Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU72

Tnfsf13b, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13bQ9WU72 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnfsf13bQ9WU72 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnfsf13bQ9WU72 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnfsf13bQ9WU72 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnfsf13bQ9WU72 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnfsf13bQ9WU72 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnfsf13bQ9WU72 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnfsf13bQ9WU72 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnfsf13bQ9WU72 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnfsf13bQ9WU72 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnfsf13bQ9WU72 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnfsf13bQ9WU72 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnfsf13bQ9WU72 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnfsf13bQ9WU72 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnfsf13bQ9WU72 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnfsf13bQ9WU72 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnfsf13bQ9WU72 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnfsf13bQ9WU72 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnfsf13bQ9WU72 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnfsf13bQ9WU72 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnfsf13bQ9WU72 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnfsf13bQ9WU72 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfsf13bQ9WU72 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfsf13bQ9WU72 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfsf13bQ9WU72 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfsf13bQ9WU72 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfsf13bQ9WU72 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfsf13bQ9WU72 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfsf13bQ9WU72 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfsf13bQ9WU72 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfsf13bQ9WU72 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfsf13bQ9WU72 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfsf13bQ9WU72 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfsf13bQ9WU72 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfsf13bQ9WU72 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfsf13bQ9WU72 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfsf13bQ9WU72 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfsf13bQ9WU72 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfsf13bQ9WU72 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfsf13bQ9WU72 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfsf13bQ9WU72 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfsf13bQ9WU72 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfsf13bQ9WU72 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfsf13bQ9WU72 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfsf13bQ9WU72 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfsf13bQ9WU72 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfsf13bQ9WU72 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfsf13bQ9WU72 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfsf13bQ9WU72 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfsf13bQ9WU72 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfsf13bQ9WU72 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfsf13bQ9WU72 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfsf13bQ9WU72 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfsf13bQ9WU72 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfsf13bQ9WU72 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfsf13bQ9WU72 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfsf13bQ9WU72 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfsf13bQ9WU72 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfsf13bQ9WU72 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfsf13bQ9WU72 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfsf13bQ9WU72 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfsf13bQ9WU72 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfsf13bQ9WU72 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfsf13bQ9WU72 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfsf13bQ9WU72 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfsf13bQ9WU72 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfsf13bQ9WU72 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfsf13bQ9WU72 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfsf13bQ9WU72 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfsf13bQ9WU72 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfsf13bQ9WU72 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfsf13bQ9WU72 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfsf13bQ9WU72 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfsf13bQ9WU72 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfsf13bQ9WU72 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfsf13bQ9WU72 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfsf13bQ9WU72 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfsf13bQ9WU72 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfsf13bQ9WU72 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfsf13bQ9WU72 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfsf13bQ9WU72 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfsf13bQ9WU72 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfsf13bQ9WU72 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfsf13bQ9WU72 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfsf13bQ9WU72 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfsf13bQ9WU72 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfsf13bQ9WU72 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfsf13bQ9WU72 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfsf13bQ9WU72 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfsf13bQ9WU72 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfsf13bQ9WU72 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnfsf13bQ9WU72 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnfsf13bQ9WU72 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnfsf13bQ9WU72 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnfsf13bQ9WU72 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnfsf13bQ9WU72 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnfsf13bQ9WU72 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnfsf13bQ9WU72 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms