Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2I4

Robo3, Roundabout homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Robo3Q9Z2I4 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Robo3Q9Z2I4 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Robo3Q9Z2I4 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Robo3Q9Z2I4 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Robo3Q9Z2I4 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Robo3Q9Z2I4 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Robo3Q9Z2I4 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Robo3Q9Z2I4 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Robo3Q9Z2I4 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Robo3Q9Z2I4 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Robo3Q9Z2I4 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Robo3Q9Z2I4 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Robo3Q9Z2I4 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Robo3Q9Z2I4 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Robo3Q9Z2I4 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Robo3Q9Z2I4 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Robo3Q9Z2I4 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Robo3Q9Z2I4 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Robo3Q9Z2I4 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Robo3Q9Z2I4 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Robo3Q9Z2I4 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Robo3Q9Z2I4 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Robo3Q9Z2I4 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Robo3Q9Z2I4 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Robo3Q9Z2I4 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Robo3Q9Z2I4 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Robo3Q9Z2I4 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Robo3Q9Z2I4 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Robo3Q9Z2I4 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Robo3Q9Z2I4 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Robo3Q9Z2I4 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Robo3Q9Z2I4 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Robo3Q9Z2I4 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Robo3Q9Z2I4 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Robo3Q9Z2I4 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Robo3Q9Z2I4 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Robo3Q9Z2I4 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Robo3Q9Z2I4 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Robo3Q9Z2I4 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Robo3Q9Z2I4 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Robo3Q9Z2I4 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Robo3Q9Z2I4 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Robo3Q9Z2I4 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Robo3Q9Z2I4 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Robo3Q9Z2I4 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Robo3Q9Z2I4 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Robo3Q9Z2I4 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Robo3Q9Z2I4 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Robo3Q9Z2I4 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Robo3Q9Z2I4 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Robo3Q9Z2I4 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Robo3Q9Z2I4 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Robo3Q9Z2I4 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Robo3Q9Z2I4 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Robo3Q9Z2I4 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Robo3Q9Z2I4 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Robo3Q9Z2I4 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Robo3Q9Z2I4 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Robo3Q9Z2I4 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Robo3Q9Z2I4 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Robo3Q9Z2I4 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Robo3Q9Z2I4 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Robo3Q9Z2I4 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Robo3Q9Z2I4 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Robo3Q9Z2I4 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Robo3Q9Z2I4 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Robo3Q9Z2I4 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Robo3Q9Z2I4 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Robo3Q9Z2I4 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Robo3Q9Z2I4 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Robo3Q9Z2I4 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Robo3Q9Z2I4 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Robo3Q9Z2I4 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Robo3Q9Z2I4 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Robo3Q9Z2I4 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Robo3Q9Z2I4 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Robo3Q9Z2I4 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Robo3Q9Z2I4 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Robo3Q9Z2I4 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Robo3Q9Z2I4 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Robo3Q9Z2I4 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Robo3Q9Z2I4 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Robo3Q9Z2I4 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Robo3Q9Z2I4 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Robo3Q9Z2I4 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Robo3Q9Z2I4 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Robo3Q9Z2I4 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Robo3Q9Z2I4 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Robo3Q9Z2I4 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Robo3Q9Z2I4 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Robo3Q9Z2I4 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Robo3Q9Z2I4 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Robo3Q9Z2I4 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Robo3Q9Z2I4 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Robo3Q9Z2I4 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Robo3Q9Z2I4 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Robo3Q9Z2I4 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Robo3Q9Z2I4 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Robo3Q9Z2I4 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Robo3Q9Z2I4 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms