Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Y8

Gabrg1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrg1Q9R0Y8 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gabrg1Q9R0Y8 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabrg1Q9R0Y8 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabrg1Q9R0Y8 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabrg1Q9R0Y8 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabrg1Q9R0Y8 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabrg1Q9R0Y8 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabrg1Q9R0Y8 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabrg1Q9R0Y8 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabrg1Q9R0Y8 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabrg1Q9R0Y8 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabrg1Q9R0Y8 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabrg1Q9R0Y8 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabrg1Q9R0Y8 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabrg1Q9R0Y8 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabrg1Q9R0Y8 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabrg1Q9R0Y8 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabrg1Q9R0Y8 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabrg1Q9R0Y8 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabrg1Q9R0Y8 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabrg1Q9R0Y8 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabrg1Q9R0Y8 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabrg1Q9R0Y8 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabrg1Q9R0Y8 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabrg1Q9R0Y8 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabrg1Q9R0Y8 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabrg1Q9R0Y8 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabrg1Q9R0Y8 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabrg1Q9R0Y8 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabrg1Q9R0Y8 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabrg1Q9R0Y8 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabrg1Q9R0Y8 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabrg1Q9R0Y8 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabrg1Q9R0Y8 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabrg1Q9R0Y8 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabrg1Q9R0Y8 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabrg1Q9R0Y8 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabrg1Q9R0Y8 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabrg1Q9R0Y8 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabrg1Q9R0Y8 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabrg1Q9R0Y8 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabrg1Q9R0Y8 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabrg1Q9R0Y8 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabrg1Q9R0Y8 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabrg1Q9R0Y8 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabrg1Q9R0Y8 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabrg1Q9R0Y8 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms