Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1Y5

Hic1, Hypermethylated in cancer 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 733 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hic1Q9R1Y5 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hic1Q9R1Y5 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hic1Q9R1Y5 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hic1Q9R1Y5 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hic1Q9R1Y5 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hic1Q9R1Y5 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hic1Q9R1Y5 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hic1Q9R1Y5 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hic1Q9R1Y5 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hic1Q9R1Y5 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Hic1Q9R1Y5 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hic1Q9R1Y5 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hic1Q9R1Y5 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hic1Q9R1Y5 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hic1Q9R1Y5 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hic1Q9R1Y5 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hic1Q9R1Y5 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hic1Q9R1Y5 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hic1Q9R1Y5 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hic1Q9R1Y5 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hic1Q9R1Y5 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hic1Q9R1Y5 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hic1Q9R1Y5 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hic1Q9R1Y5 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hic1Q9R1Y5 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hic1Q9R1Y5 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hic1Q9R1Y5 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hic1Q9R1Y5 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hic1Q9R1Y5 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hic1Q9R1Y5 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hic1Q9R1Y5 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hic1Q9R1Y5 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Hic1Q9R1Y5 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hic1Q9R1Y5 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hic1Q9R1Y5 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Hic1Q9R1Y5 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hic1Q9R1Y5 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hic1Q9R1Y5 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hic1Q9R1Y5 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Hic1Q9R1Y5 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hic1Q9R1Y5 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hic1Q9R1Y5 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hic1Q9R1Y5 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hic1Q9R1Y5 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hic1Q9R1Y5 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hic1Q9R1Y5 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hic1Q9R1Y5 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hic1Q9R1Y5 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hic1Q9R1Y5 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hic1Q9R1Y5 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hic1Q9R1Y5 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hic1Q9R1Y5 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hic1Q9R1Y5 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Hic1Q9R1Y5 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hic1Q9R1Y5 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hic1Q9R1Y5 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hic1Q9R1Y5 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hic1Q9R1Y5 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hic1Q9R1Y5 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hic1Q9R1Y5 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hic1Q9R1Y5 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hic1Q9R1Y5 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hic1Q9R1Y5 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hic1Q9R1Y5 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hic1Q9R1Y5 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hic1Q9R1Y5 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hic1Q9R1Y5 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hic1Q9R1Y5 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hic1Q9R1Y5 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hic1Q9R1Y5 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Hic1Q9R1Y5 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Hic1Q9R1Y5 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hic1Q9R1Y5 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hic1Q9R1Y5 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hic1Q9R1Y5 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hic1Q9R1Y5 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hic1Q9R1Y5 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hic1Q9R1Y5 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hic1Q9R1Y5 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hic1Q9R1Y5 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hic1Q9R1Y5 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hic1Q9R1Y5 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hic1Q9R1Y5 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hic1Q9R1Y5 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hic1Q9R1Y5 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hic1Q9R1Y5 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hic1Q9R1Y5 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hic1Q9R1Y5 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hic1Q9R1Y5 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hic1Q9R1Y5 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hic1Q9R1Y5 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hic1Q9R1Y5 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hic1Q9R1Y5 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hic1Q9R1Y5 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hic1Q9R1Y5 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hic1Q9R1Y5 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hic1Q9R1Y5 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hic1Q9R1Y5 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hic1Q9R1Y5 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hic1Q9R1Y5 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms