Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0M3

Srpx, Sushi-repeat-containing protein SRPX, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpxQ9R0M3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SrpxQ9R0M3 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SrpxQ9R0M3 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SrpxQ9R0M3 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SrpxQ9R0M3 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SrpxQ9R0M3 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SrpxQ9R0M3 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SrpxQ9R0M3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
SrpxQ9R0M3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SrpxQ9R0M3 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SrpxQ9R0M3 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SrpxQ9R0M3 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SrpxQ9R0M3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SrpxQ9R0M3 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SrpxQ9R0M3 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SrpxQ9R0M3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms