Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVB4

Slit3, Slit homolog 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slit3Q9WVB4 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slit3Q9WVB4 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slit3Q9WVB4 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slit3Q9WVB4 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slit3Q9WVB4 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Slit3Q9WVB4 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Slit3Q9WVB4 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slit3Q9WVB4 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slit3Q9WVB4 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slit3Q9WVB4 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slit3Q9WVB4 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slit3Q9WVB4 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slit3Q9WVB4 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slit3Q9WVB4 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slit3Q9WVB4 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slit3Q9WVB4 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slit3Q9WVB4 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slit3Q9WVB4 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slit3Q9WVB4 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Slit3Q9WVB4 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Slit3Q9WVB4 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slit3Q9WVB4 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slit3Q9WVB4 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slit3Q9WVB4 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slit3Q9WVB4 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slit3Q9WVB4 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Slit3Q9WVB4 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slit3Q9WVB4 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slit3Q9WVB4 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Slit3Q9WVB4 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Slit3Q9WVB4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slit3Q9WVB4 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Slit3Q9WVB4 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Slit3Q9WVB4 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slit3Q9WVB4 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slit3Q9WVB4 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slit3Q9WVB4 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slit3Q9WVB4 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slit3Q9WVB4 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slit3Q9WVB4 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slit3Q9WVB4 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slit3Q9WVB4 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slit3Q9WVB4 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slit3Q9WVB4 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Slit3Q9WVB4 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Slit3Q9WVB4 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slit3Q9WVB4 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slit3Q9WVB4 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slit3Q9WVB4 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slit3Q9WVB4 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slit3Q9WVB4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slit3Q9WVB4 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slit3Q9WVB4 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slit3Q9WVB4 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slit3Q9WVB4 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Slit3Q9WVB4 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slit3Q9WVB4 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slit3Q9WVB4 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slit3Q9WVB4 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slit3Q9WVB4 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slit3Q9WVB4 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slit3Q9WVB4 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slit3Q9WVB4 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slit3Q9WVB4 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slit3Q9WVB4 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slit3Q9WVB4 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slit3Q9WVB4 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slit3Q9WVB4 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slit3Q9WVB4 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slit3Q9WVB4 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slit3Q9WVB4 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slit3Q9WVB4 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slit3Q9WVB4 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slit3Q9WVB4 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slit3Q9WVB4 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slit3Q9WVB4 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Slit3Q9WVB4 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Slit3Q9WVB4 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slit3Q9WVB4 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slit3Q9WVB4 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slit3Q9WVB4 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slit3Q9WVB4 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slit3Q9WVB4 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slit3Q9WVB4 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slit3Q9WVB4 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slit3Q9WVB4 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slit3Q9WVB4 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slit3Q9WVB4 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slit3Q9WVB4 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slit3Q9WVB4 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Slit3Q9WVB4 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Slit3Q9WVB4 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slit3Q9WVB4 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slit3Q9WVB4 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slit3Q9WVB4 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slit3Q9WVB4 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slit3Q9WVB4 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slit3Q9WVB4 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slit3Q9WVB4 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slit3Q9WVB4 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms