Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z140

Cpne6, Copine-6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne6Q9Z140 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpne6Q9Z140 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpne6Q9Z140 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpne6Q9Z140 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpne6Q9Z140 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpne6Q9Z140 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpne6Q9Z140 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpne6Q9Z140 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpne6Q9Z140 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpne6Q9Z140 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpne6Q9Z140 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpne6Q9Z140 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpne6Q9Z140 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpne6Q9Z140 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpne6Q9Z140 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpne6Q9Z140 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpne6Q9Z140 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpne6Q9Z140 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpne6Q9Z140 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpne6Q9Z140 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpne6Q9Z140 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpne6Q9Z140 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpne6Q9Z140 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpne6Q9Z140 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpne6Q9Z140 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpne6Q9Z140 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpne6Q9Z140 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpne6Q9Z140 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpne6Q9Z140 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpne6Q9Z140 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpne6Q9Z140 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpne6Q9Z140 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpne6Q9Z140 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpne6Q9Z140 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpne6Q9Z140 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpne6Q9Z140 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpne6Q9Z140 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpne6Q9Z140 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpne6Q9Z140 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpne6Q9Z140 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpne6Q9Z140 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpne6Q9Z140 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpne6Q9Z140 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpne6Q9Z140 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpne6Q9Z140 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpne6Q9Z140 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpne6Q9Z140 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpne6Q9Z140 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpne6Q9Z140 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpne6Q9Z140 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpne6Q9Z140 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpne6Q9Z140 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpne6Q9Z140 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpne6Q9Z140 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpne6Q9Z140 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpne6Q9Z140 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpne6Q9Z140 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpne6Q9Z140 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpne6Q9Z140 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpne6Q9Z140 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpne6Q9Z140 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpne6Q9Z140 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpne6Q9Z140 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpne6Q9Z140 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpne6Q9Z140 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpne6Q9Z140 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpne6Q9Z140 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpne6Q9Z140 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpne6Q9Z140 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpne6Q9Z140 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpne6Q9Z140 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpne6Q9Z140 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpne6Q9Z140 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpne6Q9Z140 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpne6Q9Z140 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpne6Q9Z140 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpne6Q9Z140 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpne6Q9Z140 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpne6Q9Z140 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpne6Q9Z140 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpne6Q9Z140 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpne6Q9Z140 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpne6Q9Z140 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpne6Q9Z140 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpne6Q9Z140 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpne6Q9Z140 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpne6Q9Z140 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpne6Q9Z140 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpne6Q9Z140 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpne6Q9Z140 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpne6Q9Z140 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpne6Q9Z140 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpne6Q9Z140 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpne6Q9Z140 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpne6Q9Z140 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpne6Q9Z140 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpne6Q9Z140 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpne6Q9Z140 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpne6Q9Z140 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cpne6Q9Z140 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms