Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1K7

Tubd1, Tubulin delta chain, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubd1Q9R1K7 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubd1Q9R1K7 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubd1Q9R1K7 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubd1Q9R1K7 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubd1Q9R1K7 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubd1Q9R1K7 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubd1Q9R1K7 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubd1Q9R1K7 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubd1Q9R1K7 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubd1Q9R1K7 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubd1Q9R1K7 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubd1Q9R1K7 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubd1Q9R1K7 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubd1Q9R1K7 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubd1Q9R1K7 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubd1Q9R1K7 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubd1Q9R1K7 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubd1Q9R1K7 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubd1Q9R1K7 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubd1Q9R1K7 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubd1Q9R1K7 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubd1Q9R1K7 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubd1Q9R1K7 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubd1Q9R1K7 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubd1Q9R1K7 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubd1Q9R1K7 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubd1Q9R1K7 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubd1Q9R1K7 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubd1Q9R1K7 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubd1Q9R1K7 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubd1Q9R1K7 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubd1Q9R1K7 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubd1Q9R1K7 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubd1Q9R1K7 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubd1Q9R1K7 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubd1Q9R1K7 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tubd1Q9R1K7 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tubd1Q9R1K7 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tubd1Q9R1K7 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tubd1Q9R1K7 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tubd1Q9R1K7 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tubd1Q9R1K7 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tubd1Q9R1K7 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tubd1Q9R1K7 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tubd1Q9R1K7 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tubd1Q9R1K7 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tubd1Q9R1K7 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tubd1Q9R1K7 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tubd1Q9R1K7 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tubd1Q9R1K7 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tubd1Q9R1K7 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tubd1Q9R1K7 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tubd1Q9R1K7 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tubd1Q9R1K7 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tubd1Q9R1K7 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tubd1Q9R1K7 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tubd1Q9R1K7 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tubd1Q9R1K7 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tubd1Q9R1K7 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tubd1Q9R1K7 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tubd1Q9R1K7 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tubd1Q9R1K7 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tubd1Q9R1K7 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tubd1Q9R1K7 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tubd1Q9R1K7 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tubd1Q9R1K7 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tubd1Q9R1K7 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tubd1Q9R1K7 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Tubd1Q9R1K7 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tubd1Q9R1K7 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Tubd1Q9R1K7 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tubd1Q9R1K7 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tubd1Q9R1K7 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tubd1Q9R1K7 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tubd1Q9R1K7 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tubd1Q9R1K7 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tubd1Q9R1K7 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tubd1Q9R1K7 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tubd1Q9R1K7 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tubd1Q9R1K7 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tubd1Q9R1K7 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tubd1Q9R1K7 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tubd1Q9R1K7 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tubd1Q9R1K7 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tubd1Q9R1K7 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tubd1Q9R1K7 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tubd1Q9R1K7 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tubd1Q9R1K7 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tubd1Q9R1K7 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tubd1Q9R1K7 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tubd1Q9R1K7 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tubd1Q9R1K7 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tubd1Q9R1K7 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Tubd1Q9R1K7 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tubd1Q9R1K7 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Tubd1Q9R1K7 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tubd1Q9R1K7 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tubd1Q9R1K7 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tubd1Q9R1K7 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tubd1Q9R1K7 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms