Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ubxn8Q9QZ49 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ubxn8Q9QZ49 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ubxn8Q9QZ49 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Ubxn8Q9QZ49 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ubxn8Q9QZ49 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ubxn8Q9QZ49 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ubxn8Q9QZ49 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ubxn8Q9QZ49 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ubxn8Q9QZ49 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ubxn8Q9QZ49 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Ubxn8Q9QZ49 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ubxn8Q9QZ49 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ubxn8Q9QZ49 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Ubxn8Q9QZ49 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ubxn8Q9QZ49 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ubxn8Q9QZ49 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ubxn8Q9QZ49 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ubxn8Q9QZ49 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ubxn8Q9QZ49 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ubxn8Q9QZ49 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ubxn8Q9QZ49 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ubxn8Q9QZ49 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ubxn8Q9QZ49 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ubxn8Q9QZ49 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ubxn8Q9QZ49 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ubxn8Q9QZ49 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ubxn8Q9QZ49 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ubxn8Q9QZ49 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ubxn8Q9QZ49 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ubxn8Q9QZ49 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ubxn8Q9QZ49 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ubxn8Q9QZ49 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ubxn8Q9QZ49 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ubxn8Q9QZ49 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ubxn8Q9QZ49 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ubxn8Q9QZ49 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ubxn8Q9QZ49 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ubxn8Q9QZ49 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ubxn8Q9QZ49 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ubxn8Q9QZ49 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ubxn8Q9QZ49 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ubxn8Q9QZ49 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ubxn8Q9QZ49 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ubxn8Q9QZ49 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ubxn8Q9QZ49 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ubxn8Q9QZ49 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ubxn8Q9QZ49 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ubxn8Q9QZ49 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ubxn8Q9QZ49 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ubxn8Q9QZ49 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ubxn8Q9QZ49 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ubxn8Q9QZ49 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ubxn8Q9QZ49 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ubxn8Q9QZ49 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ubxn8Q9QZ49 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ubxn8Q9QZ49 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ubxn8Q9QZ49 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ubxn8Q9QZ49 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ubxn8Q9QZ49 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ubxn8Q9QZ49 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ubxn8Q9QZ49 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ubxn8Q9QZ49 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ubxn8Q9QZ49 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ubxn8Q9QZ49 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ubxn8Q9QZ49 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ubxn8Q9QZ49 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ubxn8Q9QZ49 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ubxn8Q9QZ49 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ubxn8Q9QZ49 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Ubxn8Q9QZ49 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Ubxn8Q9QZ49 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ubxn8Q9QZ49 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ubxn8Q9QZ49 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ubxn8Q9QZ49 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ubxn8Q9QZ49 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ubxn8Q9QZ49 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ubxn8Q9QZ49 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ubxn8Q9QZ49 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ubxn8Q9QZ49 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ubxn8Q9QZ49 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ubxn8Q9QZ49 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ubxn8Q9QZ49 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ubxn8Q9QZ49 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ubxn8Q9QZ49 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ubxn8Q9QZ49 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ubxn8Q9QZ49 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ubxn8Q9QZ49 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ubxn8Q9QZ49 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ubxn8Q9QZ49 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ubxn8Q9QZ49 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ubxn8Q9QZ49 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ubxn8Q9QZ49 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ubxn8Q9QZ49 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ubxn8Q9QZ49 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ubxn8Q9QZ49 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ubxn8Q9QZ49 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ubxn8Q9QZ49 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ubxn8Q9QZ49 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ubxn8Q9QZ49 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms