Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z183

Padi4, Protein-arginine deiminase type-4, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Padi4Q9Z183 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Padi4Q9Z183 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Padi4Q9Z183 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Padi4Q9Z183 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Padi4Q9Z183 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Padi4Q9Z183 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Padi4Q9Z183 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Padi4Q9Z183 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Padi4Q9Z183 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Padi4Q9Z183 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Padi4Q9Z183 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Padi4Q9Z183 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Padi4Q9Z183 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Padi4Q9Z183 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Padi4Q9Z183 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Padi4Q9Z183 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Padi4Q9Z183 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Padi4Q9Z183 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Padi4Q9Z183 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Padi4Q9Z183 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Padi4Q9Z183 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Padi4Q9Z183 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Padi4Q9Z183 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Padi4Q9Z183 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Padi4Q9Z183 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Padi4Q9Z183 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Padi4Q9Z183 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Padi4Q9Z183 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Padi4Q9Z183 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Padi4Q9Z183 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Padi4Q9Z183 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Padi4Q9Z183 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Padi4Q9Z183 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Padi4Q9Z183 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Padi4Q9Z183 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Padi4Q9Z183 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Padi4Q9Z183 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Padi4Q9Z183 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Padi4Q9Z183 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Padi4Q9Z183 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Padi4Q9Z183 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Padi4Q9Z183 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Padi4Q9Z183 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Padi4Q9Z183 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Padi4Q9Z183 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Padi4Q9Z183 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Padi4Q9Z183 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Padi4Q9Z183 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Padi4Q9Z183 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Padi4Q9Z183 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Padi4Q9Z183 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Padi4Q9Z183 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Padi4Q9Z183 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Padi4Q9Z183 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Padi4Q9Z183 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Padi4Q9Z183 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Padi4Q9Z183 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Padi4Q9Z183 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Padi4Q9Z183 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Padi4Q9Z183 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Padi4Q9Z183 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Padi4Q9Z183 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Padi4Q9Z183 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Padi4Q9Z183 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Padi4Q9Z183 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Padi4Q9Z183 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Padi4Q9Z183 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Padi4Q9Z183 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Padi4Q9Z183 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Padi4Q9Z183 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Padi4Q9Z183 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Padi4Q9Z183 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Padi4Q9Z183 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Padi4Q9Z183 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Padi4Q9Z183 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Padi4Q9Z183 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Padi4Q9Z183 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Padi4Q9Z183 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Padi4Q9Z183 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Padi4Q9Z183 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Padi4Q9Z183 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Padi4Q9Z183 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Padi4Q9Z183 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Padi4Q9Z183 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Padi4Q9Z183 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Padi4Q9Z183 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Padi4Q9Z183 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Padi4Q9Z183 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Padi4Q9Z183 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Padi4Q9Z183 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Padi4Q9Z183 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Padi4Q9Z183 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Padi4Q9Z183 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Padi4Q9Z183 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Padi4Q9Z183 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Padi4Q9Z183 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Padi4Q9Z183 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Padi4Q9Z183 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Padi4Q9Z183 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Padi4Q9Z183 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms