Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2K1

Krt16, Keratin, type I cytoskeletal 16, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt16Q9Z2K1 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt16Q9Z2K1 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt16Q9Z2K1 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt16Q9Z2K1 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt16Q9Z2K1 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt16Q9Z2K1 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt16Q9Z2K1 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt16Q9Z2K1 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt16Q9Z2K1 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt16Q9Z2K1 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt16Q9Z2K1 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt16Q9Z2K1 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt16Q9Z2K1 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt16Q9Z2K1 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt16Q9Z2K1 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt16Q9Z2K1 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt16Q9Z2K1 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt16Q9Z2K1 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt16Q9Z2K1 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt16Q9Z2K1 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt16Q9Z2K1 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt16Q9Z2K1 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt16Q9Z2K1 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt16Q9Z2K1 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt16Q9Z2K1 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt16Q9Z2K1 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt16Q9Z2K1 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Krt16Q9Z2K1 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Krt16Q9Z2K1 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Krt16Q9Z2K1 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Krt16Q9Z2K1 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Krt16Q9Z2K1 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Krt16Q9Z2K1 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Krt16Q9Z2K1 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Krt16Q9Z2K1 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Krt16Q9Z2K1 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Krt16Q9Z2K1 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Krt16Q9Z2K1 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Krt16Q9Z2K1 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Krt16Q9Z2K1 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Krt16Q9Z2K1 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Krt16Q9Z2K1 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Krt16Q9Z2K1 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Krt16Q9Z2K1 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Krt16Q9Z2K1 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Krt16Q9Z2K1 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Krt16Q9Z2K1 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Krt16Q9Z2K1 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Krt16Q9Z2K1 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Krt16Q9Z2K1 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Krt16Q9Z2K1 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Krt16Q9Z2K1 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Krt16Q9Z2K1 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Krt16Q9Z2K1 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Krt16Q9Z2K1 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Krt16Q9Z2K1 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Krt16Q9Z2K1 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Krt16Q9Z2K1 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Krt16Q9Z2K1 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt16Q9Z2K1 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt16Q9Z2K1 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt16Q9Z2K1 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt16Q9Z2K1 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt16Q9Z2K1 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt16Q9Z2K1 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt16Q9Z2K1 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt16Q9Z2K1 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt16Q9Z2K1 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt16Q9Z2K1 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt16Q9Z2K1 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt16Q9Z2K1 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt16Q9Z2K1 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt16Q9Z2K1 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt16Q9Z2K1 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt16Q9Z2K1 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt16Q9Z2K1 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt16Q9Z2K1 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt16Q9Z2K1 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt16Q9Z2K1 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt16Q9Z2K1 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt16Q9Z2K1 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt16Q9Z2K1 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt16Q9Z2K1 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt16Q9Z2K1 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt16Q9Z2K1 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt16Q9Z2K1 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt16Q9Z2K1 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt16Q9Z2K1 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt16Q9Z2K1 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt16Q9Z2K1 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt16Q9Z2K1 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt16Q9Z2K1 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt16Q9Z2K1 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt16Q9Z2K1 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt16Q9Z2K1 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt16Q9Z2K1 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt16Q9Z2K1 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt16Q9Z2K1 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt16Q9Z2K1 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt16Q9Z2K1 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms