Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ0

Npas3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas3Q9QZQ0 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Npas3Q9QZQ0 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Npas3Q9QZQ0 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Npas3Q9QZQ0 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Npas3Q9QZQ0 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Npas3Q9QZQ0 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Npas3Q9QZQ0 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Npas3Q9QZQ0 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Npas3Q9QZQ0 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Npas3Q9QZQ0 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Npas3Q9QZQ0 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Npas3Q9QZQ0 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Npas3Q9QZQ0 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Npas3Q9QZQ0 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Npas3Q9QZQ0 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Npas3Q9QZQ0 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Npas3Q9QZQ0 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Npas3Q9QZQ0 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Npas3Q9QZQ0 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Npas3Q9QZQ0 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Npas3Q9QZQ0 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Npas3Q9QZQ0 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Npas3Q9QZQ0 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Npas3Q9QZQ0 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Npas3Q9QZQ0 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Npas3Q9QZQ0 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Npas3Q9QZQ0 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Npas3Q9QZQ0 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Npas3Q9QZQ0 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Npas3Q9QZQ0 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Npas3Q9QZQ0 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Npas3Q9QZQ0 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Npas3Q9QZQ0 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Npas3Q9QZQ0 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Npas3Q9QZQ0 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Npas3Q9QZQ0 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Npas3Q9QZQ0 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Npas3Q9QZQ0 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Npas3Q9QZQ0 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Npas3Q9QZQ0 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Npas3Q9QZQ0 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Npas3Q9QZQ0 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Npas3Q9QZQ0 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Npas3Q9QZQ0 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Npas3Q9QZQ0 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Npas3Q9QZQ0 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Npas3Q9QZQ0 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Npas3Q9QZQ0 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Npas3Q9QZQ0 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Npas3Q9QZQ0 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Npas3Q9QZQ0 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Npas3Q9QZQ0 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Npas3Q9QZQ0 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Npas3Q9QZQ0 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Npas3Q9QZQ0 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Npas3Q9QZQ0 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Npas3Q9QZQ0 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Npas3Q9QZQ0 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Npas3Q9QZQ0 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Npas3Q9QZQ0 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Npas3Q9QZQ0 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Npas3Q9QZQ0 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Npas3Q9QZQ0 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Npas3Q9QZQ0 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Npas3Q9QZQ0 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Npas3Q9QZQ0 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Npas3Q9QZQ0 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Npas3Q9QZQ0 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Npas3Q9QZQ0 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Npas3Q9QZQ0 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Npas3Q9QZQ0 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Npas3Q9QZQ0 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Npas3Q9QZQ0 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Npas3Q9QZQ0 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Npas3Q9QZQ0 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Npas3Q9QZQ0 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Npas3Q9QZQ0 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Npas3Q9QZQ0 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Npas3Q9QZQ0 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Npas3Q9QZQ0 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Npas3Q9QZQ0 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Npas3Q9QZQ0 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Npas3Q9QZQ0 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Npas3Q9QZQ0 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Npas3Q9QZQ0 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Npas3Q9QZQ0 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Npas3Q9QZQ0 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Npas3Q9QZQ0 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Npas3Q9QZQ0 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Npas3Q9QZQ0 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Npas3Q9QZQ0 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Npas3Q9QZQ0 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Npas3Q9QZQ0 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Npas3Q9QZQ0 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Npas3Q9QZQ0 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Npas3Q9QZQ0 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Npas3Q9QZQ0 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Npas3Q9QZQ0 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Npas3Q9QZQ0 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Npas3Q9QZQ0 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms