ9Z331 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt6bQ9Z331 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt6bQ9Z331 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt6bQ9Z331 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt6bQ9Z331 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt6bQ9Z331 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt6bQ9Z331 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt6bQ9Z331 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt6bQ9Z331 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt6bQ9Z331 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt6bQ9Z331 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt6bQ9Z331 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt6bQ9Z331 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt6bQ9Z331 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt6bQ9Z331 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt6bQ9Z331 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt6bQ9Z331 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt6bQ9Z331 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt6bQ9Z331 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt6bQ9Z331 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt6bQ9Z331 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt6bQ9Z331 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt6bQ9Z331 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt6bQ9Z331 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt6bQ9Z331 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt6bQ9Z331 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt6bQ9Z331 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt6bQ9Z331 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt6bQ9Z331 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt6bQ9Z331 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt6bQ9Z331 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt6bQ9Z331 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt6bQ9Z331 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt6bQ9Z331 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt6bQ9Z331 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt6bQ9Z331 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt6bQ9Z331 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt6bQ9Z331 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt6bQ9Z331 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt6bQ9Z331 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt6bQ9Z331 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt6bQ9Z331 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt6bQ9Z331 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt6bQ9Z331 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt6bQ9Z331 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt6bQ9Z331 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt6bQ9Z331 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt6bQ9Z331 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt6bQ9Z331 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt6bQ9Z331 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt6bQ9Z331 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt6bQ9Z331 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt6bQ9Z331 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms