Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1R2

Trim3, Tripartite motif-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim3Q9R1R2 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim3Q9R1R2 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim3Q9R1R2 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim3Q9R1R2 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim3Q9R1R2 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim3Q9R1R2 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim3Q9R1R2 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim3Q9R1R2 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim3Q9R1R2 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim3Q9R1R2 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim3Q9R1R2 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim3Q9R1R2 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim3Q9R1R2 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim3Q9R1R2 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim3Q9R1R2 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim3Q9R1R2 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim3Q9R1R2 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim3Q9R1R2 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim3Q9R1R2 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim3Q9R1R2 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim3Q9R1R2 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim3Q9R1R2 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim3Q9R1R2 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim3Q9R1R2 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim3Q9R1R2 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim3Q9R1R2 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim3Q9R1R2 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim3Q9R1R2 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim3Q9R1R2 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim3Q9R1R2 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim3Q9R1R2 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim3Q9R1R2 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim3Q9R1R2 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim3Q9R1R2 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim3Q9R1R2 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim3Q9R1R2 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim3Q9R1R2 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim3Q9R1R2 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim3Q9R1R2 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim3Q9R1R2 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim3Q9R1R2 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim3Q9R1R2 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim3Q9R1R2 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim3Q9R1R2 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim3Q9R1R2 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim3Q9R1R2 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim3Q9R1R2 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim3Q9R1R2 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim3Q9R1R2 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim3Q9R1R2 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim3Q9R1R2 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim3Q9R1R2 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim3Q9R1R2 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim3Q9R1R2 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim3Q9R1R2 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim3Q9R1R2 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim3Q9R1R2 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim3Q9R1R2 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim3Q9R1R2 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim3Q9R1R2 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim3Q9R1R2 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim3Q9R1R2 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim3Q9R1R2 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim3Q9R1R2 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim3Q9R1R2 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim3Q9R1R2 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim3Q9R1R2 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim3Q9R1R2 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim3Q9R1R2 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim3Q9R1R2 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim3Q9R1R2 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim3Q9R1R2 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim3Q9R1R2 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim3Q9R1R2 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim3Q9R1R2 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim3Q9R1R2 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim3Q9R1R2 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim3Q9R1R2 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim3Q9R1R2 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim3Q9R1R2 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim3Q9R1R2 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim3Q9R1R2 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim3Q9R1R2 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim3Q9R1R2 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim3Q9R1R2 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim3Q9R1R2 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim3Q9R1R2 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim3Q9R1R2 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim3Q9R1R2 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim3Q9R1R2 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim3Q9R1R2 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim3Q9R1R2 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim3Q9R1R2 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim3Q9R1R2 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim3Q9R1R2 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim3Q9R1R2 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim3Q9R1R2 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim3Q9R1R2 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim3Q9R1R2 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim3Q9R1R2 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms