Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU00

Nrf1, Nuclear respiratory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrf1Q9WU00 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nrf1Q9WU00 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms