Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Crlf3Q9Z2L7 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Crlf3Q9Z2L7 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Crlf3Q9Z2L7 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Crlf3Q9Z2L7 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Crlf3Q9Z2L7 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Crlf3Q9Z2L7 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Crlf3Q9Z2L7 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Crlf3Q9Z2L7 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Crlf3Q9Z2L7 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Crlf3Q9Z2L7 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Crlf3Q9Z2L7 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Crlf3Q9Z2L7 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Crlf3Q9Z2L7 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Crlf3Q9Z2L7 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Crlf3Q9Z2L7 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Crlf3Q9Z2L7 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Crlf3Q9Z2L7 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Crlf3Q9Z2L7 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Crlf3Q9Z2L7 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Crlf3Q9Z2L7 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Crlf3Q9Z2L7 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Crlf3Q9Z2L7 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Crlf3Q9Z2L7 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Crlf3Q9Z2L7 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Crlf3Q9Z2L7 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Crlf3Q9Z2L7 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Crlf3Q9Z2L7 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Crlf3Q9Z2L7 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Crlf3Q9Z2L7 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Crlf3Q9Z2L7 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Crlf3Q9Z2L7 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Crlf3Q9Z2L7 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Crlf3Q9Z2L7 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Crlf3Q9Z2L7 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Crlf3Q9Z2L7 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Crlf3Q9Z2L7 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Crlf3Q9Z2L7 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Crlf3Q9Z2L7 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Crlf3Q9Z2L7 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Crlf3Q9Z2L7 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Crlf3Q9Z2L7 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Crlf3Q9Z2L7 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Crlf3Q9Z2L7 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Crlf3Q9Z2L7 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Crlf3Q9Z2L7 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Crlf3Q9Z2L7 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Crlf3Q9Z2L7 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Crlf3Q9Z2L7 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Crlf3Q9Z2L7 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Crlf3Q9Z2L7 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Crlf3Q9Z2L7 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Crlf3Q9Z2L7 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Crlf3Q9Z2L7 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Crlf3Q9Z2L7 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Crlf3Q9Z2L7 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Crlf3Q9Z2L7 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Crlf3Q9Z2L7 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Crlf3Q9Z2L7 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Crlf3Q9Z2L7 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Crlf3Q9Z2L7 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Crlf3Q9Z2L7 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Crlf3Q9Z2L7 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Crlf3Q9Z2L7 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Crlf3Q9Z2L7 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Crlf3Q9Z2L7 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Crlf3Q9Z2L7 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Crlf3Q9Z2L7 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Crlf3Q9Z2L7 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Crlf3Q9Z2L7 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Crlf3Q9Z2L7 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Crlf3Q9Z2L7 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Crlf3Q9Z2L7 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Crlf3Q9Z2L7 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Crlf3Q9Z2L7 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Crlf3Q9Z2L7 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Crlf3Q9Z2L7 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Crlf3Q9Z2L7 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Crlf3Q9Z2L7 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Crlf3Q9Z2L7 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Crlf3Q9Z2L7 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Crlf3Q9Z2L7 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Crlf3Q9Z2L7 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Crlf3Q9Z2L7 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Crlf3Q9Z2L7 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Crlf3Q9Z2L7 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Crlf3Q9Z2L7 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Crlf3Q9Z2L7 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Crlf3Q9Z2L7 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Crlf3Q9Z2L7 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Crlf3Q9Z2L7 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Crlf3Q9Z2L7 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Crlf3Q9Z2L7 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Crlf3Q9Z2L7 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Crlf3Q9Z2L7 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Crlf3Q9Z2L7 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Crlf3Q9Z2L7 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Crlf3Q9Z2L7 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Crlf3Q9Z2L7 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Crlf3Q9Z2L7 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.7 ms