Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYL7

Abt1, Activator of basal transcription 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abt1Q9QYL7 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abt1Q9QYL7 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abt1Q9QYL7 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abt1Q9QYL7 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abt1Q9QYL7 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abt1Q9QYL7 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abt1Q9QYL7 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abt1Q9QYL7 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abt1Q9QYL7 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abt1Q9QYL7 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abt1Q9QYL7 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abt1Q9QYL7 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abt1Q9QYL7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abt1Q9QYL7 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abt1Q9QYL7 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abt1Q9QYL7 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abt1Q9QYL7 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abt1Q9QYL7 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abt1Q9QYL7 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abt1Q9QYL7 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abt1Q9QYL7 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abt1Q9QYL7 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Abt1Q9QYL7 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abt1Q9QYL7 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abt1Q9QYL7 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abt1Q9QYL7 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abt1Q9QYL7 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abt1Q9QYL7 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abt1Q9QYL7 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abt1Q9QYL7 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abt1Q9QYL7 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abt1Q9QYL7 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abt1Q9QYL7 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abt1Q9QYL7 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abt1Q9QYL7 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Abt1Q9QYL7 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abt1Q9QYL7 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abt1Q9QYL7 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abt1Q9QYL7 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abt1Q9QYL7 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abt1Q9QYL7 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abt1Q9QYL7 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abt1Q9QYL7 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abt1Q9QYL7 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abt1Q9QYL7 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abt1Q9QYL7 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abt1Q9QYL7 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abt1Q9QYL7 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Abt1Q9QYL7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Abt1Q9QYL7 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Abt1Q9QYL7 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Abt1Q9QYL7 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Abt1Q9QYL7 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Abt1Q9QYL7 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Abt1Q9QYL7 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Abt1Q9QYL7 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Abt1Q9QYL7 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Abt1Q9QYL7 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Abt1Q9QYL7 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Abt1Q9QYL7 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Abt1Q9QYL7 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Abt1Q9QYL7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Abt1Q9QYL7 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Abt1Q9QYL7 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Abt1Q9QYL7 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Abt1Q9QYL7 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Abt1Q9QYL7 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Abt1Q9QYL7 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Abt1Q9QYL7 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Abt1Q9QYL7 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abt1Q9QYL7 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abt1Q9QYL7 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abt1Q9QYL7 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abt1Q9QYL7 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abt1Q9QYL7 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abt1Q9QYL7 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abt1Q9QYL7 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abt1Q9QYL7 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abt1Q9QYL7 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abt1Q9QYL7 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Abt1Q9QYL7 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abt1Q9QYL7 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abt1Q9QYL7 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abt1Q9QYL7 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abt1Q9QYL7 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abt1Q9QYL7 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abt1Q9QYL7 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abt1Q9QYL7 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Abt1Q9QYL7 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abt1Q9QYL7 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abt1Q9QYL7 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abt1Q9QYL7 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abt1Q9QYL7 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abt1Q9QYL7 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abt1Q9QYL7 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abt1Q9QYL7 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abt1Q9QYL7 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abt1Q9QYL7 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abt1Q9QYL7 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abt1Q9QYL7 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms