Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL0

Ripk3, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk3Q9QZL0 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ripk3Q9QZL0 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ripk3Q9QZL0 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ripk3Q9QZL0 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ripk3Q9QZL0 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ripk3Q9QZL0 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ripk3Q9QZL0 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ripk3Q9QZL0 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ripk3Q9QZL0 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ripk3Q9QZL0 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ripk3Q9QZL0 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ripk3Q9QZL0 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ripk3Q9QZL0 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ripk3Q9QZL0 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ripk3Q9QZL0 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ripk3Q9QZL0 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ripk3Q9QZL0 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ripk3Q9QZL0 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ripk3Q9QZL0 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ripk3Q9QZL0 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ripk3Q9QZL0 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ripk3Q9QZL0 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ripk3Q9QZL0 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ripk3Q9QZL0 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ripk3Q9QZL0 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ripk3Q9QZL0 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ripk3Q9QZL0 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ripk3Q9QZL0 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ripk3Q9QZL0 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ripk3Q9QZL0 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ripk3Q9QZL0 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ripk3Q9QZL0 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ripk3Q9QZL0 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ripk3Q9QZL0 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ripk3Q9QZL0 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ripk3Q9QZL0 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ripk3Q9QZL0 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ripk3Q9QZL0 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ripk3Q9QZL0 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ripk3Q9QZL0 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ripk3Q9QZL0 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ripk3Q9QZL0 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ripk3Q9QZL0 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ripk3Q9QZL0 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ripk3Q9QZL0 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ripk3Q9QZL0 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ripk3Q9QZL0 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ripk3Q9QZL0 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ripk3Q9QZL0 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ripk3Q9QZL0 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ripk3Q9QZL0 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ripk3Q9QZL0 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ripk3Q9QZL0 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ripk3Q9QZL0 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ripk3Q9QZL0 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ripk3Q9QZL0 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ripk3Q9QZL0 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ripk3Q9QZL0 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ripk3Q9QZL0 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ripk3Q9QZL0 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ripk3Q9QZL0 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ripk3Q9QZL0 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ripk3Q9QZL0 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ripk3Q9QZL0 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ripk3Q9QZL0 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ripk3Q9QZL0 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ripk3Q9QZL0 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ripk3Q9QZL0 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ripk3Q9QZL0 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ripk3Q9QZL0 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ripk3Q9QZL0 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ripk3Q9QZL0 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ripk3Q9QZL0 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ripk3Q9QZL0 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ripk3Q9QZL0 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ripk3Q9QZL0 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ripk3Q9QZL0 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ripk3Q9QZL0 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ripk3Q9QZL0 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ripk3Q9QZL0 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ripk3Q9QZL0 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ripk3Q9QZL0 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ripk3Q9QZL0 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ripk3Q9QZL0 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ripk3Q9QZL0 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ripk3Q9QZL0 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ripk3Q9QZL0 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ripk3Q9QZL0 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ripk3Q9QZL0 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ripk3Q9QZL0 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ripk3Q9QZL0 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ripk3Q9QZL0 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ripk3Q9QZL0 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ripk3Q9QZL0 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ripk3Q9QZL0 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ripk3Q9QZL0 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ripk3Q9QZL0 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ripk3Q9QZL0 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ripk3Q9QZL0 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ripk3Q9QZL0 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms