Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU40

Lemd3, Inner nuclear membrane protein Man1, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lemd3Q9WU40 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lemd3Q9WU40 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lemd3Q9WU40 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Lemd3Q9WU40 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Lemd3Q9WU40 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Lemd3Q9WU40 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lemd3Q9WU40 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lemd3Q9WU40 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Lemd3Q9WU40 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lemd3Q9WU40 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Lemd3Q9WU40 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lemd3Q9WU40 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lemd3Q9WU40 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lemd3Q9WU40 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lemd3Q9WU40 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lemd3Q9WU40 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lemd3Q9WU40 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lemd3Q9WU40 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lemd3Q9WU40 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lemd3Q9WU40 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Lemd3Q9WU40 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lemd3Q9WU40 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Lemd3Q9WU40 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Lemd3Q9WU40 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lemd3Q9WU40 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lemd3Q9WU40 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lemd3Q9WU40 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lemd3Q9WU40 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lemd3Q9WU40 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lemd3Q9WU40 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lemd3Q9WU40 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Lemd3Q9WU40 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lemd3Q9WU40 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lemd3Q9WU40 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lemd3Q9WU40 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Lemd3Q9WU40 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lemd3Q9WU40 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Lemd3Q9WU40 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lemd3Q9WU40 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lemd3Q9WU40 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lemd3Q9WU40 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lemd3Q9WU40 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lemd3Q9WU40 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lemd3Q9WU40 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lemd3Q9WU40 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lemd3Q9WU40 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lemd3Q9WU40 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lemd3Q9WU40 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lemd3Q9WU40 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lemd3Q9WU40 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Lemd3Q9WU40 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lemd3Q9WU40 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lemd3Q9WU40 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Lemd3Q9WU40 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Lemd3Q9WU40 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Lemd3Q9WU40 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lemd3Q9WU40 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Lemd3Q9WU40 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lemd3Q9WU40 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lemd3Q9WU40 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lemd3Q9WU40 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lemd3Q9WU40 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lemd3Q9WU40 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lemd3Q9WU40 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lemd3Q9WU40 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lemd3Q9WU40 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Lemd3Q9WU40 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lemd3Q9WU40 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lemd3Q9WU40 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lemd3Q9WU40 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lemd3Q9WU40 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lemd3Q9WU40 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lemd3Q9WU40 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lemd3Q9WU40 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lemd3Q9WU40 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lemd3Q9WU40 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lemd3Q9WU40 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lemd3Q9WU40 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lemd3Q9WU40 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lemd3Q9WU40 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lemd3Q9WU40 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Lemd3Q9WU40 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lemd3Q9WU40 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lemd3Q9WU40 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lemd3Q9WU40 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lemd3Q9WU40 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lemd3Q9WU40 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lemd3Q9WU40 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lemd3Q9WU40 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lemd3Q9WU40 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lemd3Q9WU40 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Lemd3Q9WU40 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lemd3Q9WU40 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lemd3Q9WU40 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Lemd3Q9WU40 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Lemd3Q9WU40 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Lemd3Q9WU40 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Lemd3Q9WU40 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Lemd3Q9WU40 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lemd3Q9WU40 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms