Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Y1

Dctn3, Dynactin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dctn3Q9Z0Y1 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dctn3Q9Z0Y1 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dctn3Q9Z0Y1 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dctn3Q9Z0Y1 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dctn3Q9Z0Y1 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dctn3Q9Z0Y1 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dctn3Q9Z0Y1 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dctn3Q9Z0Y1 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dctn3Q9Z0Y1 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dctn3Q9Z0Y1 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dctn3Q9Z0Y1 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dctn3Q9Z0Y1 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dctn3Q9Z0Y1 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dctn3Q9Z0Y1 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dctn3Q9Z0Y1 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dctn3Q9Z0Y1 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dctn3Q9Z0Y1 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dctn3Q9Z0Y1 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dctn3Q9Z0Y1 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dctn3Q9Z0Y1 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dctn3Q9Z0Y1 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dctn3Q9Z0Y1 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Dctn3Q9Z0Y1 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Dctn3Q9Z0Y1 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dctn3Q9Z0Y1 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dctn3Q9Z0Y1 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dctn3Q9Z0Y1 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dctn3Q9Z0Y1 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dctn3Q9Z0Y1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dctn3Q9Z0Y1 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dctn3Q9Z0Y1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dctn3Q9Z0Y1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dctn3Q9Z0Y1 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dctn3Q9Z0Y1 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dctn3Q9Z0Y1 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dctn3Q9Z0Y1 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dctn3Q9Z0Y1 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dctn3Q9Z0Y1 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dctn3Q9Z0Y1 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dctn3Q9Z0Y1 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dctn3Q9Z0Y1 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dctn3Q9Z0Y1 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dctn3Q9Z0Y1 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dctn3Q9Z0Y1 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dctn3Q9Z0Y1 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dctn3Q9Z0Y1 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dctn3Q9Z0Y1 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dctn3Q9Z0Y1 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dctn3Q9Z0Y1 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dctn3Q9Z0Y1 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dctn3Q9Z0Y1 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dctn3Q9Z0Y1 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dctn3Q9Z0Y1 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dctn3Q9Z0Y1 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dctn3Q9Z0Y1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dctn3Q9Z0Y1 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dctn3Q9Z0Y1 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dctn3Q9Z0Y1 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dctn3Q9Z0Y1 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dctn3Q9Z0Y1 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dctn3Q9Z0Y1 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dctn3Q9Z0Y1 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dctn3Q9Z0Y1 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dctn3Q9Z0Y1 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dctn3Q9Z0Y1 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dctn3Q9Z0Y1 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dctn3Q9Z0Y1 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dctn3Q9Z0Y1 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dctn3Q9Z0Y1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dctn3Q9Z0Y1 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dctn3Q9Z0Y1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dctn3Q9Z0Y1 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dctn3Q9Z0Y1 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dctn3Q9Z0Y1 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dctn3Q9Z0Y1 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dctn3Q9Z0Y1 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dctn3Q9Z0Y1 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dctn3Q9Z0Y1 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dctn3Q9Z0Y1 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dctn3Q9Z0Y1 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dctn3Q9Z0Y1 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dctn3Q9Z0Y1 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dctn3Q9Z0Y1 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dctn3Q9Z0Y1 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dctn3Q9Z0Y1 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dctn3Q9Z0Y1 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dctn3Q9Z0Y1 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dctn3Q9Z0Y1 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dctn3Q9Z0Y1 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dctn3Q9Z0Y1 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dctn3Q9Z0Y1 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dctn3Q9Z0Y1 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dctn3Q9Z0Y1 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dctn3Q9Z0Y1 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dctn3Q9Z0Y1 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dctn3Q9Z0Y1 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dctn3Q9Z0Y1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dctn3Q9Z0Y1 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dctn3Q9Z0Y1 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dctn3Q9Z0Y1 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms