Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z273

Tulp1, Tubby-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tulp1Q9Z273 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tulp1Q9Z273 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tulp1Q9Z273 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tulp1Q9Z273 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tulp1Q9Z273 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tulp1Q9Z273 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tulp1Q9Z273 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tulp1Q9Z273 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tulp1Q9Z273 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tulp1Q9Z273 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tulp1Q9Z273 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Tulp1Q9Z273 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tulp1Q9Z273 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tulp1Q9Z273 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tulp1Q9Z273 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tulp1Q9Z273 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Tulp1Q9Z273 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tulp1Q9Z273 Gm38116-201ENSMUST00000193873 1533 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Tulp1Q9Z273 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Tulp1Q9Z273 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tulp1Q9Z273 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tulp1Q9Z273 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Tulp1Q9Z273 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Tulp1Q9Z273 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Tulp1Q9Z273 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Tulp1Q9Z273 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tulp1Q9Z273 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tulp1Q9Z273 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tulp1Q9Z273 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Tulp1Q9Z273 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tulp1Q9Z273 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tulp1Q9Z273 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tulp1Q9Z273 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Tulp1Q9Z273 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tulp1Q9Z273 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tulp1Q9Z273 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tulp1Q9Z273 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tulp1Q9Z273 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tulp1Q9Z273 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tulp1Q9Z273 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tulp1Q9Z273 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Tulp1Q9Z273 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tulp1Q9Z273 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tulp1Q9Z273 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tulp1Q9Z273 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tulp1Q9Z273 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tulp1Q9Z273 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tulp1Q9Z273 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tulp1Q9Z273 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tulp1Q9Z273 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tulp1Q9Z273 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tulp1Q9Z273 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tulp1Q9Z273 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tulp1Q9Z273 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tulp1Q9Z273 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Tulp1Q9Z273 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tulp1Q9Z273 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tulp1Q9Z273 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tulp1Q9Z273 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tulp1Q9Z273 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tulp1Q9Z273 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tulp1Q9Z273 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tulp1Q9Z273 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tulp1Q9Z273 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tulp1Q9Z273 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tulp1Q9Z273 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tulp1Q9Z273 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tulp1Q9Z273 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tulp1Q9Z273 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tulp1Q9Z273 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tulp1Q9Z273 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tulp1Q9Z273 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tulp1Q9Z273 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tulp1Q9Z273 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tulp1Q9Z273 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tulp1Q9Z273 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tulp1Q9Z273 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tulp1Q9Z273 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Tulp1Q9Z273 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tulp1Q9Z273 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tulp1Q9Z273 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tulp1Q9Z273 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tulp1Q9Z273 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tulp1Q9Z273 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tulp1Q9Z273 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tulp1Q9Z273 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tulp1Q9Z273 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tulp1Q9Z273 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tulp1Q9Z273 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tulp1Q9Z273 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tulp1Q9Z273 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tulp1Q9Z273 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tulp1Q9Z273 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tulp1Q9Z273 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tulp1Q9Z273 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tulp1Q9Z273 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Tulp1Q9Z273 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tulp1Q9Z273 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tulp1Q9Z273 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tulp1Q9Z273 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms