Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Z0

Uso1, General vesicular transport factor p115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 959 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uso1Q9Z1Z0 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Uso1Q9Z1Z0 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Uso1Q9Z1Z0 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Uso1Q9Z1Z0 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Uso1Q9Z1Z0 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Uso1Q9Z1Z0 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Uso1Q9Z1Z0 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Uso1Q9Z1Z0 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Uso1Q9Z1Z0 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Uso1Q9Z1Z0 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Uso1Q9Z1Z0 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Uso1Q9Z1Z0 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Uso1Q9Z1Z0 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Uso1Q9Z1Z0 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Uso1Q9Z1Z0 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Uso1Q9Z1Z0 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Uso1Q9Z1Z0 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Uso1Q9Z1Z0 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Uso1Q9Z1Z0 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Uso1Q9Z1Z0 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Uso1Q9Z1Z0 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Uso1Q9Z1Z0 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Uso1Q9Z1Z0 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Uso1Q9Z1Z0 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Uso1Q9Z1Z0 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Uso1Q9Z1Z0 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Uso1Q9Z1Z0 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Uso1Q9Z1Z0 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Uso1Q9Z1Z0 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Uso1Q9Z1Z0 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Uso1Q9Z1Z0 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Uso1Q9Z1Z0 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Uso1Q9Z1Z0 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Uso1Q9Z1Z0 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Uso1Q9Z1Z0 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Uso1Q9Z1Z0 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Uso1Q9Z1Z0 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Uso1Q9Z1Z0 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Uso1Q9Z1Z0 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Uso1Q9Z1Z0 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Uso1Q9Z1Z0 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Uso1Q9Z1Z0 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Uso1Q9Z1Z0 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Uso1Q9Z1Z0 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Uso1Q9Z1Z0 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Uso1Q9Z1Z0 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Uso1Q9Z1Z0 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Uso1Q9Z1Z0 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Uso1Q9Z1Z0 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Uso1Q9Z1Z0 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Uso1Q9Z1Z0 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Uso1Q9Z1Z0 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Uso1Q9Z1Z0 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Uso1Q9Z1Z0 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Uso1Q9Z1Z0 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Uso1Q9Z1Z0 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Uso1Q9Z1Z0 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Uso1Q9Z1Z0 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Uso1Q9Z1Z0 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Uso1Q9Z1Z0 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Uso1Q9Z1Z0 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Uso1Q9Z1Z0 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Uso1Q9Z1Z0 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Uso1Q9Z1Z0 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Uso1Q9Z1Z0 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Uso1Q9Z1Z0 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Uso1Q9Z1Z0 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Uso1Q9Z1Z0 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Uso1Q9Z1Z0 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Uso1Q9Z1Z0 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Uso1Q9Z1Z0 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Uso1Q9Z1Z0 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Uso1Q9Z1Z0 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Uso1Q9Z1Z0 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Uso1Q9Z1Z0 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Uso1Q9Z1Z0 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Uso1Q9Z1Z0 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Uso1Q9Z1Z0 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Uso1Q9Z1Z0 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Uso1Q9Z1Z0 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Uso1Q9Z1Z0 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Uso1Q9Z1Z0 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Uso1Q9Z1Z0 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Uso1Q9Z1Z0 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Uso1Q9Z1Z0 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Uso1Q9Z1Z0 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Uso1Q9Z1Z0 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Uso1Q9Z1Z0 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Uso1Q9Z1Z0 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Uso1Q9Z1Z0 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Uso1Q9Z1Z0 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Uso1Q9Z1Z0 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Uso1Q9Z1Z0 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Uso1Q9Z1Z0 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Uso1Q9Z1Z0 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Uso1Q9Z1Z0 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Uso1Q9Z1Z0 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Uso1Q9Z1Z0 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Uso1Q9Z1Z0 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Uso1Q9Z1Z0 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms