Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ap3b1Q9Z1T1 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ap3b1Q9Z1T1 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ap3b1Q9Z1T1 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ap3b1Q9Z1T1 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ap3b1Q9Z1T1 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ap3b1Q9Z1T1 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ap3b1Q9Z1T1 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Ap3b1Q9Z1T1 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ap3b1Q9Z1T1 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ap3b1Q9Z1T1 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ap3b1Q9Z1T1 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ap3b1Q9Z1T1 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ap3b1Q9Z1T1 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Ap3b1Q9Z1T1 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ap3b1Q9Z1T1 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ap3b1Q9Z1T1 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ap3b1Q9Z1T1 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ap3b1Q9Z1T1 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ap3b1Q9Z1T1 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ap3b1Q9Z1T1 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ap3b1Q9Z1T1 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ap3b1Q9Z1T1 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ap3b1Q9Z1T1 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ap3b1Q9Z1T1 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ap3b1Q9Z1T1 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Ap3b1Q9Z1T1 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ap3b1Q9Z1T1 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ap3b1Q9Z1T1 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ap3b1Q9Z1T1 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ap3b1Q9Z1T1 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ap3b1Q9Z1T1 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ap3b1Q9Z1T1 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ap3b1Q9Z1T1 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ap3b1Q9Z1T1 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Ap3b1Q9Z1T1 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ap3b1Q9Z1T1 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ap3b1Q9Z1T1 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ap3b1Q9Z1T1 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ap3b1Q9Z1T1 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ap3b1Q9Z1T1 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ap3b1Q9Z1T1 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ap3b1Q9Z1T1 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ap3b1Q9Z1T1 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ap3b1Q9Z1T1 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ap3b1Q9Z1T1 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ap3b1Q9Z1T1 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ap3b1Q9Z1T1 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ap3b1Q9Z1T1 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ap3b1Q9Z1T1 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ap3b1Q9Z1T1 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ap3b1Q9Z1T1 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ap3b1Q9Z1T1 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ap3b1Q9Z1T1 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ap3b1Q9Z1T1 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ap3b1Q9Z1T1 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ap3b1Q9Z1T1 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ap3b1Q9Z1T1 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ap3b1Q9Z1T1 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ap3b1Q9Z1T1 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ap3b1Q9Z1T1 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ap3b1Q9Z1T1 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ap3b1Q9Z1T1 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ap3b1Q9Z1T1 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ap3b1Q9Z1T1 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ap3b1Q9Z1T1 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ap3b1Q9Z1T1 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Ap3b1Q9Z1T1 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ap3b1Q9Z1T1 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ap3b1Q9Z1T1 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ap3b1Q9Z1T1 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ap3b1Q9Z1T1 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ap3b1Q9Z1T1 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ap3b1Q9Z1T1 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ap3b1Q9Z1T1 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ap3b1Q9Z1T1 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ap3b1Q9Z1T1 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ap3b1Q9Z1T1 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ap3b1Q9Z1T1 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ap3b1Q9Z1T1 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ap3b1Q9Z1T1 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ap3b1Q9Z1T1 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ap3b1Q9Z1T1 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ap3b1Q9Z1T1 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ap3b1Q9Z1T1 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ap3b1Q9Z1T1 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ap3b1Q9Z1T1 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ap3b1Q9Z1T1 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ap3b1Q9Z1T1 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ap3b1Q9Z1T1 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ap3b1Q9Z1T1 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Ap3b1Q9Z1T1 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Ap3b1Q9Z1T1 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ap3b1Q9Z1T1 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ap3b1Q9Z1T1 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ap3b1Q9Z1T1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ap3b1Q9Z1T1 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms