Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ercc4Q9QZD4 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ercc4Q9QZD4 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ercc4Q9QZD4 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ercc4Q9QZD4 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ercc4Q9QZD4 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ercc4Q9QZD4 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ercc4Q9QZD4 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ercc4Q9QZD4 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ercc4Q9QZD4 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ercc4Q9QZD4 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ercc4Q9QZD4 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ercc4Q9QZD4 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ercc4Q9QZD4 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ercc4Q9QZD4 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ercc4Q9QZD4 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ercc4Q9QZD4 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ercc4Q9QZD4 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ercc4Q9QZD4 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ercc4Q9QZD4 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ercc4Q9QZD4 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ercc4Q9QZD4 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ercc4Q9QZD4 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ercc4Q9QZD4 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ercc4Q9QZD4 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ercc4Q9QZD4 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ercc4Q9QZD4 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ercc4Q9QZD4 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ercc4Q9QZD4 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ercc4Q9QZD4 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ercc4Q9QZD4 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ercc4Q9QZD4 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ercc4Q9QZD4 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ercc4Q9QZD4 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ercc4Q9QZD4 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ercc4Q9QZD4 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ercc4Q9QZD4 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ercc4Q9QZD4 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ercc4Q9QZD4 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ercc4Q9QZD4 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ercc4Q9QZD4 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ercc4Q9QZD4 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ercc4Q9QZD4 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ercc4Q9QZD4 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ercc4Q9QZD4 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ercc4Q9QZD4 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ercc4Q9QZD4 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ercc4Q9QZD4 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ercc4Q9QZD4 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ercc4Q9QZD4 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ercc4Q9QZD4 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ercc4Q9QZD4 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ercc4Q9QZD4 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ercc4Q9QZD4 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ercc4Q9QZD4 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ercc4Q9QZD4 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ercc4Q9QZD4 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ercc4Q9QZD4 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ercc4Q9QZD4 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ercc4Q9QZD4 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ercc4Q9QZD4 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ercc4Q9QZD4 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ercc4Q9QZD4 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ercc4Q9QZD4 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ercc4Q9QZD4 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ercc4Q9QZD4 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ercc4Q9QZD4 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ercc4Q9QZD4 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ercc4Q9QZD4 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ercc4Q9QZD4 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ercc4Q9QZD4 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ercc4Q9QZD4 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ercc4Q9QZD4 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ercc4Q9QZD4 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ercc4Q9QZD4 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ercc4Q9QZD4 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ercc4Q9QZD4 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ercc4Q9QZD4 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ercc4Q9QZD4 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ercc4Q9QZD4 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ercc4Q9QZD4 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Ercc4Q9QZD4 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ercc4Q9QZD4 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ercc4Q9QZD4 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ercc4Q9QZD4 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ercc4Q9QZD4 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ercc4Q9QZD4 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ercc4Q9QZD4 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ercc4Q9QZD4 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ercc4Q9QZD4 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ercc4Q9QZD4 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ercc4Q9QZD4 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ercc4Q9QZD4 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ercc4Q9QZD4 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ercc4Q9QZD4 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ercc4Q9QZD4 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ercc4Q9QZD4 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ercc4Q9QZD4 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ercc4Q9QZD4 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ercc4Q9QZD4 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms