Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX5

Skp1, S-phase kinase-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp1Q9WTX5 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms