Protein–RNA interactions for Protein: Q9R014

Ctsj, Cathepsin J, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsjQ9R014 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtsjQ9R014 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtsjQ9R014 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtsjQ9R014 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtsjQ9R014 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtsjQ9R014 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtsjQ9R014 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtsjQ9R014 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtsjQ9R014 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtsjQ9R014 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtsjQ9R014 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtsjQ9R014 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtsjQ9R014 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtsjQ9R014 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtsjQ9R014 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtsjQ9R014 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CtsjQ9R014 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CtsjQ9R014 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtsjQ9R014 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtsjQ9R014 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CtsjQ9R014 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtsjQ9R014 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtsjQ9R014 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtsjQ9R014 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtsjQ9R014 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtsjQ9R014 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtsjQ9R014 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtsjQ9R014 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtsjQ9R014 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtsjQ9R014 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtsjQ9R014 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtsjQ9R014 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtsjQ9R014 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtsjQ9R014 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CtsjQ9R014 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtsjQ9R014 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtsjQ9R014 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtsjQ9R014 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtsjQ9R014 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtsjQ9R014 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtsjQ9R014 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtsjQ9R014 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtsjQ9R014 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtsjQ9R014 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtsjQ9R014 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CtsjQ9R014 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtsjQ9R014 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtsjQ9R014 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtsjQ9R014 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtsjQ9R014 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtsjQ9R014 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtsjQ9R014 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CtsjQ9R014 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CtsjQ9R014 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CtsjQ9R014 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CtsjQ9R014 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CtsjQ9R014 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
CtsjQ9R014 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CtsjQ9R014 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CtsjQ9R014 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CtsjQ9R014 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CtsjQ9R014 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CtsjQ9R014 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtsjQ9R014 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtsjQ9R014 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtsjQ9R014 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CtsjQ9R014 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtsjQ9R014 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CtsjQ9R014 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtsjQ9R014 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtsjQ9R014 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtsjQ9R014 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtsjQ9R014 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CtsjQ9R014 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtsjQ9R014 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtsjQ9R014 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtsjQ9R014 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtsjQ9R014 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtsjQ9R014 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtsjQ9R014 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtsjQ9R014 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtsjQ9R014 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtsjQ9R014 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtsjQ9R014 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtsjQ9R014 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtsjQ9R014 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtsjQ9R014 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtsjQ9R014 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CtsjQ9R014 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtsjQ9R014 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtsjQ9R014 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtsjQ9R014 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtsjQ9R014 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtsjQ9R014 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtsjQ9R014 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtsjQ9R014 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtsjQ9R014 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtsjQ9R014 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtsjQ9R014 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtsjQ9R014 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms