Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnnt3Q9QZ47 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnnt3Q9QZ47 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnnt3Q9QZ47 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnnt3Q9QZ47 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnnt3Q9QZ47 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnnt3Q9QZ47 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnnt3Q9QZ47 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnnt3Q9QZ47 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnnt3Q9QZ47 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnnt3Q9QZ47 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnnt3Q9QZ47 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnnt3Q9QZ47 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnnt3Q9QZ47 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnnt3Q9QZ47 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnnt3Q9QZ47 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnnt3Q9QZ47 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnnt3Q9QZ47 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnnt3Q9QZ47 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnnt3Q9QZ47 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnnt3Q9QZ47 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnnt3Q9QZ47 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnnt3Q9QZ47 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnnt3Q9QZ47 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnnt3Q9QZ47 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnnt3Q9QZ47 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnnt3Q9QZ47 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnnt3Q9QZ47 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnnt3Q9QZ47 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnnt3Q9QZ47 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnnt3Q9QZ47 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnnt3Q9QZ47 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnnt3Q9QZ47 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnnt3Q9QZ47 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnnt3Q9QZ47 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnnt3Q9QZ47 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnnt3Q9QZ47 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnnt3Q9QZ47 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnnt3Q9QZ47 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnnt3Q9QZ47 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnnt3Q9QZ47 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnnt3Q9QZ47 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnnt3Q9QZ47 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnnt3Q9QZ47 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnnt3Q9QZ47 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnnt3Q9QZ47 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnnt3Q9QZ47 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnnt3Q9QZ47 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnnt3Q9QZ47 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnnt3Q9QZ47 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnnt3Q9QZ47 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnnt3Q9QZ47 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnnt3Q9QZ47 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnnt3Q9QZ47 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnnt3Q9QZ47 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnnt3Q9QZ47 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnnt3Q9QZ47 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnnt3Q9QZ47 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnnt3Q9QZ47 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnnt3Q9QZ47 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnnt3Q9QZ47 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnnt3Q9QZ47 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnnt3Q9QZ47 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnnt3Q9QZ47 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnnt3Q9QZ47 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnnt3Q9QZ47 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnnt3Q9QZ47 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnnt3Q9QZ47 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnnt3Q9QZ47 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnnt3Q9QZ47 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnnt3Q9QZ47 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnnt3Q9QZ47 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnnt3Q9QZ47 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnnt3Q9QZ47 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnnt3Q9QZ47 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnnt3Q9QZ47 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnnt3Q9QZ47 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnnt3Q9QZ47 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnnt3Q9QZ47 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnnt3Q9QZ47 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnnt3Q9QZ47 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnnt3Q9QZ47 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tnnt3Q9QZ47 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tnnt3Q9QZ47 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tnnt3Q9QZ47 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tnnt3Q9QZ47 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnnt3Q9QZ47 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnnt3Q9QZ47 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnnt3Q9QZ47 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnnt3Q9QZ47 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnnt3Q9QZ47 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnnt3Q9QZ47 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnnt3Q9QZ47 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnnt3Q9QZ47 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnnt3Q9QZ47 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnnt3Q9QZ47 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnnt3Q9QZ47 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnnt3Q9QZ47 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnnt3Q9QZ47 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnnt3Q9QZ47 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms