Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTV6

Usp18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp18Q9WTV6 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp18Q9WTV6 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp18Q9WTV6 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp18Q9WTV6 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp18Q9WTV6 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp18Q9WTV6 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp18Q9WTV6 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp18Q9WTV6 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp18Q9WTV6 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp18Q9WTV6 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp18Q9WTV6 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp18Q9WTV6 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp18Q9WTV6 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp18Q9WTV6 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp18Q9WTV6 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp18Q9WTV6 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp18Q9WTV6 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp18Q9WTV6 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp18Q9WTV6 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp18Q9WTV6 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp18Q9WTV6 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp18Q9WTV6 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp18Q9WTV6 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp18Q9WTV6 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp18Q9WTV6 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp18Q9WTV6 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp18Q9WTV6 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp18Q9WTV6 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp18Q9WTV6 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp18Q9WTV6 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp18Q9WTV6 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp18Q9WTV6 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp18Q9WTV6 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp18Q9WTV6 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp18Q9WTV6 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp18Q9WTV6 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp18Q9WTV6 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp18Q9WTV6 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp18Q9WTV6 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp18Q9WTV6 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp18Q9WTV6 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp18Q9WTV6 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp18Q9WTV6 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp18Q9WTV6 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp18Q9WTV6 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp18Q9WTV6 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp18Q9WTV6 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp18Q9WTV6 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp18Q9WTV6 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp18Q9WTV6 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp18Q9WTV6 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp18Q9WTV6 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp18Q9WTV6 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp18Q9WTV6 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp18Q9WTV6 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp18Q9WTV6 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp18Q9WTV6 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp18Q9WTV6 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp18Q9WTV6 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp18Q9WTV6 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp18Q9WTV6 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp18Q9WTV6 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp18Q9WTV6 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp18Q9WTV6 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp18Q9WTV6 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp18Q9WTV6 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp18Q9WTV6 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp18Q9WTV6 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp18Q9WTV6 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp18Q9WTV6 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp18Q9WTV6 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp18Q9WTV6 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp18Q9WTV6 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp18Q9WTV6 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp18Q9WTV6 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp18Q9WTV6 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp18Q9WTV6 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp18Q9WTV6 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp18Q9WTV6 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp18Q9WTV6 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp18Q9WTV6 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp18Q9WTV6 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp18Q9WTV6 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp18Q9WTV6 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp18Q9WTV6 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp18Q9WTV6 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp18Q9WTV6 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp18Q9WTV6 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp18Q9WTV6 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp18Q9WTV6 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp18Q9WTV6 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp18Q9WTV6 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp18Q9WTV6 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp18Q9WTV6 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp18Q9WTV6 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp18Q9WTV6 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp18Q9WTV6 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp18Q9WTV6 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp18Q9WTV6 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp18Q9WTV6 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms