Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV85

Nme3, Nucleoside diphosphate kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme3Q9WV85 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nme3Q9WV85 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nme3Q9WV85 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nme3Q9WV85 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Nme3Q9WV85 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Nme3Q9WV85 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nme3Q9WV85 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nme3Q9WV85 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nme3Q9WV85 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nme3Q9WV85 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Nme3Q9WV85 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nme3Q9WV85 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nme3Q9WV85 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nme3Q9WV85 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nme3Q9WV85 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nme3Q9WV85 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nme3Q9WV85 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nme3Q9WV85 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nme3Q9WV85 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nme3Q9WV85 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nme3Q9WV85 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nme3Q9WV85 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nme3Q9WV85 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nme3Q9WV85 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nme3Q9WV85 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nme3Q9WV85 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nme3Q9WV85 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nme3Q9WV85 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nme3Q9WV85 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Nme3Q9WV85 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nme3Q9WV85 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nme3Q9WV85 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nme3Q9WV85 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nme3Q9WV85 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nme3Q9WV85 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nme3Q9WV85 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nme3Q9WV85 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nme3Q9WV85 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nme3Q9WV85 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nme3Q9WV85 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nme3Q9WV85 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nme3Q9WV85 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nme3Q9WV85 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nme3Q9WV85 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nme3Q9WV85 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nme3Q9WV85 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Nme3Q9WV85 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Nme3Q9WV85 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nme3Q9WV85 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nme3Q9WV85 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nme3Q9WV85 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Nme3Q9WV85 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nme3Q9WV85 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nme3Q9WV85 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nme3Q9WV85 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nme3Q9WV85 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nme3Q9WV85 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nme3Q9WV85 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nme3Q9WV85 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nme3Q9WV85 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nme3Q9WV85 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nme3Q9WV85 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Nme3Q9WV85 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nme3Q9WV85 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nme3Q9WV85 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nme3Q9WV85 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nme3Q9WV85 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nme3Q9WV85 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nme3Q9WV85 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nme3Q9WV85 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nme3Q9WV85 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Nme3Q9WV85 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nme3Q9WV85 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nme3Q9WV85 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nme3Q9WV85 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nme3Q9WV85 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nme3Q9WV85 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nme3Q9WV85 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nme3Q9WV85 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nme3Q9WV85 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nme3Q9WV85 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nme3Q9WV85 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nme3Q9WV85 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nme3Q9WV85 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nme3Q9WV85 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nme3Q9WV85 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nme3Q9WV85 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nme3Q9WV85 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nme3Q9WV85 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nme3Q9WV85 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nme3Q9WV85 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nme3Q9WV85 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nme3Q9WV85 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nme3Q9WV85 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nme3Q9WV85 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nme3Q9WV85 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nme3Q9WV85 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nme3Q9WV85 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nme3Q9WV85 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nme3Q9WV85 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms