Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cldn13Q9Z0S4 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cldn13Q9Z0S4 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cldn13Q9Z0S4 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cldn13Q9Z0S4 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn13Q9Z0S4 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn13Q9Z0S4 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn13Q9Z0S4 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn13Q9Z0S4 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn13Q9Z0S4 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
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Cldn13Q9Z0S4 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cldn13Q9Z0S4 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn13Q9Z0S4 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn13Q9Z0S4 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn13Q9Z0S4 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn13Q9Z0S4 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn13Q9Z0S4 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn13Q9Z0S4 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cldn13Q9Z0S4 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn13Q9Z0S4 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Cldn13Q9Z0S4 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn13Q9Z0S4 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn13Q9Z0S4 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Cldn13Q9Z0S4 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn13Q9Z0S4 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn13Q9Z0S4 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn13Q9Z0S4 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn13Q9Z0S4 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn13Q9Z0S4 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn13Q9Z0S4 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn13Q9Z0S4 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Cldn13Q9Z0S4 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Cldn13Q9Z0S4 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn13Q9Z0S4 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn13Q9Z0S4 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn13Q9Z0S4 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn13Q9Z0S4 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Cldn13Q9Z0S4 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cldn13Q9Z0S4 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cldn13Q9Z0S4 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cldn13Q9Z0S4 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
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Cldn13Q9Z0S4 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn13Q9Z0S4 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn13Q9Z0S4 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn13Q9Z0S4 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn13Q9Z0S4 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn13Q9Z0S4 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn13Q9Z0S4 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn13Q9Z0S4 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn13Q9Z0S4 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn13Q9Z0S4 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn13Q9Z0S4 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn13Q9Z0S4 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn13Q9Z0S4 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn13Q9Z0S4 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn13Q9Z0S4 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn13Q9Z0S4 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn13Q9Z0S4 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn13Q9Z0S4 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn13Q9Z0S4 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn13Q9Z0S4 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn13Q9Z0S4 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn13Q9Z0S4 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn13Q9Z0S4 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn13Q9Z0S4 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn13Q9Z0S4 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
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